MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 99397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017584	TCG	2	6	227323	227328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5002	NC_017584	CAG	2	6	227352	227357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5003	NC_017584	CG	3	6	227358	227363	0 %	0 %	50 %	50 %	386348208
5004	NC_017584	GTT	2	6	227378	227383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348208
5005	NC_017584	GCG	2	6	227479	227484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348208
5006	NC_017584	CCA	2	6	227486	227491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348208
5007	NC_017584	TCG	2	6	227497	227502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5008	NC_017584	TGT	2	6	227528	227533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348208
5009	NC_017584	GTC	2	6	227544	227549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5010	NC_017584	GCA	2	6	227567	227572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5011	NC_017584	CGT	2	6	227654	227659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5012	NC_017584	GC	3	6	227664	227669	0 %	0 %	50 %	50 %	386348208
5013	NC_017584	CGT	2	6	227721	227726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5014	NC_017584	TCG	2	6	227782	227787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5015	NC_017584	GTT	2	6	227820	227825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348208
5016	NC_017584	CCA	2	6	227918	227923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348208
5017	NC_017584	GCA	2	6	227924	227929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5018	NC_017584	GAGC	2	8	227931	227938	25 %	0 %	50 %	25 %	386348208
5019	NC_017584	CTC	2	6	228005	228010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348208
5020	NC_017584	GGCCAT	2	12	228069	228080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5021	NC_017584	AGC	2	6	228214	228219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5022	NC_017584	CGG	2	6	228323	228328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348208
5023	NC_017584	ACC	2	6	228352	228357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348208
5024	NC_017584	GTC	3	9	228457	228465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348208
5025	NC_017584	GAA	2	6	228489	228494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348208
5026	NC_017584	GAT	2	6	228515	228520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348208
5027	NC_017584	CAT	2	6	228522	228527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348208
5028	NC_017584	CAT	2	6	228546	228551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348208
5029	NC_017584	TGA	2	6	228563	228568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348208
5030	NC_017584	CGC	2	6	228618	228623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348208
5031	NC_017584	GCG	2	6	228703	228708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348208
5032	NC_017584	ACGGC	2	10	228710	228719	20 %	0 %	40 %	40 %	386348208
5033	NC_017584	CCG	2	6	228756	228761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348208
5034	NC_017584	CG	3	6	228766	228771	0 %	0 %	50 %	50 %	386348208
5035	NC_017584	ATC	2	6	228811	228816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348208
5036	NC_017584	GGC	2	6	228955	228960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348209
5037	NC_017584	CAA	2	6	228967	228972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348209
5038	NC_017584	CGTC	2	8	228975	228982	0 %	25 %	25 %	50 %	386348209
5039	NC_017584	TGA	2	6	229039	229044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348209
5040	NC_017584	GCG	2	6	229085	229090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348209
5041	NC_017584	GTT	2	6	229177	229182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348209
5042	NC_017584	CCG	2	6	229188	229193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348209
5043	NC_017584	ATG	2	6	229248	229253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348209
5044	NC_017584	GCC	2	6	229278	229283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348209
5045	NC_017584	GC	3	6	229312	229317	0 %	0 %	50 %	50 %	386348209
5046	NC_017584	CAA	2	6	229349	229354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348209
5047	NC_017584	CGC	2	6	229423	229428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348209
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5049	NC_017584	GGT	2	6	229484	229489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348209
5050	NC_017584	CGG	2	6	229532	229537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348209
5051	NC_017584	GTC	2	6	229553	229558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5052	NC_017584	GA	3	6	229610	229615	50 %	0 %	50 %	0 %	386348209
5053	NC_017584	GTG	2	6	229626	229631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348209
5054	NC_017584	GCC	2	6	229637	229642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348209
5055	NC_017584	TGA	2	6	229720	229725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348209
