MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017569	GTA	2	6	206343	206348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320611
4002	NC_017569	TAAA	2	8	206371	206378	75 %	25 %	0 %	0 %	386320611
4003	NC_017569	TAA	2	6	206383	206388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320611
4004	NC_017569	AG	3	6	206409	206414	50 %	0 %	50 %	0 %	386320611
4005	NC_017569	A	7	7	206432	206438	100 %	0 %	0 %	0 %	386320611
4006	NC_017569	ACC	2	6	206454	206459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320611
4007	NC_017569	TCC	2	6	206540	206545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320611
4008	NC_017569	AT	4	8	206554	206561	50 %	50 %	0 %	0 %	386320611
4009	NC_017569	GAC	2	6	206868	206873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320612
4010	NC_017569	TGA	2	6	207007	207012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320612
4011	NC_017569	CTA	2	6	207025	207030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320612
4012	NC_017569	ATT	2	6	207032	207037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320612
4013	NC_017569	T	6	6	207091	207096	0 %	100 %	0 %	0 %	386320612
4014	NC_017569	CTT	2	6	207187	207192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320612
4015	NC_017569	CTA	2	6	207214	207219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320612
4016	NC_017569	CCA	2	6	207279	207284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320612
4017	NC_017569	TC	3	6	207361	207366	0 %	50 %	0 %	50 %	386320612
4018	NC_017569	ACC	2	6	207392	207397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320612
4019	NC_017569	CAT	3	9	207479	207487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320612
4020	NC_017569	GCG	2	6	207603	207608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320612
4021	NC_017569	TTC	2	6	207671	207676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320612
4022	NC_017569	AAAG	2	8	207853	207860	75 %	0 %	25 %	0 %	386320613
4023	NC_017569	GAA	2	6	207877	207882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320613
4024	NC_017569	AC	3	6	207883	207888	50 %	0 %	0 %	50 %	386320613
4025	NC_017569	CAA	2	6	207890	207895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320613
4026	NC_017569	CAG	2	6	207960	207965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320613
4027	NC_017569	TA	3	6	208067	208072	50 %	50 %	0 %	0 %	386320613
4028	NC_017569	TAC	2	6	208144	208149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320613
4029	NC_017569	AT	3	6	208162	208167	50 %	50 %	0 %	0 %	386320613
4030	NC_017569	AAG	2	6	208179	208184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320613
4031	NC_017569	AAT	2	6	208244	208249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320613
4032	NC_017569	GGA	2	6	208300	208305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320613
4033	NC_017569	GAC	2	6	208326	208331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320613
4034	NC_017569	A	7	7	208371	208377	100 %	0 %	0 %	0 %	386320613
4035	NC_017569	AGA	2	6	208408	208413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320613
4036	NC_017569	TGA	2	6	208441	208446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320613
4037	NC_017569	AAC	2	6	208542	208547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320613
4038	NC_017569	GGC	2	6	208577	208582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320613
4039	NC_017569	A	6	6	208605	208610	100 %	0 %	0 %	0 %	386320613
4040	NC_017569	GGA	2	6	208612	208617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320613
4041	NC_017569	TGG	2	6	208624	208629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320613
4042	NC_017569	T	6	6	208670	208675	0 %	100 %	0 %	0 %	386320613
4043	NC_017569	AAG	2	6	208698	208703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320613
4044	NC_017569	ACT	2	6	208711	208716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320613
4045	NC_017569	CAA	2	6	208720	208725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320613
4046	NC_017569	CTC	2	6	208776	208781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320613
4047	NC_017569	CAC	2	6	208831	208836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320613
4048	NC_017569	GAA	2	6	208973	208978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320613
4049	NC_017569	CAC	2	6	209034	209039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320613
4050	NC_017569	CTC	2	6	209046	209051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320613
4051	NC_017569	CAA	2	6	209053	209058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320613
4052	NC_017569	TAT	2	6	209162	209167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320613
4053	NC_017569	GAT	2	6	209168	209173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320613
4054	NC_017569	GAAAC	2	10	209218	209227	60 %	0 %	20 %	20 %	386320613
4055	NC_017569	TGG	2	6	209263	209268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320613
4056	NC_017569	CAAAA	2	10	209270	209279	80 %	0 %	0 %	20 %	386320613
4057	NC_017569	A	6	6	209387	209392	100 %	0 %	0 %	0 %	386320614
4058	NC_017569	T	6	6	209424	209429	0 %	100 %	0 %	0 %	386320614
4059	NC_017569	TGG	2	6	209469	209474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320614
4060	NC_017569	A	8	8	209584	209591	100 %	0 %	0 %	0 %	386320614
4061	NC_017569	TTATGT	2	12	209612	209623	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386320614
4062	NC_017569	ATC	2	6	209671	209676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320614
4063	NC_017569	A	6	6	209783	209788	100 %	0 %	0 %	0 %	386320614
4064	NC_017569	CTT	2	6	209836	209841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320614
4065	NC_017569	AGG	2	6	209861	209866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320614
