MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017584	GCC	2	6	272860	272865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348241
6002	NC_017584	GCCG	2	8	272937	272944	0 %	0 %	50 %	50 %	386348241
6003	NC_017584	AT	3	6	272969	272974	50 %	50 %	0 %	0 %	386348241
6004	NC_017584	CGA	2	6	273001	273006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6005	NC_017584	CGT	2	6	273012	273017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6006	NC_017584	TTCTT	2	10	273068	273077	0 %	80 %	0 %	20 %	386348241
6007	NC_017584	TCG	2	6	273080	273085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6008	NC_017584	ACC	2	6	273137	273142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348241
6009	NC_017584	CGG	2	6	273147	273152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348241
6010	NC_017584	CGC	2	6	273189	273194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348241
6011	NC_017584	CGA	2	6	273216	273221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6012	NC_017584	GGC	2	6	273261	273266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348241
6013	NC_017584	GAC	2	6	273280	273285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6014	NC_017584	CTG	2	6	273299	273304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6015	NC_017584	GCCAGG	2	12	273305	273316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348241
6016	NC_017584	GGT	2	6	273343	273348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348241
6017	NC_017584	GC	3	6	273389	273394	0 %	0 %	50 %	50 %	386348241
6018	NC_017584	GTC	2	6	273424	273429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348241
6019	NC_017584	CGT	2	6	273540	273545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348242
6020	NC_017584	CGG	2	6	273568	273573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6021	NC_017584	TTG	2	6	273684	273689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348242
6022	NC_017584	CGG	3	9	273751	273759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6023	NC_017584	CTTC	2	8	273760	273767	0 %	50 %	0 %	50 %	386348242
6024	NC_017584	CGC	2	6	273770	273775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348242
6025	NC_017584	CGG	2	6	273787	273792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6026	NC_017584	CGA	2	6	273823	273828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348242
6027	NC_017584	GGC	2	6	273911	273916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6028	NC_017584	GTC	3	9	273921	273929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348242
6029	NC_017584	ATC	2	6	273933	273938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348242
6030	NC_017584	CGG	3	9	273943	273951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6031	NC_017584	TGG	2	6	274018	274023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348242
6032	NC_017584	TGG	2	6	274087	274092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348242
6033	NC_017584	ACG	2	6	274096	274101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348242
6034	NC_017584	CGATGT	2	12	274270	274281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386348242
6035	NC_017584	TCA	2	6	274351	274356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348242
6036	NC_017584	CGC	2	6	274360	274365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348242
6037	NC_017584	GCA	2	6	274384	274389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348242
6038	NC_017584	CCA	2	6	274456	274461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348242
6039	NC_017584	GC	3	6	274494	274499	0 %	0 %	50 %	50 %	386348242
6040	NC_017584	GGC	2	6	274507	274512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348242
6041	NC_017584	GAA	2	6	275038	275043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348243
6042	NC_017584	CAG	2	6	275089	275094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6043	NC_017584	CTG	2	6	275098	275103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6044	NC_017584	CGA	2	6	275232	275237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6045	NC_017584	GTC	2	6	275310	275315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6046	NC_017584	CGA	2	6	275373	275378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6047	NC_017584	CGA	2	6	275418	275423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6048	NC_017584	TCAT	3	12	275560	275571	25 %	50 %	0 %	25 %	386348243
6049	NC_017584	GCC	2	6	275572	275577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6050	NC_017584	TCG	2	6	275624	275629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6051	NC_017584	CCG	2	6	275688	275693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6052	NC_017584	GC	3	6	275706	275711	0 %	0 %	50 %	50 %	386348243
6053	NC_017584	CCA	2	6	275729	275734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348243
6054	NC_017584	CCG	2	6	275738	275743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6055	NC_017584	CGA	2	6	275751	275756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6056	NC_017584	CGG	3	9	275768	275776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348243
6057	NC_017584	AAG	2	6	275899	275904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348243
6058	NC_017584	CTG	2	6	275947	275952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6059	NC_017584	GC	3	6	275958	275963	0 %	0 %	50 %	50 %	386348243
6060	NC_017584	CGC	2	6	276009	276014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6061	NC_017584	GCG	2	6	276023	276028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348243
6062	NC_017584	CCG	2	6	276033	276038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6063	NC_017584	GGT	2	6	276072	276077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348243
6064	NC_017584	GCC	2	6	276085	276090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6065	NC_017584	CGA	2	6	276096	276101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348243
6066	NC_017584	CCAC	2	8	276221	276228	25 %	0 %	0 %	75 %	386348243
6067	NC_017584	GATC	2	8	276279	276286	25 %	25 %	25 %	25 %	386348243
6068	NC_017584	TGG	2	6	276293	276298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348243
6069	NC_017584	CCG	2	6	276389	276394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348243
