MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017584	GCCA	3	12	111034	111045	25 %	0 %	25 %	50 %	386348117
2502	NC_017584	CCG	3	9	111046	111054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
2503	NC_017584	ACG	2	6	111055	111060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348117
2504	NC_017584	AGA	2	6	111087	111092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348117
2505	NC_017584	CGT	2	6	111253	111258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348118
2506	NC_017584	CGGC	2	8	111357	111364	0 %	0 %	50 %	50 %	386348118
2507	NC_017584	GGC	2	6	111384	111389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348118
2508	NC_017584	CCA	2	6	111401	111406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348118
2509	NC_017584	CGG	2	6	111424	111429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348118
2510	NC_017584	CAGCAC	2	12	111462	111473	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386348118
2511	NC_017584	TTG	2	6	111586	111591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348118
2512	NC_017584	CGT	2	6	111644	111649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348118
2513	NC_017584	TGG	2	6	111659	111664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348118
2514	NC_017584	ATC	2	6	111676	111681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348118
2515	NC_017584	CTT	2	6	111732	111737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348119
2516	NC_017584	CGG	2	6	111775	111780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2517	NC_017584	TCC	2	6	111783	111788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348119
2518	NC_017584	GC	3	6	111839	111844	0 %	0 %	50 %	50 %	386348119
2519	NC_017584	GTC	2	6	111845	111850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2520	NC_017584	ACG	2	6	111865	111870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2521	NC_017584	TCGG	2	8	111885	111892	0 %	25 %	50 %	25 %	386348119
2522	NC_017584	AAC	2	6	111900	111905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348119
2523	NC_017584	CGT	2	6	111985	111990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2524	NC_017584	CGG	2	6	111991	111996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2525	NC_017584	GGC	2	6	112030	112035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2526	NC_017584	GCC	2	6	112113	112118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2527	NC_017584	CCG	3	9	112120	112128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2528	NC_017584	GGCC	2	8	112141	112148	0 %	0 %	50 %	50 %	386348119
2529	NC_017584	GGC	2	6	112190	112195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2530	NC_017584	CCG	2	6	112212	112217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2531	NC_017584	GGC	2	6	112244	112249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2532	NC_017584	GAT	2	6	112268	112273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348119
2533	NC_017584	GCC	2	6	112277	112282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2534	NC_017584	CGA	2	6	112327	112332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2535	NC_017584	CGC	2	6	112421	112426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2536	NC_017584	GCG	2	6	112506	112511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2537	NC_017584	CGG	2	6	112540	112545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2538	NC_017584	TGG	2	6	112546	112551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348119
2539	NC_017584	GAT	2	6	112624	112629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348119
2540	NC_017584	GCC	2	6	112668	112673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2541	NC_017584	ACC	2	6	112689	112694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348119
2542	NC_017584	GCC	2	6	112695	112700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2543	NC_017584	CGC	2	6	112702	112707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2544	NC_017584	GCC	2	6	112716	112721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2545	NC_017584	TGG	2	6	112837	112842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348119
2546	NC_017584	TCG	2	6	112881	112886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2547	NC_017584	GTG	2	6	112887	112892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348119
2548	NC_017584	G	7	7	112925	112931	0 %	0 %	100 %	0 %	386348119
2549	NC_017584	TGA	2	6	113040	113045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348120
2550	NC_017584	GTC	2	6	113059	113064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2551	NC_017584	CCGC	2	8	113070	113077	0 %	0 %	25 %	75 %	386348120
2552	NC_017584	CGG	2	6	113199	113204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348120
2553	NC_017584	CAC	2	6	113230	113235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348120
2554	NC_017584	TCG	2	6	113267	113272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2555	NC_017584	TCG	2	6	113288	113293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2556	NC_017584	GCC	3	9	113398	113406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2557	NC_017584	AGCG	2	8	113483	113490	25 %	0 %	50 %	25 %	386348120
2558	NC_017584	CGC	2	6	113520	113525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2559	NC_017584	GGT	2	6	113533	113538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348120
