MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017584	GCG	3	9	130460	130468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348133
3002	NC_017584	CG	3	6	130467	130472	0 %	0 %	50 %	50 %	386348133
3003	NC_017584	GCG	2	6	130478	130483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348133
3004	NC_017584	GCC	2	6	130505	130510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
3005	NC_017584	CTGG	2	8	130543	130550	0 %	25 %	50 %	25 %	386348133
3006	NC_017584	GCC	2	6	130556	130561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
3007	NC_017584	GGCG	2	8	130567	130574	0 %	0 %	75 %	25 %	386348133
3008	NC_017584	CGG	2	6	130579	130584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348133
3009	NC_017584	GCC	2	6	130598	130603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
3010	NC_017584	CGG	2	6	130632	130637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348133
3011	NC_017584	GC	3	6	130655	130660	0 %	0 %	50 %	50 %	386348133
3012	NC_017584	AGG	2	6	130686	130691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348133
3013	NC_017584	GC	3	6	130740	130745	0 %	0 %	50 %	50 %	386348134
3014	NC_017584	GGT	2	6	130770	130775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348134
3015	NC_017584	GCTGGT	2	12	130776	130787	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386348134
3016	NC_017584	TGT	2	6	130793	130798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348134
3017	NC_017584	GCG	2	6	130802	130807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3018	NC_017584	CAG	2	6	130819	130824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348134
3019	NC_017584	CGG	2	6	130880	130885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3020	NC_017584	CGA	2	6	130929	130934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348134
3021	NC_017584	GGC	2	6	130935	130940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3022	NC_017584	CGG	2	6	130953	130958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3023	NC_017584	CGATGG	2	12	130965	130976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386348134
3024	NC_017584	CCG	2	6	130994	130999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348134
3025	NC_017584	GCG	2	6	131014	131019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3026	NC_017584	CGC	2	6	131022	131027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348134
3027	NC_017584	CGG	3	9	131093	131101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3028	NC_017584	ACC	2	6	131113	131118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348134
3029	NC_017584	GCCC	2	8	131121	131128	0 %	0 %	25 %	75 %	386348134
3030	NC_017584	ATC	2	6	131152	131157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348134
3031	NC_017584	CGG	2	6	131177	131182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3032	NC_017584	GCG	2	6	131233	131238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348134
3033	NC_017584	TGA	2	6	131309	131314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348134
3034	NC_017584	CCG	2	6	131339	131344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348134
3035	NC_017584	GTT	2	6	131406	131411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348134
3036	NC_017584	AAGG	2	8	131513	131520	50 %	0 %	50 %	0 %	386348135
3037	NC_017584	GCGA	2	8	131558	131565	25 %	0 %	50 %	25 %	386348135
3038	NC_017584	CGC	3	9	131570	131578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3039	NC_017584	GAG	2	6	131639	131644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348135
3040	NC_017584	CG	3	6	131661	131666	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3041	NC_017584	G	6	6	131683	131688	0 %	0 %	100 %	0 %	386348135
3042	NC_017584	TGC	2	6	131706	131711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3043	NC_017584	CGG	2	6	131732	131737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3044	NC_017584	GCG	2	6	131742	131747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3045	NC_017584	C	6	6	131748	131753	0 %	0 %	0 %	100 %	386348135
3046	NC_017584	CGA	2	6	131803	131808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3047	NC_017584	CCA	2	6	131843	131848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348135
3048	NC_017584	CGA	2	6	131850	131855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3049	NC_017584	CG	3	6	131857	131862	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3050	NC_017584	CGC	3	9	131866	131874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3051	NC_017584	GCC	2	6	131875	131880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3052	NC_017584	GCT	2	6	131914	131919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3053	NC_017584	CGG	2	6	131923	131928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3054	NC_017584	TCA	2	6	132018	132023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348135
3055	NC_017584	AGC	2	6	132056	132061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3056	NC_017584	CGC	2	6	132079	132084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3057	NC_017584	CGG	2	6	132102	132107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3058	NC_017584	GCT	2	6	132175	132180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3059	NC_017584	TGG	2	6	132210	132215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348135
3060	NC_017584	CGA	2	6	132220	132225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3061	NC_017584	GCC	2	6	132231	132236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3062	NC_017584	GGT	2	6	132265	132270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348135
