MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017807	AAC	2	6	25855	25860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844980
502	NC_017807	GCG	2	6	25931	25936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
503	NC_017807	CAC	2	6	25976	25981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844980
504	NC_017807	CAG	2	6	25994	25999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
505	NC_017807	TGA	2	6	26092	26097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
506	NC_017807	GA	4	8	26117	26124	50 %	0 %	50 %	0 %	386844980
507	NC_017807	GGT	2	6	26138	26143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844980
508	NC_017807	CAG	2	6	26178	26183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
509	NC_017807	GGAG	2	8	26206	26213	25 %	0 %	75 %	0 %	386844980
510	NC_017807	GGC	2	6	26233	26238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
511	NC_017807	CAG	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
512	NC_017807	AAAC	2	8	26402	26409	75 %	0 %	0 %	25 %	386844980
513	NC_017807	A	6	6	26433	26438	100 %	0 %	0 %	0 %	386844980
514	NC_017807	AGA	2	6	26473	26478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844980
515	NC_017807	CTT	2	6	26490	26495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844980
516	NC_017807	AT	3	6	26523	26528	50 %	50 %	0 %	0 %	386844981
517	NC_017807	ATT	2	6	26622	26627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844981
518	NC_017807	TTAT	2	8	26638	26645	25 %	75 %	0 %	0 %	386844981
519	NC_017807	GTT	2	6	26649	26654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
520	NC_017807	T	6	6	26662	26667	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
521	NC_017807	T	6	6	26696	26701	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
522	NC_017807	GGA	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844981
523	NC_017807	TCT	2	6	26742	26747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844981
524	NC_017807	GATG	2	8	26752	26759	25 %	25 %	50 %	0 %	386844981
525	NC_017807	TTG	2	6	26762	26767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
526	NC_017807	GTT	2	6	26779	26784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
527	NC_017807	T	7	7	26794	26800	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
528	NC_017807	TAA	2	6	26822	26827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844981
529	NC_017807	AAAG	2	8	26883	26890	75 %	0 %	25 %	0 %	386844981
530	NC_017807	T	6	6	27001	27006	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
531	NC_017807	A	6	6	27065	27070	100 %	0 %	0 %	0 %	386844981
532	NC_017807	CAGC	2	8	27072	27079	25 %	0 %	25 %	50 %	386844981
533	NC_017807	GGC	2	6	27247	27252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844982
534	NC_017807	GTC	2	6	27257	27262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844982
535	NC_017807	A	6	6	27308	27313	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
536	NC_017807	A	6	6	27372	27377	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
537	NC_017807	ACGTC	2	10	27468	27477	20 %	20 %	20 %	40 %	386844982
538	NC_017807	TGC	2	6	27580	27585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844982
539	NC_017807	GGC	2	6	27682	27687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844982
540	NC_017807	TGG	2	6	27696	27701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844982
541	NC_017807	ACTA	2	8	27707	27714	50 %	25 %	0 %	25 %	386844982
542	NC_017807	GCA	2	6	27747	27752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844982
543	NC_017807	ACA	2	6	27764	27769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844982
544	NC_017807	CGC	2	6	27778	27783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844982
545	NC_017807	CAG	2	6	27820	27825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844982
546	NC_017807	GAA	2	6	27827	27832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844982
547	NC_017807	CG	3	6	27855	27860	0 %	0 %	50 %	50 %	386844982
548	NC_017807	CAA	2	6	27874	27879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844982
549	NC_017807	CTG	2	6	28272	28277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
550	NC_017807	TCA	2	6	28282	28287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844983
551	NC_017807	TGC	2	6	28345	28350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
552	NC_017807	CTG	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
553	NC_017807	ATG	2	6	28377	28382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844983
554	NC_017807	GGTG	2	8	28394	28401	0 %	25 %	75 %	0 %	386844983
555	NC_017807	GTC	2	6	28409	28414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
556	NC_017807	CGT	3	9	28501	28509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
557	NC_017807	G	6	6	28653	28658	0 %	0 %	100 %	0 %	386844984
558	NC_017807	TGT	2	6	28727	28732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844984
559	NC_017807	CCG	2	6	28772	28777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844984
560	NC_017807	TGA	2	6	28838	28843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844984
561	NC_017807	CAC	2	6	28905	28910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844984