2560	NC_017584	CCG	2	6	113550	113555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2561	NC_017584	AGC	2	6	113564	113569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2562	NC_017584	GAC	2	6	113572	113577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2563	NC_017584	GCCGAT	2	12	113608	113619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2564	NC_017584	CGC	2	6	113625	113630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2565	NC_017584	ATG	2	6	113642	113647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348120
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2567	NC_017584	CGC	2	6	113658	113663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2568	NC_017584	TCG	2	6	113669	113674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2569	NC_017584	GGC	2	6	113689	113694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348120
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2572	NC_017584	CTG	2	6	113746	113751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2573	NC_017584	GCG	2	6	113755	113760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348120
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2575	NC_017584	TCG	2	6	113975	113980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
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2578	NC_017584	CGGC	2	8	114058	114065	0 %	0 %	50 %	50 %	386348120
2579	NC_017584	ACC	2	6	114113	114118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348120
2580	NC_017584	CGA	2	6	114132	114137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348120
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2582	NC_017584	GTCTT	2	10	114155	114164	0 %	60 %	20 %	20 %	386348120
2583	NC_017584	GC	3	6	114173	114178	0 %	0 %	50 %	50 %	386348120
2584	NC_017584	GGC	2	6	114223	114228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348120
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2589	NC_017584	GGC	2	6	114412	114417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348120
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2591	NC_017584	GC	3	6	114446	114451	0 %	0 %	50 %	50 %	386348120
2592	NC_017584	TCG	2	6	114470	114475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2593	NC_017584	CCG	2	6	114524	114529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
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2595	NC_017584	GCCCG	2	10	114609	114618	0 %	0 %	40 %	60 %	386348120
2596	NC_017584	GC	4	8	114627	114634	0 %	0 %	50 %	50 %	386348120
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2600	NC_017584	GAG	2	6	114824	114829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348120
2601	NC_017584	GGT	2	6	114877	114882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348120
2602	NC_017584	CCA	2	6	114897	114902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348120
2603	NC_017584	GCC	2	6	114912	114917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2604	NC_017584	ACG	2	6	114926	114931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348120
2605	NC_017584	CGC	2	6	114977	114982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348120
2606	NC_017584	GGGT	2	8	115055	115062	0 %	25 %	75 %	0 %	386348121
2607	NC_017584	CGG	2	6	115106	115111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348121
2608	NC_017584	TCC	2	6	115134	115139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348121
2609	NC_017584	GC	4	8	115147	115154	0 %	0 %	50 %	50 %	386348121
2610	NC_017584	CGG	2	6	115262	115267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348121
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2612	NC_017584	CCA	2	6	115319	115324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348121
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2614	NC_017584	CGCGG	2	10	115648	115657	0 %	0 %	60 %	40 %	386348122
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2618	NC_017584	GGT	2	6	115858	115863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348122
2619	NC_017584	CCG	2	6	115884	115889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348122
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2988	NC_017584	TCG	2	6	129934	129939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348132
2989	NC_017584	GCTG	2	8	129988	129995	0 %	25 %	50 %	25 %	386348132
2990	NC_017584	GTC	2	6	130065	130070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348132
2991	NC_017584	GCC	2	6	130120	130125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
2992	NC_017584	GCG	2	6	130129	130134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348133
2993	NC_017584	GCC	2	6	130199	130204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
2994	NC_017584	GCC	4	12	130234	130245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133
2995	NC_017584	GGCCGT	2	12	130255	130266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386348133
2996	NC_017584	CGGG	2	8	130283	130290	0 %	0 %	75 %	25 %	386348133
2997	NC_017584	GGCGA	2	10	130328	130337	20 %	0 %	60 %	20 %	386348133
2998	NC_017584	C	6	6	130350	130355	0 %	0 %	0 %	100 %	386348133
2999	NC_017584	TGGC	2	8	130388	130395	0 %	25 %	50 %	25 %	386348133
3000	NC_017584	GCC	2	6	130442	130447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348133

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