3063	NC_017584	GTC	2	6	132271	132276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3064	NC_017584	ATCG	2	8	132299	132306	25 %	25 %	25 %	25 %	386348135
3065	NC_017584	TGC	2	6	132339	132344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3066	NC_017584	CGGC	2	8	132366	132373	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3067	NC_017584	GGT	2	6	132412	132417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348135
3068	NC_017584	CTG	2	6	132434	132439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3069	NC_017584	CGG	2	6	132564	132569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3070	NC_017584	TGC	2	6	132714	132719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3071	NC_017584	CTG	2	6	132797	132802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3072	NC_017584	CCG	2	6	132805	132810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3073	NC_017584	CTG	2	6	132821	132826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3074	NC_017584	ACC	2	6	132857	132862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348135
3075	NC_017584	GGA	2	6	132919	132924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348135
3076	NC_017584	GCT	2	6	132946	132951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3077	NC_017584	CTG	2	6	133010	133015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3078	NC_017584	CCG	2	6	133065	133070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3079	NC_017584	GC	3	6	133081	133086	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3080	NC_017584	GCT	2	6	133180	133185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3081	NC_017584	GCC	2	6	133227	133232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3082	NC_017584	GC	3	6	133325	133330	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3083	NC_017584	CGA	2	6	133408	133413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348135
3084	NC_017584	GCGCC	2	10	133425	133434	0 %	0 %	40 %	60 %	386348135
3085	NC_017584	GGC	2	6	133528	133533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348135
3086	NC_017584	GC	3	6	133540	133545	0 %	0 %	50 %	50 %	386348135
3087	NC_017584	CCG	2	6	133558	133563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348135
3088	NC_017584	TGA	2	6	133571	133576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348135
3089	NC_017584	GTG	2	6	133615	133620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348136
3090	NC_017584	CTG	2	6	133666	133671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348136
3091	NC_017584	GGC	2	6	133692	133697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3092	NC_017584	CGG	2	6	133720	133725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3093	NC_017584	CGG	2	6	133743	133748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3094	NC_017584	GCG	2	6	133758	133763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3095	NC_017584	GTT	2	6	133794	133799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348136
3096	NC_017584	GCT	2	6	133836	133841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348136
3097	NC_017584	TGA	2	6	133851	133856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348136
3098	NC_017584	GAT	2	6	133890	133895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348136
3099	NC_017584	GCG	2	6	133899	133904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3100	NC_017584	GCG	2	6	133910	133915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3101	NC_017584	GGC	2	6	133952	133957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3102	NC_017584	GTG	2	6	133990	133995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348136
3103	NC_017584	GCG	2	6	134012	134017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3104	NC_017584	GCG	2	6	134024	134029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3105	NC_017584	GCG	2	6	134076	134081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3106	NC_017584	TCG	2	6	134108	134113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348136
3107	NC_017584	GGT	3	9	134154	134162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348136
3108	NC_017584	CGG	2	6	134184	134189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3109	NC_017584	GCC	2	6	134205	134210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348136
3110	NC_017584	TCG	2	6	134246	134251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348136
3111	NC_017584	GCG	2	6	134310	134315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
3112	NC_017584	GCC	2	6	134329	134334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348136
3113	NC_017584	CCTTG	2	10	134355	134364	0 %	40 %	20 %	40 %	386348136
3114	NC_017584	TTC	2	6	134416	134421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348136
3115	NC_017584	CG	4	8	134469	134476	0 %	0 %	50 %	50 %	386348136
3116	NC_017584	ACGGCG	2	12	134515	134526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348136
3117	NC_017584	CCG	2	6	134534	134539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348136
3118	NC_017584	CCG	2	6	134581	134586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348136
3119	NC_017584	GGC	2	6	134620	134625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348136
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3121	NC_017584	GCTT	2	8	134702	134709	0 %	50 %	25 %	25 %	386348136
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3362	NC_017584	CGC	2	6	143254	143259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348145
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