MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017584	TCG	2	6	251939	251944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5502	NC_017584	GGC	2	6	251968	251973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5503	NC_017584	CG	3	6	251995	252000	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5504	NC_017584	GTC	2	6	252016	252021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5505	NC_017584	CTG	2	6	252043	252048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5506	NC_017584	GAT	2	6	252076	252081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348221
5507	NC_017584	TCC	2	6	252098	252103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348221
5508	NC_017584	GGC	2	6	252111	252116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5509	NC_017584	CTG	2	6	252154	252159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5510	NC_017584	CGGC	2	8	252233	252240	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5511	NC_017584	CGGC	2	8	252300	252307	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5512	NC_017584	CGGC	2	8	252327	252334	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5513	NC_017584	GGA	2	6	252339	252344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348221
5514	NC_017584	GGGC	2	8	252351	252358	0 %	0 %	75 %	25 %	386348221
5515	NC_017584	CGG	2	6	252366	252371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5516	NC_017584	GCG	3	9	252385	252393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5517	NC_017584	GCGG	2	8	252412	252419	0 %	0 %	75 %	25 %	386348221
5518	NC_017584	GGT	2	6	252529	252534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348221
5519	NC_017584	CCG	2	6	252545	252550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348221
5520	NC_017584	CGA	2	6	252576	252581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5521	NC_017584	TCT	2	6	252582	252587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348221
5522	NC_017584	TGGC	2	8	252593	252600	0 %	25 %	50 %	25 %	386348221
5523	NC_017584	CAG	3	9	252760	252768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5524	NC_017584	CGG	2	6	252795	252800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5525	NC_017584	GTC	2	6	252811	252816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5526	NC_017584	GCA	2	6	252831	252836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5527	NC_017584	GAT	2	6	252865	252870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348221
5528	NC_017584	GC	3	6	252883	252888	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5529	NC_017584	G	9	9	252997	253005	0 %	0 %	100 %	0 %	386348221
5530	NC_017584	CGG	2	6	253017	253022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5531	NC_017584	G	8	8	253026	253033	0 %	0 %	100 %	0 %	386348221
5532	NC_017584	GCA	2	6	253037	253042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5533	NC_017584	G	9	9	253044	253052	0 %	0 %	100 %	0 %	386348221
5534	NC_017584	G	6	6	253319	253324	0 %	0 %	100 %	0 %	386348222
5535	NC_017584	TGG	3	9	253403	253411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348222
5536	NC_017584	CGG	2	6	253436	253441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348222
5537	NC_017584	CTT	3	9	253451	253459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348222
5538	NC_017584	GAA	2	6	253538	253543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348222
5539	NC_017584	GTC	2	6	253548	253553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348222
5540	NC_017584	ACC	2	6	253561	253566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348222
5541	NC_017584	GGA	2	6	253590	253595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348222
5542	NC_017584	GCAGC	2	10	253881	253890	20 %	0 %	40 %	40 %	386348223
5543	NC_017584	CCA	2	6	253925	253930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348223
5544	NC_017584	GC	3	6	253977	253982	0 %	0 %	50 %	50 %	386348223
5545	NC_017584	GCC	2	6	254037	254042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348223
5546	NC_017584	GCG	2	6	254062	254067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348223
5547	NC_017584	GCTT	2	8	254144	254151	0 %	50 %	25 %	25 %	386348223
5548	NC_017584	GGA	2	6	254178	254183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348223
5549	NC_017584	GCG	2	6	254188	254193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348223
5550	NC_017584	CGG	2	6	254403	254408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348224
5551	NC_017584	C	9	9	254430	254438	0 %	0 %	0 %	100 %	386348224
5552	NC_017584	GCGCC	2	10	254468	254477	0 %	0 %	40 %	60 %	386348224
5553	NC_017584	ATT	2	6	254595	254600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348224
5554	NC_017584	GCC	2	6	254762	254767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348224
5555	NC_017584	CG	3	6	254781	254786	0 %	0 %	50 %	50 %	386348224
5556	NC_017584	CG	3	6	254814	254819	0 %	0 %	50 %	50 %	386348224
5557	NC_017584	GAA	2	6	254846	254851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348224
