MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017584	GCGCGT	2	12	45914	45925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386348064
1002	NC_017584	CCGG	2	8	46024	46031	0 %	0 %	50 %	50 %	386348064
1003	NC_017584	GC	3	6	46056	46061	0 %	0 %	50 %	50 %	386348064
1004	NC_017584	GGT	2	6	46079	46084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348064
1005	NC_017584	ATCG	2	8	46122	46129	25 %	25 %	25 %	25 %	386348064
1006	NC_017584	GAT	2	6	46140	46145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348064
1007	NC_017584	CGA	2	6	46172	46177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348064
1008	NC_017584	TGA	2	6	46183	46188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348064
1009	NC_017584	GGCC	2	8	46280	46287	0 %	0 %	50 %	50 %	386348064
1010	NC_017584	GCA	2	6	46354	46359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348064
1011	NC_017584	CGC	2	6	46366	46371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348064
1012	NC_017584	ATC	2	6	46578	46583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348065
1013	NC_017584	ATCG	2	8	46599	46606	25 %	25 %	25 %	25 %	386348065
1014	NC_017584	CG	3	6	46618	46623	0 %	0 %	50 %	50 %	386348065
1015	NC_017584	CGT	2	6	46627	46632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348065
1016	NC_017584	TCG	2	6	46663	46668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348065
1017	NC_017584	GGA	3	9	46685	46693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348065
1018	NC_017584	GAG	2	6	46785	46790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348065
1019	NC_017584	GCG	2	6	46948	46953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348066
1020	NC_017584	CGT	2	6	46954	46959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1021	NC_017584	ACCG	2	8	47066	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	386348066
1022	NC_017584	CGC	2	6	47089	47094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348066
1023	NC_017584	CGC	2	6	47179	47184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348066
1024	NC_017584	CGA	2	6	47218	47223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1025	NC_017584	CAT	2	6	47248	47253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348066
1026	NC_017584	CCG	2	6	47296	47301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348066
1027	NC_017584	GCC	2	6	47329	47334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348066
1028	NC_017584	GCCACC	2	12	47432	47443	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386348066
1029	NC_017584	CGG	2	6	47503	47508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348066
1030	NC_017584	CGT	2	6	47560	47565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1031	NC_017584	GCG	2	6	47627	47632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348066
1032	NC_017584	CCAT	2	8	47679	47686	25 %	25 %	0 %	50 %	386348066
1033	NC_017584	CCG	2	6	47712	47717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348066
1034	NC_017584	GGC	2	6	47786	47791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348066
1035	NC_017584	TGA	2	6	47904	47909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348066
1036	NC_017584	CGA	2	6	47916	47921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1037	NC_017584	TGG	2	6	47967	47972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348066
1038	NC_017584	CGA	2	6	47973	47978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1039	NC_017584	GCG	2	6	48142	48147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348066
1040	NC_017584	TCG	2	6	48150	48155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348066
1041	NC_017584	C	6	6	48193	48198	0 %	0 %	0 %	100 %	386348067
1042	NC_017584	CTG	2	6	48219	48224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348067
1043	NC_017584	CTG	2	6	48273	48278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348067
1044	NC_017584	GGC	2	6	48298	48303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348067
1045	NC_017584	CTG	2	6	48450	48455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348067
1046	NC_017584	CGC	2	6	48462	48467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348067
1047	NC_017584	GCC	2	6	48468	48473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348067
1048	NC_017584	CCG	2	6	48595	48600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348067
1049	NC_017584	CTG	2	6	48603	48608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348067
1050	NC_017584	CGC	2	6	48609	48614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348067
1051	NC_017584	TCGCCC	2	12	48655	48666	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386348067
1052	NC_017584	ATC	2	6	48769	48774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348068
1053	NC_017584	GCTCT	2	10	48780	48789	0 %	40 %	20 %	40 %	386348068
1054	NC_017584	CTT	2	6	48790	48795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348068
1055	NC_017584	TCG	2	6	48846	48851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1056	NC_017584	TGAC	2	8	48852	48859	25 %	25 %	25 %	25 %	386348068
1057	NC_017584	CAG	2	6	48863	48868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1058	NC_017584	TGGT	2	8	48927	48934	0 %	50 %	50 %	0 %	386348068
1059	NC_017584	AAG	2	6	48950	48955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348068
1060	NC_017584	GGT	2	6	48960	48965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348068
1061	NC_017584	CG	3	6	48995	49000	0 %	0 %	50 %	50 %	386348068
1062	NC_017584	GCC	2	6	49010	49015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348068
