MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017773	ATA	2	6	61953	61958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845058
1002	NC_017773	ACCA	2	8	62095	62102	50 %	0 %	0 %	50 %	386845058
1003	NC_017773	AGA	2	6	62243	62248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845058
1004	NC_017773	CAA	2	6	62302	62307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845058
1005	NC_017773	AGCA	2	8	62348	62355	50 %	0 %	25 %	25 %	386845058
1006	NC_017773	A	6	6	62371	62376	100 %	0 %	0 %	0 %	386845058
1007	NC_017773	GCT	2	6	62520	62525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845059
1008	NC_017773	TTA	3	9	62526	62534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845059
1009	NC_017773	A	6	6	62539	62544	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
1010	NC_017773	TG	3	6	62583	62588	0 %	50 %	50 %	0 %	386845059
1011	NC_017773	A	6	6	62651	62656	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
1012	NC_017773	CTTTAC	2	12	62662	62673	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386845059
1013	NC_017773	TTA	2	6	62676	62681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845059
1014	NC_017773	CAC	2	6	62779	62784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845059
1015	NC_017773	GAT	2	6	62808	62813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845059
1016	NC_017773	TAA	2	6	62816	62821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845059
1017	NC_017773	TG	3	6	62829	62834	0 %	50 %	50 %	0 %	386845059
1018	NC_017773	TGT	2	6	62837	62842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845059
1019	NC_017773	T	6	6	62846	62851	0 %	100 %	0 %	0 %	386845059
1020	NC_017773	ACT	2	6	62852	62857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845059
1021	NC_017773	AAC	2	6	62960	62965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845059
1022	NC_017773	CAAT	2	8	62979	62986	50 %	25 %	0 %	25 %	386845059
1023	NC_017773	TTG	2	6	63013	63018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845059
1024	NC_017773	CCAA	2	8	63023	63030	50 %	0 %	0 %	50 %	386845059
1025	NC_017773	AAAC	2	8	63031	63038	75 %	0 %	0 %	25 %	386845059
1026	NC_017773	A	6	6	63200	63205	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
1027	NC_017773	A	6	6	63257	63262	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
1028	NC_017773	TAAC	2	8	63340	63347	50 %	25 %	0 %	25 %	386845059
1029	NC_017773	T	6	6	63359	63364	0 %	100 %	0 %	0 %	386845059
1030	NC_017773	ACA	2	6	63378	63383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845059
1031	NC_017773	TGC	2	6	63415	63420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845059
1032	NC_017773	TTG	2	6	63472	63477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845059
1033	NC_017773	CATG	2	8	63528	63535	25 %	25 %	25 %	25 %	386845059
1034	NC_017773	ATA	2	6	63555	63560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845059
1035	NC_017773	AGA	2	6	63573	63578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845059
1036	NC_017773	CCA	2	6	63687	63692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845059
1037	NC_017773	A	6	6	63712	63717	100 %	0 %	0 %	0 %	386845059
1038	NC_017773	ATT	2	6	63731	63736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845059
1039	NC_017773	TAT	2	6	63811	63816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845059
1040	NC_017773	AGTT	2	8	63896	63903	25 %	50 %	25 %	0 %	386845059
1041	NC_017773	TGAA	2	8	64006	64013	50 %	25 %	25 %	0 %	386845060
1042	NC_017773	CAT	2	6	64090	64095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845060
1043	NC_017773	CAA	2	6	64216	64221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845060
1044	NC_017773	C	6	6	64225	64230	0 %	0 %	0 %	100 %	386845060
1045	NC_017773	TAA	4	12	64254	64265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845060
1046	NC_017773	ATCT	2	8	64408	64415	25 %	50 %	0 %	25 %	386845060
1047	NC_017773	TAC	2	6	64555	64560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845060
1048	NC_017773	GTC	2	6	64595	64600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845060
1049	NC_017773	CT	3	6	64601	64606	0 %	50 %	0 %	50 %	386845060
1050	NC_017773	TTA	2	6	64701	64706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845060
1051	NC_017773	C	6	6	64758	64763	0 %	0 %	0 %	100 %	386845060
1052	NC_017773	A	6	6	64824	64829	100 %	0 %	0 %	0 %	386845060
1053	NC_017773	CGT	2	6	64834	64839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845060
1054	NC_017773	GCA	2	6	64851	64856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845060
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1056	NC_017773	TGTTT	2	10	64921	64930	0 %	80 %	20 %	0 %	386845060
1057	NC_017773	CTT	2	6	64937	64942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845060
1058	NC_017773	TGC	2	6	65016	65021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845060
1059	NC_017773	GTT	2	6	65082	65087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845060
1060	NC_017773	T	6	6	65142	65147	0 %	100 %	0 %	0 %	386845060