6070	NC_017584	GAG	2	6	276430	276435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348243
6071	NC_017584	ACGCC	2	10	276507	276516	20 %	0 %	20 %	60 %	386348243
6072	NC_017584	AGACAA	2	12	276576	276587	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386348243
6073	NC_017584	CAT	2	6	276595	276600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348243
6074	NC_017584	ATCG	2	8	276636	276643	25 %	25 %	25 %	25 %	386348244
6075	NC_017584	GC	3	6	276709	276714	0 %	0 %	50 %	50 %	386348244
6076	NC_017584	GCG	2	6	276718	276723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348244
6077	NC_017584	CGA	2	6	276818	276823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348244
6078	NC_017584	TCG	2	6	276856	276861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348244
6079	NC_017584	AGC	2	6	276874	276879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348244
6080	NC_017584	CGG	2	6	276941	276946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348244
6081	NC_017584	GCTT	2	8	276989	276996	0 %	50 %	25 %	25 %	386348244
6082	NC_017584	GCG	2	6	277006	277011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348244
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6084	NC_017584	AGC	2	6	277105	277110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348244
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6086	NC_017584	GC	3	6	277122	277127	0 %	0 %	50 %	50 %	386348244
6087	NC_017584	ATC	2	6	277135	277140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348244
6088	NC_017584	CGC	2	6	277145	277150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348244
6089	NC_017584	CAC	2	6	277158	277163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348244
6090	NC_017584	GATCG	2	10	277365	277374	20 %	20 %	40 %	20 %	386348244
6091	NC_017584	GTG	2	6	277393	277398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348244
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6093	NC_017584	GC	3	6	277433	277438	0 %	0 %	50 %	50 %	386348244
6094	NC_017584	CGG	2	6	277475	277480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348244
6095	NC_017584	GC	3	6	277497	277502	0 %	0 %	50 %	50 %	386348244
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6099	NC_017584	CGA	2	6	277598	277603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348245
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6102	NC_017584	CGG	2	6	277786	277791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348245
6103	NC_017584	GCGGG	2	10	277818	277827	0 %	0 %	80 %	20 %	386348245
6104	NC_017584	CCG	2	6	277897	277902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348245
6105	NC_017584	GATCA	2	10	277916	277925	40 %	20 %	20 %	20 %	386348245
6106	NC_017584	GCA	2	6	277951	277956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348245
6107	NC_017584	TCA	2	6	277963	277968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348245
6108	NC_017584	CGA	2	6	278005	278010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348245
6109	NC_017584	CAG	2	6	278021	278026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348245
6110	NC_017584	CGAC	2	8	278038	278045	25 %	0 %	25 %	50 %	386348245
6111	NC_017584	GAT	2	6	278111	278116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348245
6112	NC_017584	GATC	2	8	278137	278144	25 %	25 %	25 %	25 %	386348245
6113	NC_017584	GCG	2	6	278185	278190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348245
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6115	NC_017584	GTCG	2	8	278222	278229	0 %	25 %	50 %	25 %	386348245
6116	NC_017584	G	10	10	278246	278255	0 %	0 %	100 %	0 %	386348245
6117	NC_017584	G	6	6	278257	278262	0 %	0 %	100 %	0 %	386348245
6118	NC_017584	GCC	2	6	278294	278299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348246
6119	NC_017584	GCG	2	6	278307	278312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348246
6120	NC_017584	GCG	2	6	278315	278320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348246
6121	NC_017584	TCG	2	6	278360	278365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348246
6122	NC_017584	GCG	2	6	278470	278475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348246
6123	NC_017584	GGC	2	6	278506	278511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348246
6124	NC_017584	TCC	2	6	278527	278532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348246
6125	NC_017584	CGA	2	6	278554	278559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348246
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6132	NC_017584	GAT	3	9	278815	278823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348246
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6238	NC_017584	TCG	2	6	282752	282757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348250
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6240	NC_017584	CAG	2	6	282775	282780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348250
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6355	NC_017584	CGA	2	6	286854	286859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348252
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6363	NC_017584	GCG	2	6	287057	287062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348252
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6482	NC_017584	CAA	2	6	292111	292116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348256
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6485	NC_017584	CGA	2	6	292186	292191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348256
6486	NC_017584	TGA	2	6	292194	292199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348256
6487	NC_017584	GGT	2	6	292213	292218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348256
6488	NC_017584	AGC	2	6	292224	292229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348256
6489	NC_017584	ACC	2	6	292247	292252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348256
6490	NC_017584	ATC	2	6	292400	292405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348256
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6499	NC_017584	GC	3	6	292883	292888	0 %	0 %	50 %	50 %	386348256
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