1063	NC_017584	GGC	2	6	49073	49078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1064	NC_017584	ATT	2	6	49121	49126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348068
1065	NC_017584	CTG	2	6	49160	49165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1066	NC_017584	GC	4	8	49210	49217	0 %	0 %	50 %	50 %	386348068
1067	NC_017584	AAG	2	6	49238	49243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348068
1068	NC_017584	CAT	2	6	49336	49341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348068
1069	NC_017584	CCG	2	6	49344	49349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348068
1070	NC_017584	CCA	2	6	49369	49374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348068
1071	NC_017584	GCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1072	NC_017584	CCT	2	6	49468	49473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348068
1073	NC_017584	GCC	2	6	49505	49510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348068
1074	NC_017584	CGG	2	6	49596	49601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1075	NC_017584	CGG	2	6	49612	49617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1076	NC_017584	GC	4	8	49624	49631	0 %	0 %	50 %	50 %	386348068
1077	NC_017584	CGC	2	6	49655	49660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348068
1078	NC_017584	CGG	2	6	49675	49680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1079	NC_017584	GTG	2	6	49752	49757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348068
1080	NC_017584	TTC	2	6	49778	49783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348068
1081	NC_017584	GAC	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1082	NC_017584	GCCG	2	8	49855	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	386348068
1083	NC_017584	TCG	2	6	49879	49884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1084	NC_017584	TCA	2	6	49887	49892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348068
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1086	NC_017584	GCG	2	6	49926	49931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348068
1087	NC_017584	CCG	2	6	49953	49958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348068
1088	NC_017584	CGGG	2	8	50025	50032	0 %	0 %	75 %	25 %	386348068
1089	NC_017584	GAC	2	6	50151	50156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1090	NC_017584	CAGC	2	8	50168	50175	25 %	0 %	25 %	50 %	386348068
1091	NC_017584	GCA	2	6	50236	50241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348068
1092	NC_017584	GCC	2	6	50565	50570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348069
1093	NC_017584	GC	3	6	50587	50592	0 %	0 %	50 %	50 %	386348069
1094	NC_017584	CGG	2	6	50669	50674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348069
1095	NC_017584	GGC	3	9	50745	50753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348069
1096	NC_017584	GCC	2	6	50793	50798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348069
1097	NC_017584	GCC	2	6	50857	50862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348069
1098	NC_017584	CGC	2	6	50867	50872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348069
1099	NC_017584	GCG	2	6	50944	50949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348069
1100	NC_017584	AGA	2	6	50983	50988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348069
1101	NC_017584	TCA	2	6	50993	50998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348069
1102	NC_017584	GC	3	6	50999	51004	0 %	0 %	50 %	50 %	386348069
1103	NC_017584	TGC	2	6	51029	51034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348069
1104	NC_017584	CG	3	6	51037	51042	0 %	0 %	50 %	50 %	386348069
1105	NC_017584	TCATC	2	10	51143	51152	20 %	40 %	0 %	40 %	386348069
1106	NC_017584	GTTT	2	8	51218	51225	0 %	75 %	25 %	0 %	386348070
1107	NC_017584	CAG	2	6	51237	51242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348070
1108	NC_017584	GTG	2	6	51262	51267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348070
1109	NC_017584	CGACGG	2	12	51269	51280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348070
1110	NC_017584	TGACC	2	10	51290	51299	20 %	20 %	20 %	40 %	386348070
1111	NC_017584	GGC	2	6	51309	51314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348070
1112	NC_017584	TTCATC	2	12	51325	51336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386348070
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1114	NC_017584	CAC	2	6	51399	51404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348070
1115	NC_017584	ACC	2	6	51424	51429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348070
1116	NC_017584	GCG	2	6	51457	51462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348070
1117	NC_017584	G	6	6	51468	51473	0 %	0 %	100 %	0 %	386348070
1118	NC_017584	CGGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	75 %	25 %	386348070
1119	NC_017584	GCGG	2	8	51502	51509	0 %	0 %	75 %	25 %	386348070
1120	NC_017584	GCGCTC	2	12	51514	51525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348070
1121	NC_017584	G	6	6	51539	51544	0 %	0 %	100 %	0 %	386348070
1122	NC_017584	CGT	2	6	51584	51589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348070
1123	NC_017584	TCA	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348070
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1125	NC_017584	TCCT	2	8	51728	51735	0 %	50 %	0 %	50 %	386348071
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1499	NC_017584	CGT	2	6	67128	67133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348080
1500	NC_017584	ATGG	2	8	67168	67175	25 %	25 %	50 %	0 %	386348080

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