1061	NC_017773	ATTC	2	8	65158	65165	25 %	50 %	0 %	25 %	386845060
1062	NC_017773	T	8	8	65166	65173	0 %	100 %	0 %	0 %	386845060
1063	NC_017773	ATG	2	6	65183	65188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845060
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1065	NC_017773	GTG	2	6	66801	66806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845061
1066	NC_017773	ATA	2	6	66816	66821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845061
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1069	NC_017773	CCA	2	6	66985	66990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845061
1070	NC_017773	C	6	6	67046	67051	0 %	0 %	0 %	100 %	386845061
1071	NC_017773	CAT	3	9	67082	67090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845061
1072	NC_017773	TTA	2	6	67125	67130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845061
1073	NC_017773	TGCC	2	8	67153	67160	0 %	25 %	25 %	50 %	386845061
1074	NC_017773	TTCC	2	8	67207	67214	0 %	50 %	0 %	50 %	386845061
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1077	NC_017773	ATG	2	6	67444	67449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845061
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1080	NC_017773	CTCG	2	8	67573	67580	0 %	25 %	25 %	50 %	386845061
1081	NC_017773	AATA	2	8	67625	67632	75 %	25 %	0 %	0 %	386845061
1082	NC_017773	TAC	2	6	67645	67650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845061
1083	NC_017773	A	6	6	67682	67687	100 %	0 %	0 %	0 %	386845061
1084	NC_017773	TAA	2	6	67723	67728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845061
1085	NC_017773	CCT	2	6	67852	67857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845061
1086	NC_017773	AGAA	2	8	67871	67878	75 %	0 %	25 %	0 %	386845061
1087	NC_017773	A	8	8	67908	67915	100 %	0 %	0 %	0 %	386845061
1088	NC_017773	CAG	2	6	67916	67921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845061
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1091	NC_017773	AAT	2	6	68304	68309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845062
1092	NC_017773	A	6	6	68390	68395	100 %	0 %	0 %	0 %	386845062
1093	NC_017773	GAG	2	6	68490	68495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845062
1094	NC_017773	TGA	2	6	68543	68548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845062
1095	NC_017773	CTA	2	6	68571	68576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845062
1096	NC_017773	CCGG	2	8	68585	68592	0 %	0 %	50 %	50 %	386845062
1097	NC_017773	G	6	6	68591	68596	0 %	0 %	100 %	0 %	386845062
1098	NC_017773	ATT	2	6	68598	68603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845062
1099	NC_017773	CAC	2	6	68606	68611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845062
1100	NC_017773	GCA	2	6	68757	68762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845062
1101	NC_017773	CGC	2	6	68817	68822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845062
1102	NC_017773	GC	3	6	68837	68842	0 %	0 %	50 %	50 %	386845062
1103	NC_017773	TGA	2	6	68900	68905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845062
1104	NC_017773	TCC	2	6	68929	68934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386845062
1105	NC_017773	TCA	2	6	68945	68950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845062
1106	NC_017773	CGCAT	2	10	68991	69000	20 %	20 %	20 %	40 %	386845062
1107	NC_017773	GTT	2	6	69057	69062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845062
1108	NC_017773	T	7	7	69094	69100	0 %	100 %	0 %	0 %	386845062
1109	NC_017773	ATT	2	6	69162	69167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845062
1110	NC_017773	ATT	2	6	69587	69592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845063
1111	NC_017773	AG	3	6	69604	69609	50 %	0 %	50 %	0 %	386845063
1112	NC_017773	GTT	2	6	69631	69636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845063
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1115	NC_017773	TTC	2	6	69775	69780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845063
1116	NC_017773	ATT	2	6	69831	69836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845063
1117	NC_017773	TGA	2	6	69849	69854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845063
1118	NC_017773	CCA	2	6	69884	69889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845063
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1120	NC_017773	CTG	2	6	69974	69979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845063
1121	NC_017773	TC	3	6	69994	69999	0 %	50 %	0 %	50 %	386845063
1122	NC_017773	T	6	6	70029	70034	0 %	100 %	0 %	0 %	386845063
1123	NC_017773	TCA	2	6	70090	70095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845063
1124	NC_017773	GCC	2	6	70139	70144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845063
1125	NC_017773	TTG	2	6	70180	70185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845063
1126	NC_017773	CGG	2	6	70213	70218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845063
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