MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 1202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017773	TGGC	2	8	32507	32514	0 %	25 %	50 %	25 %	386845029
502	NC_017773	GC	3	6	32513	32518	0 %	0 %	50 %	50 %	386845029
503	NC_017773	TGAT	2	8	32760	32767	25 %	50 %	25 %	0 %	386845030
504	NC_017773	AGCC	2	8	32769	32776	25 %	0 %	25 %	50 %	386845030
505	NC_017773	GC	3	6	32856	32861	0 %	0 %	50 %	50 %	386845030
506	NC_017773	GCT	2	6	32869	32874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845030
507	NC_017773	CAC	2	6	32986	32991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845030
508	NC_017773	GAGC	2	8	32998	33005	25 %	0 %	50 %	25 %	386845030
509	NC_017773	GCG	2	6	33024	33029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845030
510	NC_017773	GCA	2	6	33052	33057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845030
511	NC_017773	ATC	2	6	33072	33077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845030
512	NC_017773	TTTA	2	8	33089	33096	25 %	75 %	0 %	0 %	386845030
513	NC_017773	GAT	2	6	33125	33130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845030
514	NC_017773	GT	3	6	33140	33145	0 %	50 %	50 %	0 %	386845030
515	NC_017773	CGC	2	6	33148	33153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845030
516	NC_017773	GCC	2	6	33191	33196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845030
517	NC_017773	GCA	2	6	33207	33212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845030
518	NC_017773	CGT	2	6	33279	33284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845030
519	NC_017773	CCG	2	6	33306	33311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845030
520	NC_017773	GCT	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845030
521	NC_017773	TGC	2	6	33600	33605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845030
522	NC_017773	GC	3	6	33626	33631	0 %	0 %	50 %	50 %	386845030
523	NC_017773	GAG	2	6	33653	33658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845030
524	NC_017773	GCG	2	6	33659	33664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845030
525	NC_017773	GCT	2	6	33715	33720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845030
526	NC_017773	GGT	2	6	33748	33753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845030
527	NC_017773	GGT	2	6	33781	33786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845030
528	NC_017773	GAA	2	6	33812	33817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845030
529	NC_017773	AGC	2	6	33822	33827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845030
530	NC_017773	CGA	2	6	33865	33870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845030
531	NC_017773	CGG	2	6	33910	33915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845030
532	NC_017773	CAT	2	6	33919	33924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845030
533	NC_017773	ATCA	2	8	33983	33990	50 %	25 %	0 %	25 %	386845030
534	NC_017773	CCA	2	6	34192	34197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845031
535	NC_017773	GC	3	6	34276	34281	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
536	NC_017773	TTC	2	6	34308	34313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845031
537	NC_017773	CGATC	2	10	34328	34337	20 %	20 %	20 %	40 %	386845031
538	NC_017773	GC	3	6	34597	34602	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
539	NC_017773	CCG	2	6	34641	34646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845031
540	NC_017773	CTG	2	6	34674	34679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845031
541	NC_017773	CTG	2	6	34689	34694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845031
542	NC_017773	GGAC	2	8	34781	34788	25 %	0 %	50 %	25 %	386845031
543	NC_017773	GGC	2	6	34824	34829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845031
544	NC_017773	ACC	2	6	34869	34874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845031
545	NC_017773	GCC	2	6	34902	34907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845031
546	NC_017773	TGA	2	6	34957	34962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845031
547	NC_017773	GGC	2	6	35108	35113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845031
548	NC_017773	TGG	2	6	35128	35133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845031
549	NC_017773	GTG	2	6	35135	35140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845031
550	NC_017773	CAG	2	6	35196	35201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845031
551	NC_017773	GGT	2	6	35228	35233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845031
552	NC_017773	TGG	2	6	35290	35295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845031
553	NC_017773	CAC	2	6	35311	35316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845031
554	NC_017773	A	7	7	35323	35329	100 %	0 %	0 %	0 %	386845031
555	NC_017773	GTGC	2	8	35343	35350	0 %	25 %	50 %	25 %	386845031
556	NC_017773	CGC	2	6	35385	35390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845031
557	NC_017773	GC	3	6	35451	35456	0 %	0 %	50 %	50 %	386845031
558	NC_017773	TGG	2	6	35467	35472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845031
559	NC_017773	TCAC	2	8	35477	35484	25 %	25 %	0 %	50 %	386845031
560	NC_017773	GCCA	2	8	35523	35530	25 %	0 %	25 %	50 %	386845031
561	NC_017773	CAC	2	6	35611	35616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845032
562	NC_017773	TGG	2	6	35648	35653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845032
563	NC_017773	CTG	2	6	35683	35688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845032
564	NC_017773	CAG	2	6	35722	35727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845032
565	NC_017773	A	6	6	35729	35734	100 %	0 %	0 %	0 %	386845032
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567	NC_017773	GCA	2	6	35883	35888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845032
568	NC_017773	CGC	4	12	35920	35931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845032
569	NC_017773	CTG	2	6	35953	35958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845032
570	NC_017773	AGG	2	6	35975	35980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845032
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572	NC_017773	CGC	2	6	36207	36212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845033
573	NC_017773	G	6	6	36214	36219	0 %	0 %	100 %	0 %	386845033
574	NC_017773	GGC	2	6	36239	36244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845033
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582	NC_017773	ATT	2	6	36655	36660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845034
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589	NC_017773	CCG	2	6	36945	36950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845034
590	NC_017773	CG	3	6	36949	36954	0 %	0 %	50 %	50 %	386845034
591	NC_017773	A	6	6	37034	37039	100 %	0 %	0 %	0 %	386845034
592	NC_017773	GAA	2	6	37054	37059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845034
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611	NC_017773	GC	3	6	37755	37760	0 %	0 %	50 %	50 %	386845035
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623	NC_017773	GC	3	6	38383	38388	0 %	0 %	50 %	50 %	386845035
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