4066	NC_017569	TTA	2	6	209881	209886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320614
4067	NC_017569	TGA	2	6	209920	209925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320614
4068	NC_017569	A	6	6	209979	209984	100 %	0 %	0 %	0 %	386320614
4069	NC_017569	TGG	2	6	210086	210091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320614
4070	NC_017569	GAT	2	6	210101	210106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320614
4071	NC_017569	TAT	3	9	210191	210199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320614
4072	NC_017569	GAG	2	6	210221	210226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320614
4073	NC_017569	TGG	2	6	210247	210252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320614
4074	NC_017569	CAT	2	6	210275	210280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320614
4075	NC_017569	GTG	2	6	210498	210503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320614
4076	NC_017569	TAG	2	6	210550	210555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320614
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4078	NC_017569	A	6	6	210567	210572	100 %	0 %	0 %	0 %	386320614
4079	NC_017569	AT	3	6	210593	210598	50 %	50 %	0 %	0 %	386320614
4080	NC_017569	ATT	2	6	210665	210670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320615
4081	NC_017569	TA	3	6	210703	210708	50 %	50 %	0 %	0 %	386320615
4082	NC_017569	GCA	2	6	210748	210753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320615
4083	NC_017569	TAA	2	6	210758	210763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320615
4084	NC_017569	GAG	2	6	210773	210778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320615
4085	NC_017569	TTA	2	6	210805	210810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320615
4086	NC_017569	TCT	2	6	210814	210819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320615
4087	NC_017569	AGA	2	6	210840	210845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320615
4088	NC_017569	TCC	2	6	210855	210860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320615
4089	NC_017569	AGT	2	6	210873	210878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320615
4090	NC_017569	GAA	2	6	210902	210907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320615
4091	NC_017569	TTTA	2	8	210954	210961	25 %	75 %	0 %	0 %	386320615
4092	NC_017569	CACT	2	8	211007	211014	25 %	25 %	0 %	50 %	386320615
4093	NC_017569	GTA	2	6	211027	211032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320615
4094	NC_017569	TTA	2	6	211036	211041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320615
4095	NC_017569	GAA	3	9	211093	211101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320615
4096	NC_017569	TTCCC	2	10	211114	211123	0 %	40 %	0 %	60 %	386320615
4097	NC_017569	AGA	2	6	211152	211157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320615
4098	NC_017569	CTA	2	6	211250	211255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4099	NC_017569	CAT	2	6	211257	211262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4100	NC_017569	CAAAA	2	10	211345	211354	80 %	0 %	0 %	20 %	386320616
4101	NC_017569	CTT	2	6	211359	211364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320616
4102	NC_017569	ACC	2	6	211553	211558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320616
4103	NC_017569	TCCA	2	8	211564	211571	25 %	25 %	0 %	50 %	386320616
4104	NC_017569	CAT	2	6	211578	211583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4105	NC_017569	AGA	2	6	211636	211641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320616
4106	NC_017569	AACC	2	8	211702	211709	50 %	0 %	0 %	50 %	386320616
4107	NC_017569	GTA	2	6	211748	211753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320616
4108	NC_017569	ATA	2	6	211754	211759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320616
4109	NC_017569	TCA	2	6	211778	211783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4110	NC_017569	TA	3	6	211798	211803	50 %	50 %	0 %	0 %	386320616
4111	NC_017569	TAT	2	6	211848	211853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320616
4112	NC_017569	ATAC	2	8	211878	211885	50 %	25 %	0 %	25 %	386320616
4113	NC_017569	ACA	2	6	211955	211960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320616
4114	NC_017569	CAT	2	6	211995	212000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4115	NC_017569	AAG	2	6	212001	212006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320616
4116	NC_017569	ACT	2	6	212045	212050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4117	NC_017569	CAT	2	6	212220	212225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4118	NC_017569	TTA	2	6	212231	212236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320616
4119	NC_017569	ACA	2	6	212282	212287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320616
4120	NC_017569	CTTT	2	8	212306	212313	0 %	75 %	0 %	25 %	386320616
4121	NC_017569	TATC	2	8	212376	212383	25 %	50 %	0 %	25 %	386320616
4122	NC_017569	AGT	2	6	212389	212394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320616
4123	NC_017569	GCT	2	6	212423	212428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320616
4124	NC_017569	TAC	2	6	212445	212450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4125	NC_017569	ATA	2	6	212458	212463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320616
4126	NC_017569	TA	3	6	212509	212514	50 %	50 %	0 %	0 %	386320616
4127	NC_017569	CTG	2	6	212520	212525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320616
4128	NC_017569	TAC	2	6	212563	212568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
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4130	NC_017569	TCC	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320616