5056	NC_017584	CAG	2	6	229757	229762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5057	NC_017584	CAG	2	6	229802	229807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5058	NC_017584	GCC	2	6	229814	229819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348209
5059	NC_017584	GCA	2	6	229825	229830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5060	NC_017584	CCA	2	6	229855	229860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348209
5061	NC_017584	CGA	2	6	229900	229905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5062	NC_017584	GTC	2	6	229919	229924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348209
5063	NC_017584	TCGT	2	8	229927	229934	0 %	50 %	25 %	25 %	386348209
5064	NC_017584	TGA	2	6	229975	229980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348209
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5068	NC_017584	GCCC	2	8	230156	230163	0 %	0 %	25 %	75 %	386348209
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5092	NC_017584	TTG	2	6	231665	231670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348210
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5101	NC_017584	CCT	2	6	231882	231887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348210
5102	NC_017584	TTG	2	6	231911	231916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348210
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5104	NC_017584	GACG	2	8	231940	231947	25 %	0 %	50 %	25 %	386348210
5105	NC_017584	GC	3	6	231969	231974	0 %	0 %	50 %	50 %	386348210
5106	NC_017584	GTT	2	6	232114	232119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348210
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5109	NC_017584	GCA	2	6	232458	232463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348210
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5111	NC_017584	GC	3	6	232614	232619	0 %	0 %	50 %	50 %	386348210
5112	NC_017584	CATG	2	8	232620	232627	25 %	25 %	25 %	25 %	386348210
5113	NC_017584	TCC	2	6	232658	232663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348210
5114	NC_017584	GCCG	2	8	232693	232700	0 %	0 %	50 %	50 %	386348210
5115	NC_017584	GTC	2	6	232817	232822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348210
5116	NC_017584	TGGA	2	8	233369	233376	25 %	25 %	50 %	0 %	386348211
5117	NC_017584	CCG	3	9	233378	233386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348211
5118	NC_017584	GAG	2	6	233399	233404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348211
5119	NC_017584	GGGT	3	12	233408	233419	0 %	25 %	75 %	0 %	386348211
5120	NC_017584	CG	3	6	233460	233465	0 %	0 %	50 %	50 %	386348211
5121	NC_017584	GCA	2	6	233483	233488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348211
5122	NC_017584	AG	3	6	233602	233607	50 %	0 %	50 %	0 %	386348211
5123	NC_017584	GAGT	2	8	233656	233663	25 %	25 %	50 %	0 %	386348211
5124	NC_017584	GCC	2	6	233860	233865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348212
5125	NC_017584	CGTC	2	8	233869	233876	0 %	25 %	25 %	50 %	386348212
5126	NC_017584	CTG	2	6	233886	233891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348212
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5129	NC_017584	GTG	2	6	233943	233948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348212
5130	NC_017584	GCC	2	6	234006	234011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348212
5131	NC_017584	GAT	3	9	234023	234031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348212
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5134	NC_017584	GGC	2	6	234116	234121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348212
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5138	NC_017584	GCT	2	6	234167	234172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348212
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5142	NC_017584	ACG	2	6	234379	234384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348212
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5144	NC_017584	TCGC	2	8	234549	234556	0 %	25 %	25 %	50 %	386348212
5145	NC_017584	GGT	2	6	234629	234634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348212
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5151	NC_017584	TGA	2	6	234799	234804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348212
5152	NC_017584	GCGTT	2	10	234823	234832	0 %	40 %	40 %	20 %	386348212
5153	NC_017584	CTG	2	6	234852	234857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348212
5154	NC_017584	GCG	2	6	234858	234863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348212
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5161	NC_017584	GTGCT	2	10	235071	235080	0 %	40 %	40 %	20 %	386348212
5162	NC_017584	TGG	2	6	235119	235124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348212
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5178	NC_017584	CG	3	6	236409	236414	0 %	0 %	50 %	50 %	386348213
5179	NC_017584	GGC	2	6	236496	236501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348213
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5230	NC_017584	GCC	2	6	238842	238847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348215
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5239	NC_017584	GGC	2	6	239252	239257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348215
5240	NC_017584	CTT	2	6	239259	239264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348215
