MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017584	GGCC	2	8	450929	450936	0 %	0 %	50 %	50 %	386348401
10003	NC_017584	TGCC	2	8	450959	450966	0 %	25 %	25 %	50 %	386348401
10004	NC_017584	CG	3	6	450993	450998	0 %	0 %	50 %	50 %	386348401
10005	NC_017584	GGT	2	6	451031	451036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348401
10006	NC_017584	GC	4	8	451096	451103	0 %	0 %	50 %	50 %	386348401
10007	NC_017584	TCA	2	6	451109	451114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348401
10008	NC_017584	CAA	2	6	451196	451201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348401
10009	NC_017584	GAT	2	6	451223	451228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348401
10010	NC_017584	GAG	2	6	451287	451292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348401
10011	NC_017584	CAA	2	6	451328	451333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348401
10012	NC_017584	CCA	2	6	451357	451362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348401
10013	NC_017584	GCC	2	6	451368	451373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348401
10014	NC_017584	GAG	2	6	451377	451382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348401
10015	NC_017584	CGC	2	6	451400	451405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348401
10016	NC_017584	GAGC	2	8	451430	451437	25 %	0 %	50 %	25 %	386348401
10017	NC_017584	CCGA	2	8	451461	451468	25 %	0 %	25 %	50 %	386348401
10018	NC_017584	GGC	2	6	451477	451482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348401
10019	NC_017584	ACG	2	6	451488	451493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348401
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10021	NC_017584	CCG	2	6	451541	451546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348401
10022	NC_017584	ATT	2	6	451642	451647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348401
10023	NC_017584	GCCA	2	8	451650	451657	25 %	0 %	25 %	50 %	386348401
10024	NC_017584	ACGG	2	8	451720	451727	25 %	0 %	50 %	25 %	386348401
10025	NC_017584	GAT	2	6	451847	451852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348402
10026	NC_017584	CCGC	2	8	451903	451910	0 %	0 %	25 %	75 %	386348402
10027	NC_017584	TTA	2	6	451931	451936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348402
10028	NC_017584	CCCG	2	8	451941	451948	0 %	0 %	25 %	75 %	386348402
10029	NC_017584	ACG	2	6	451978	451983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348402
10030	NC_017584	GC	3	6	451991	451996	0 %	0 %	50 %	50 %	386348402
10031	NC_017584	ATC	2	6	452037	452042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348402
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10034	NC_017584	GGGC	2	8	452128	452135	0 %	0 %	75 %	25 %	386348402
10035	NC_017584	CCGG	2	8	452210	452217	0 %	0 %	50 %	50 %	386348402
10036	NC_017584	CGG	2	6	452345	452350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348402
10037	NC_017584	GACCCT	2	12	452369	452380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386348402
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10041	NC_017584	GCC	2	6	452599	452604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348403
10042	NC_017584	CGG	2	6	452611	452616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348403
10043	NC_017584	CTC	2	6	452778	452783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348403
10044	NC_017584	CGC	2	6	452807	452812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348403
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10046	NC_017584	GGCG	2	8	452969	452976	0 %	0 %	75 %	25 %	386348403
10047	NC_017584	GC	3	6	453022	453027	0 %	0 %	50 %	50 %	386348403
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10052	NC_017584	CGA	2	6	453269	453274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348403
10053	NC_017584	CGG	2	6	453322	453327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348404
10054	NC_017584	GC	3	6	453413	453418	0 %	0 %	50 %	50 %	386348404
10055	NC_017584	CCG	2	6	453425	453430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348404
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10062	NC_017584	TCG	2	6	453723	453728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348404
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10101	NC_017584	CGA	2	6	455422	455427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348405
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10108	NC_017584	CAG	2	6	455702	455707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348405
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10113	NC_017584	CCT	3	9	455863	455871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348405
10114	NC_017584	CGA	2	6	455891	455896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348405
10115	NC_017584	GCTG	2	8	455914	455921	0 %	25 %	50 %	25 %	386348405
10116	NC_017584	GGT	2	6	455924	455929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348405
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10118	NC_017584	CGC	2	6	455995	456000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348405
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10120	NC_017584	GGCGC	2	10	456140	456149	0 %	0 %	60 %	40 %	386348405
10121	NC_017584	CGG	2	6	456157	456162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348405
10122	NC_017584	GGCGGT	2	12	456170	456181	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386348405
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10224	NC_017584	TGAC	2	8	460722	460729	25 %	25 %	25 %	25 %	386348411
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10228	NC_017584	GGCT	2	8	461006	461013	0 %	25 %	50 %	25 %	386348411
10229	NC_017584	GCG	2	6	461076	461081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348411
10230	NC_017584	GAT	2	6	461228	461233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348412
10231	NC_017584	CGG	2	6	461258	461263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348412
10232	NC_017584	CGGC	2	8	461338	461345	0 %	0 %	50 %	50 %	386348412
10233	NC_017584	GGC	2	6	461401	461406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348412
10234	NC_017584	GTC	2	6	461451	461456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348412
10235	NC_017584	G	7	7	461475	461481	0 %	0 %	100 %	0 %	386348412
10236	NC_017584	CGA	2	6	461495	461500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348412
10237	NC_017584	TGA	2	6	461533	461538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348412
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10239	NC_017584	CGG	2	6	461599	461604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348412
10240	NC_017584	GATC	2	8	461606	461613	25 %	25 %	25 %	25 %	386348412
10241	NC_017584	GCT	2	6	461642	461647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348412
10242	NC_017584	GATC	2	8	461666	461673	25 %	25 %	25 %	25 %	386348412
10243	NC_017584	ATG	2	6	461680	461685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348412
10244	NC_017584	CGG	3	9	461759	461767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348412
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10329	NC_017584	TCA	2	6	465641	465646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348416
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10334	NC_017584	GCCT	2	8	465790	465797	0 %	25 %	25 %	50 %	386348416
10335	NC_017584	CGAC	2	8	465842	465849	25 %	0 %	25 %	50 %	386348416
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10342	NC_017584	CGC	3	9	466065	466073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348416
10343	NC_017584	GAT	2	6	466110	466115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348416
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10350	NC_017584	GATC	2	8	466292	466299	25 %	25 %	25 %	25 %	386348416
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10352	NC_017584	CGT	2	6	466350	466355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348416
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10354	NC_017584	GGCTT	2	10	466383	466392	0 %	40 %	40 %	20 %	386348416
10355	NC_017584	CGG	2	6	466448	466453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348416
10356	NC_017584	CATC	2	8	466480	466487	25 %	25 %	0 %	50 %	386348416
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