5558	NC_017584	GGAC	2	8	254863	254870	25 %	0 %	50 %	25 %	386348224
5559	NC_017584	CGG	2	6	254920	254925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348224
5560	NC_017584	GAG	2	6	254939	254944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348224
5561	NC_017584	GCT	2	6	255083	255088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5562	NC_017584	CGA	2	6	255202	255207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5563	NC_017584	TGA	2	6	255273	255278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348225
5564	NC_017584	TCC	2	6	255453	255458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348225
5565	NC_017584	ACG	2	6	255501	255506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5566	NC_017584	CGGG	2	8	255508	255515	0 %	0 %	75 %	25 %	386348225
5567	NC_017584	GATGT	2	10	255518	255527	20 %	40 %	40 %	0 %	386348225
5568	NC_017584	ACC	2	6	255650	255655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348225
5569	NC_017584	CAG	2	6	255674	255679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5570	NC_017584	ATCA	2	8	255680	255687	50 %	25 %	0 %	25 %	386348225
5571	NC_017584	TCG	2	6	255711	255716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5572	NC_017584	ACG	2	6	255738	255743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348225
5573	NC_017584	TCA	2	6	255849	255854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348225
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5584	NC_017584	CGGG	2	8	256234	256241	0 %	0 %	75 %	25 %	386348226
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5589	NC_017584	CCA	2	6	256352	256357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348226
5590	NC_017584	ACCG	2	8	256385	256392	25 %	0 %	25 %	50 %	386348226
5591	NC_017584	GC	3	6	256431	256436	0 %	0 %	50 %	50 %	386348226
5592	NC_017584	GGGGC	2	10	256449	256458	0 %	0 %	80 %	20 %	386348226
5593	NC_017584	GGC	2	6	256472	256477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
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5600	NC_017584	GCCC	2	8	256846	256853	0 %	0 %	25 %	75 %	386348226
5601	NC_017584	GCG	2	6	256915	256920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
5602	NC_017584	CAG	2	6	256944	256949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348226
5603	NC_017584	GCG	2	6	256969	256974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348226
5604	NC_017584	CGA	2	6	257021	257026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348226
5605	NC_017584	GAC	3	9	257028	257036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348226
5606	NC_017584	GGT	2	6	257075	257080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348226
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5608	NC_017584	GC	3	6	257123	257128	0 %	0 %	50 %	50 %	386348226
5609	NC_017584	CGC	2	6	257149	257154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348226
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5624	NC_017584	CGGC	2	8	257690	257697	0 %	0 %	50 %	50 %	386348226
5625	NC_017584	CGA	2	6	257744	257749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348226
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5739	NC_017584	ACCG	2	8	261463	261470	25 %	0 %	25 %	50 %	386348227
5740	NC_017584	TGG	2	6	261515	261520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348227
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5853	NC_017584	AAAGC	2	10	265649	265658	60 %	0 %	20 %	20 %	386348233
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5862	NC_017584	CGGCGC	2	12	266513	266524	0 %	0 %	50 %	50 %	386348234
5863	NC_017584	CGGC	2	8	266543	266550	0 %	0 %	50 %	50 %	386348234
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5986	NC_017584	CGG	2	6	272415	272420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348241
5987	NC_017584	GCG	2	6	272429	272434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348241
5988	NC_017584	TGG	2	6	272451	272456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348241
5989	NC_017584	ATC	2	6	272570	272575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348241
5990	NC_017584	CGGC	2	8	272580	272587	0 %	0 %	50 %	50 %	386348241
5991	NC_017584	ATCG	2	8	272593	272600	25 %	25 %	25 %	25 %	386348241
5992	NC_017584	CCA	2	6	272601	272606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348241
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5994	NC_017584	GCA	2	6	272658	272663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348241
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5997	NC_017584	GCGG	2	8	272704	272711	0 %	0 %	75 %	25 %	386348241
5998	NC_017584	GCC	3	9	272785	272793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348241
5999	NC_017584	GAT	3	9	272794	272802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348241
6000	NC_017584	AGC	2	6	272831	272836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348241

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