5241	NC_017584	GTG	2	6	239274	239279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348215
5242	NC_017584	CGC	2	6	239309	239314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348215
5243	NC_017584	ACG	2	6	239316	239321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
5244	NC_017584	GGC	2	6	239345	239350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348215
5245	NC_017584	ACC	2	6	239373	239378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348215
5246	NC_017584	GC	3	6	239399	239404	0 %	0 %	50 %	50 %	386348215
5247	NC_017584	GC	3	6	239422	239427	0 %	0 %	50 %	50 %	386348215
5248	NC_017584	GCTCAA	2	12	239456	239467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386348215
5249	NC_017584	GCA	2	6	239470	239475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
5250	NC_017584	CGG	2	6	239491	239496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348215
5251	NC_017584	CGA	2	6	239522	239527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
5252	NC_017584	CAT	2	6	239579	239584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348215
5253	NC_017584	ATC	2	6	239760	239765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348215
5254	NC_017584	CGG	2	6	239852	239857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348215
5255	NC_017584	CAG	3	9	239943	239951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
5256	NC_017584	GTG	2	6	240006	240011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348215
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5258	NC_017584	GAC	2	6	240057	240062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
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5262	NC_017584	GCC	2	6	240144	240149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348215
5263	NC_017584	GCG	2	6	240162	240167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348215
5264	NC_017584	TCG	2	6	240226	240231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348215
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5267	NC_017584	GCC	2	6	240412	240417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348215
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5271	NC_017584	CAG	2	6	240561	240566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348215
5272	NC_017584	CCCG	3	12	240613	240624	0 %	0 %	25 %	75 %	386348215
5273	NC_017584	ATC	2	6	240759	240764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348215
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5275	NC_017584	GGT	2	6	240794	240799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348215
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5280	NC_017584	CGC	2	6	240947	240952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348215
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5284	NC_017584	GCCG	2	8	241247	241254	0 %	0 %	50 %	50 %	386348215
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5350	NC_017584	G	7	7	244186	244192	0 %	0 %	100 %	0 %	386348216
5351	NC_017584	CCG	2	6	244274	244279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348216
5352	NC_017584	CG	3	6	244359	244364	0 %	0 %	50 %	50 %	386348216
5353	NC_017584	CGC	2	6	244420	244425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348216
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5356	NC_017584	CGC	2	6	244614	244619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348216
5357	NC_017584	GGC	2	6	244631	244636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348216
5358	NC_017584	CGAT	2	8	245837	245844	25 %	25 %	25 %	25 %	386348217
5359	NC_017584	CAGGG	2	10	245878	245887	20 %	0 %	60 %	20 %	386348217
5360	NC_017584	GCA	2	6	245912	245917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348217
5361	NC_017584	CTCGG	2	10	246190	246199	0 %	20 %	40 %	40 %	386348218
5362	NC_017584	GCC	3	9	246216	246224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348218
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5487	NC_017584	GCG	2	6	251430	251435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5488	NC_017584	CGG	2	6	251440	251445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221
5489	NC_017584	TTC	2	6	251449	251454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348221
5490	NC_017584	GCC	3	9	251477	251485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348221
5491	NC_017584	GCAA	2	8	251543	251550	50 %	0 %	25 %	25 %	386348221
5492	NC_017584	GGTG	2	8	251562	251569	0 %	25 %	75 %	0 %	386348221
5493	NC_017584	GCA	2	6	251574	251579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5494	NC_017584	CGC	2	6	251647	251652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348221
5495	NC_017584	CGCC	2	8	251682	251689	0 %	0 %	25 %	75 %	386348221
5496	NC_017584	CGT	2	6	251736	251741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348221
5497	NC_017584	CCGAT	2	10	251799	251808	20 %	20 %	20 %	40 %	386348221
5498	NC_017584	ATC	2	6	251831	251836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348221
5499	NC_017584	CGGC	2	8	251874	251881	0 %	0 %	50 %	50 %	386348221
5500	NC_017584	CGG	2	6	251904	251909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348221

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