562	NC_017807	GCT	2	6	28929	28934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
563	NC_017807	GGC	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
564	NC_017807	GCC	2	6	28993	28998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844984
565	NC_017807	GT	3	6	29011	29016	0 %	50 %	50 %	0 %	386844984
566	NC_017807	TGC	2	6	29018	29023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
567	NC_017807	A	7	7	29061	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
568	NC_017807	TC	3	6	29085	29090	0 %	50 %	0 %	50 %	386844984
569	NC_017807	CGG	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
570	NC_017807	GAA	2	6	29187	29192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844984
571	NC_017807	G	6	6	29282	29287	0 %	0 %	100 %	0 %	386844984
572	NC_017807	CGG	2	6	29310	29315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
573	NC_017807	GCA	2	6	29543	29548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844984
574	NC_017807	TTG	2	6	29569	29574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844984
575	NC_017807	A	6	6	29639	29644	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
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578	NC_017807	CAA	2	6	29798	29803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844984
579	NC_017807	CCGA	2	8	29891	29898	25 %	0 %	25 %	50 %	386844984
580	NC_017807	GTC	2	6	29911	29916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
581	NC_017807	A	6	6	29936	29941	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
582	NC_017807	GTT	2	6	29987	29992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844984
583	NC_017807	CTG	2	6	30067	30072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
584	NC_017807	GCC	2	6	30146	30151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844984
585	NC_017807	GGT	2	6	30234	30239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844984
586	NC_017807	AGA	2	6	30338	30343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844984
587	NC_017807	TCA	2	6	30407	30412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844984
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589	NC_017807	CGA	2	6	30462	30467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844984
590	NC_017807	AAT	2	6	30502	30507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844984
591	NC_017807	GTCA	2	8	30512	30519	25 %	25 %	25 %	25 %	386844984
592	NC_017807	CGG	2	6	30527	30532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
593	NC_017807	ACA	2	6	30651	30656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844984
594	NC_017807	TCC	2	6	30738	30743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386844984
595	NC_017807	CGG	2	6	30746	30751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
596	NC_017807	AC	3	6	30791	30796	50 %	0 %	0 %	50 %	386844984
597	NC_017807	AACCTG	2	12	30803	30814	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386844984
598	NC_017807	CA	3	6	30866	30871	50 %	0 %	0 %	50 %	386844984
599	NC_017807	ACCC	2	8	30890	30897	25 %	0 %	0 %	75 %	386844984
600	NC_017807	TGC	2	6	30909	30914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
601	NC_017807	CAA	2	6	30915	30920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844984
602	NC_017807	GGCC	2	8	30933	30940	0 %	0 %	50 %	50 %	386844984
603	NC_017807	GC	3	6	30944	30949	0 %	0 %	50 %	50 %	386844984
604	NC_017807	CG	3	6	31165	31170	0 %	0 %	50 %	50 %	386844984
605	NC_017807	GAG	2	6	31177	31182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844984
606	NC_017807	GAACA	2	10	31183	31192	60 %	0 %	20 %	20 %	386844984
607	NC_017807	GAT	2	6	31207	31212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844984
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609	NC_017807	CTG	2	6	31291	31296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844985
610	NC_017807	CGG	2	6	31303	31308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844985
611	NC_017807	CAG	2	6	31316	31321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844985
612	NC_017807	ACT	2	6	31330	31335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844985
613	NC_017807	GAT	2	6	31344	31349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844985
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615	NC_017807	CGG	2	6	31553	31558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844985
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617	NC_017807	CAT	2	6	31610	31615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844985
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620	NC_017807	CGG	2	6	31919	31924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844985
621	NC_017807	GGA	2	6	31970	31975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844985
622	NC_017807	CGC	2	6	32000	32005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844985
623	NC_017807	GCAC	2	8	32118	32125	25 %	0 %	25 %	50 %	386844985
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627	NC_017807	CGG	2	6	32449	32454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844985
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