MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017584	CAG	2	6	149188	149193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3502	NC_017584	GGC	2	6	149205	149210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348150
3503	NC_017584	CAGC	2	8	149256	149263	25 %	0 %	25 %	50 %	386348150
3504	NC_017584	GCG	2	6	149274	149279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348150
3505	NC_017584	AGA	2	6	149295	149300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348150
3506	NC_017584	GAT	2	6	149305	149310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348150
3507	NC_017584	GTC	2	6	149326	149331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3508	NC_017584	GAT	2	6	149332	149337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348150
3509	NC_017584	AGC	2	6	149387	149392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3510	NC_017584	GCC	2	6	149426	149431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348150
3511	NC_017584	GGGC	2	8	149490	149497	0 %	0 %	75 %	25 %	386348150
3512	NC_017584	ACC	2	6	149498	149503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348150
3513	NC_017584	GCC	2	6	149506	149511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348150
3514	NC_017584	CGG	2	6	149514	149519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348150
3515	NC_017584	CGGC	2	8	149523	149530	0 %	0 %	50 %	50 %	386348150
3516	NC_017584	GGC	2	6	149533	149538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348150
3517	NC_017584	C	7	7	149561	149567	0 %	0 %	0 %	100 %	386348150
3518	NC_017584	CAG	2	6	149596	149601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3519	NC_017584	CGT	2	6	149622	149627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3520	NC_017584	CAG	3	9	149635	149643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3521	NC_017584	CAG	2	6	149653	149658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348150
3522	NC_017584	GCC	3	9	149711	149719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348150
3523	NC_017584	CCG	2	6	149748	149753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348150
3524	NC_017584	CGG	2	6	149772	149777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348150
3525	NC_017584	TTAGC	2	10	151454	151463	20 %	40 %	20 %	20 %	386348151
3526	NC_017584	GC	3	6	151497	151502	0 %	0 %	50 %	50 %	386348151
3527	NC_017584	CTT	2	6	151506	151511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348151
3528	NC_017584	GCGCTG	2	12	151602	151613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386348151
3529	NC_017584	CCA	2	6	151702	151707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348151
3530	NC_017584	GCCC	2	8	151715	151722	0 %	0 %	25 %	75 %	386348151
3531	NC_017584	GCGG	2	8	151736	151743	0 %	0 %	75 %	25 %	386348151
3532	NC_017584	GGC	2	6	151751	151756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3533	NC_017584	AGA	2	6	151767	151772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348151
3534	NC_017584	CTG	2	6	151790	151795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348151
3535	NC_017584	GGT	2	6	151850	151855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348151
3536	NC_017584	GGCC	2	8	151906	151913	0 %	0 %	50 %	50 %	386348151
3537	NC_017584	GGC	2	6	151922	151927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3538	NC_017584	GGC	2	6	151931	151936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3539	NC_017584	GACC	2	8	151981	151988	25 %	0 %	25 %	50 %	386348151
3540	NC_017584	GC	3	6	152079	152084	0 %	0 %	50 %	50 %	386348151
3541	NC_017584	GCAG	2	8	152107	152114	25 %	0 %	50 %	25 %	386348151
3542	NC_017584	CCG	2	6	152115	152120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348151
3543	NC_017584	GC	3	6	152209	152214	0 %	0 %	50 %	50 %	386348151
3544	NC_017584	GGC	2	6	152219	152224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3545	NC_017584	CGT	2	6	152239	152244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348151
3546	NC_017584	CAG	2	6	152309	152314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348151
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3548	NC_017584	GC	3	6	152475	152480	0 %	0 %	50 %	50 %	386348151
3549	NC_017584	CGG	2	6	152491	152496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3550	NC_017584	GCAG	2	8	152503	152510	25 %	0 %	50 %	25 %	386348151
3551	NC_017584	CCG	2	6	152511	152516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348151
3552	NC_017584	GGT	2	6	152588	152593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348151
3553	NC_017584	CAG	2	6	152600	152605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348151
3554	NC_017584	CGA	2	6	152668	152673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348151
3555	NC_017584	CGG	2	6	152712	152717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3556	NC_017584	GCG	3	9	152883	152891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348151
3557	NC_017584	A	6	6	152916	152921	100 %	0 %	0 %	0 %	386348151
3558	NC_017584	CGA	3	9	153181	153189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348152
3559	NC_017584	TCGG	2	8	153237	153244	0 %	25 %	50 %	25 %	386348152
3560	NC_017584	TGG	2	6	153261	153266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348152
3561	NC_017584	GAT	2	6	153269	153274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348152
3562	NC_017584	CGG	2	6	153332	153337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348152
3563	NC_017584	CGG	3	9	153360	153368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348152
3564	NC_017584	CGA	2	6	153394	153399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348152
3565	NC_017584	CTTG	2	8	153412	153419	0 %	50 %	25 %	25 %	386348152
3566	NC_017584	CGA	2	6	153436	153441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348152
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3569	NC_017584	GAC	2	6	153641	153646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348152
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3584	NC_017584	CAGC	2	8	154266	154273	25 %	0 %	25 %	50 %	386348153
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3588	NC_017584	TCG	2	6	154318	154323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
3589	NC_017584	GCG	2	6	154329	154334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
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3592	NC_017584	GGC	2	6	154451	154456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
3593	NC_017584	GCA	2	6	154511	154516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348153
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3600	NC_017584	GCG	2	6	154805	154810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
3601	NC_017584	GC	3	6	154837	154842	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
3602	NC_017584	GGCGG	2	10	154843	154852	0 %	0 %	80 %	20 %	386348153
3603	NC_017584	GCG	2	6	154865	154870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
3604	NC_017584	G	7	7	155006	155012	0 %	0 %	100 %	0 %	386348153
3605	NC_017584	CGG	2	6	155033	155038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
3606	NC_017584	G	6	6	155046	155051	0 %	0 %	100 %	0 %	386348153
3607	NC_017584	CGG	2	6	155139	155144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
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3609	NC_017584	CGG	2	6	155252	155257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
3610	NC_017584	GCTG	2	8	155258	155265	0 %	25 %	50 %	25 %	386348153
3611	NC_017584	TCA	2	6	155299	155304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348153
3612	NC_017584	CG	3	6	155325	155330	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
3613	NC_017584	CCG	2	6	155336	155341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
3614	NC_017584	CCG	2	6	155370	155375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
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3619	NC_017584	GTC	2	6	155509	155514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
3620	NC_017584	CAGC	2	8	155568	155575	25 %	0 %	25 %	50 %	386348153
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3988	NC_017584	AGG	2	6	171666	171671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348168
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3991	NC_017584	G	6	6	171763	171768	0 %	0 %	100 %	0 %	386348168
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