MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017584	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	386348040
502	NC_017584	GTC	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
503	NC_017584	GGA	2	6	22675	22680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348040
504	NC_017584	GAC	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
505	NC_017584	GTC	2	6	22765	22770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
506	NC_017584	CAC	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
507	NC_017584	TTC	2	6	22793	22798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348040
508	NC_017584	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
509	NC_017584	CCG	2	6	22826	22831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
510	NC_017584	TGA	2	6	22857	22862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
511	NC_017584	CGA	2	6	22900	22905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
512	NC_017584	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
513	NC_017584	ACC	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
514	NC_017584	GCA	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
515	NC_017584	GAG	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348040
516	NC_017584	GCG	2	6	23094	23099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
517	NC_017584	GAT	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
518	NC_017584	GCC	2	6	23168	23173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
519	NC_017584	TGCGC	2	10	23232	23241	0 %	20 %	40 %	40 %	386348040
520	NC_017584	CCA	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
521	NC_017584	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
522	NC_017584	CGA	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
523	NC_017584	GGC	2	6	23374	23379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
524	NC_017584	AAG	2	6	23393	23398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348040
525	NC_017584	CGG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
526	NC_017584	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
527	NC_017584	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
528	NC_017584	AGA	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348040
529	NC_017584	CGGCG	2	10	23602	23611	0 %	0 %	60 %	40 %	386348040
530	NC_017584	GTG	2	6	23615	23620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
531	NC_017584	CGG	2	6	23629	23634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
532	NC_017584	GCG	2	6	23658	23663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
533	NC_017584	GCA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
534	NC_017584	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
535	NC_017584	CCG	2	6	23748	23753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
536	NC_017584	GCC	2	6	23767	23772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
537	NC_017584	CAC	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
538	NC_017584	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
539	NC_017584	CCG	3	9	23854	23862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
540	NC_017584	GCG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
541	NC_017584	GCG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
542	NC_017584	CGC	2	6	23995	24000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
543	NC_017584	CCG	2	6	24060	24065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
544	NC_017584	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	386348040
545	NC_017584	GAT	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
546	NC_017584	CCG	2	6	24209	24214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
547	NC_017584	CAC	2	6	24218	24223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
548	NC_017584	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
549	NC_017584	CG	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
550	NC_017584	CGC	2	6	24334	24339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
551	NC_017584	TGATCT	2	12	24366	24377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386348040
552	NC_017584	GGC	2	6	24389	24394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
553	NC_017584	CGG	2	6	24517	24522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
554	NC_017584	GTG	2	6	24542	24547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
555	NC_017584	CGC	2	6	24550	24555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
556	NC_017584	CAC	2	6	24586	24591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348040
557	NC_017584	TGG	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
558	NC_017584	CAT	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348040
559	NC_017584	GAC	2	6	24668	24673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
560	NC_017584	GC	3	6	24679	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
561	NC_017584	CCG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
562	NC_017584	GGT	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
563	NC_017584	GCTC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
564	NC_017584	GGT	2	6	24787	24792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
565	NC_017584	CAG	2	6	24812	24817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
566	NC_017584	CGATCT	2	12	24844	24855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386348040
567	NC_017584	GAT	2	6	24949	24954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348040
568	NC_017584	CGA	2	6	24976	24981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348040
569	NC_017584	TCA	2	6	25059	25064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348040
570	NC_017584	TCG	2	6	25221	25226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
571	NC_017584	CGG	2	6	25233	25238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348040
572	NC_017584	CAT	2	6	25270	25275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348040
573	NC_017584	CGC	2	6	25318	25323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348040
574	NC_017584	GGT	3	9	25369	25377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348040
575	NC_017584	TGC	2	6	25575	25580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348040
576	NC_017584	GGCCGA	2	12	25723	25734	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348040
577	NC_017584	GGCA	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	386348041
578	NC_017584	GC	3	6	25898	25903	0 %	0 %	50 %	50 %	386348041
579	NC_017584	CAG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348041
580	NC_017584	G	6	6	26235	26240	0 %	0 %	100 %	0 %	386348041
581	NC_017584	CAG	2	6	26272	26277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348041
582	NC_017584	GTG	2	6	26324	26329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348041
583	NC_017584	G	7	7	26368	26374	0 %	0 %	100 %	0 %	386348042
584	NC_017584	GGT	2	6	26387	26392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348042
585	NC_017584	CAGGGC	2	12	26439	26450	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348042
586	NC_017584	GC	3	6	26449	26454	0 %	0 %	50 %	50 %	386348042
587	NC_017584	CG	3	6	26456	26461	0 %	0 %	50 %	50 %	386348042
588	NC_017584	GC	3	6	26499	26504	0 %	0 %	50 %	50 %	386348042
589	NC_017584	CGG	3	9	26572	26580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348042
590	NC_017584	CGG	2	6	26591	26596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348042
591	NC_017584	AGC	2	6	26611	26616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348042
592	NC_017584	CAT	2	6	26694	26699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348042
593	NC_017584	AGC	2	6	26737	26742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348042
594	NC_017584	TCA	2	6	26759	26764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348042
595	NC_017584	GGC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348042
596	NC_017584	TCG	2	6	26824	26829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348042
597	NC_017584	CGG	2	6	27129	27134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348043
598	NC_017584	TCCT	2	8	27215	27222	0 %	50 %	0 %	50 %	386348043
599	NC_017584	CGT	2	6	27330	27335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348043
600	NC_017584	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	386348043
601	NC_017584	GCG	2	6	27370	27375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348043
602	NC_017584	TGG	2	6	27378	27383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348043
603	NC_017584	GCT	2	6	27439	27444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348043
604	NC_017584	CGG	2	6	27460	27465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348043
605	NC_017584	CGGG	2	8	27493	27500	0 %	0 %	75 %	25 %	386348043
606	NC_017584	CCG	2	6	27544	27549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348043
607	NC_017584	GCTG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	386348043
608	NC_017584	CGG	2	6	27591	27596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348043
609	NC_017584	GCT	2	6	27703	27708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348043
610	NC_017584	C	8	8	27733	27740	0 %	0 %	0 %	100 %	386348043
611	NC_017584	C	6	6	27958	27963	0 %	0 %	0 %	100 %	386348044
612	NC_017584	ATG	2	6	28033	28038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348044
613	NC_017584	TGC	2	6	28058	28063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348044
614	NC_017584	TCG	2	6	28094	28099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348044
615	NC_017584	CGC	2	6	28155	28160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348044
616	NC_017584	CGT	2	6	28166	28171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348044
617	NC_017584	GCG	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348044
618	NC_017584	ATC	2	6	28211	28216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348044
619	NC_017584	GGC	2	6	28233	28238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348044
620	NC_017584	GCC	2	6	28309	28314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348044
621	NC_017584	CGA	2	6	28512	28517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348045
622	NC_017584	CCGG	2	8	28523	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	386348045
623	NC_017584	GCC	2	6	28537	28542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348045
624	NC_017584	GCC	3	9	28550	28558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348045
625	NC_017584	GAG	2	6	28610	28615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348045
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627	NC_017584	GGC	2	6	28690	28695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348045
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752	NC_017584	CGG	2	6	36266	36271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348053
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