4131	NC_017569	TAT	2	6	212703	212708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320616
4132	NC_017569	TCCA	2	8	212787	212794	25 %	25 %	0 %	50 %	386320616
4133	NC_017569	TTG	2	6	212908	212913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320616
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4139	NC_017569	TGA	2	6	213226	213231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320616
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4142	NC_017569	CAT	2	6	213402	213407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
4143	NC_017569	AATT	2	8	213453	213460	50 %	50 %	0 %	0 %	386320616
4144	NC_017569	CAT	2	6	213477	213482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320616
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4148	NC_017569	TCTGA	2	10	213613	213622	20 %	40 %	20 %	20 %	386320616
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4150	NC_017569	TGG	2	6	213657	213662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320616
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4154	NC_017569	TCC	2	6	213763	213768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320616
4155	NC_017569	CA	4	8	213783	213790	50 %	0 %	0 %	50 %	386320616
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4230	NC_017569	TAG	2	6	217417	217422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320620
4231	NC_017569	AAG	2	6	217473	217478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320620
4232	NC_017569	AAG	2	6	217485	217490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320620
4233	NC_017569	CAT	2	6	217533	217538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320620
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4236	NC_017569	CATT	2	8	217794	217801	25 %	50 %	0 %	25 %	386320620
4237	NC_017569	A	6	6	217810	217815	100 %	0 %	0 %	0 %	386320620
4238	NC_017569	CTG	2	6	217840	217845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320620
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4240	NC_017569	TGT	2	6	217910	217915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320620
4241	NC_017569	CGGAA	2	10	218081	218090	40 %	0 %	40 %	20 %	386320620
4242	NC_017569	CGAA	2	8	218101	218108	50 %	0 %	25 %	25 %	386320620
4243	NC_017569	ACT	2	6	218284	218289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320620
4244	NC_017569	ATA	2	6	218336	218341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320620
4245	NC_017569	TAAA	2	8	218394	218401	75 %	25 %	0 %	0 %	386320620
4246	NC_017569	TAA	2	6	218463	218468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320620
4247	NC_017569	ACC	2	6	218537	218542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320620
4248	NC_017569	A	6	6	218626	218631	100 %	0 %	0 %	0 %	386320620
4249	NC_017569	CGA	2	6	218635	218640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320620
4250	NC_017569	TCC	2	6	218683	218688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320620
4251	NC_017569	TTA	2	6	218697	218702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320620
4252	NC_017569	T	6	6	218946	218951	0 %	100 %	0 %	0 %	386320621
4253	NC_017569	CTT	2	6	218952	218957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
4254	NC_017569	ATC	2	6	219007	219012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320621
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4257	NC_017569	CCG	2	6	219195	219200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320621
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4259	NC_017569	GTC	2	6	219343	219348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320621
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4261	NC_017569	CTG	2	6	219384	219389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320621
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4266	NC_017569	TTC	2	6	219601	219606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
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4273	NC_017569	TCAT	2	8	220127	220134	25 %	50 %	0 %	25 %	386320621
4274	NC_017569	ATAC	2	8	220146	220153	50 %	25 %	0 %	25 %	386320621
4275	NC_017569	CTT	2	6	220269	220274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
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4294	NC_017569	TTTG	2	8	221035	221042	0 %	75 %	25 %	0 %	386320622
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4298	NC_017569	TACTT	2	10	221309	221318	20 %	60 %	0 %	20 %	386320622
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4309	NC_017569	TAA	2	6	221792	221797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
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4337	NC_017569	AT	3	6	224316	224321	50 %	50 %	0 %	0 %	386320625
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4340	NC_017569	CTAAAG	2	12	224401	224412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386320625
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4348	NC_017569	CCTC	2	8	226039	226046	0 %	25 %	0 %	75 %	386320626
4349	NC_017569	CAT	2	6	226115	226120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320626
4350	NC_017569	CTG	2	6	226295	226300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320626
4351	NC_017569	GTA	2	6	226318	226323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320626
4352	NC_017569	ACT	2	6	226332	226337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320626
4353	NC_017569	ATT	2	6	226454	226459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320627
4354	NC_017569	ATTC	2	8	226509	226516	25 %	50 %	0 %	25 %	386320627
4355	NC_017569	TCT	2	6	226546	226551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320627
4356	NC_017569	TGC	2	6	226665	226670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320627
4357	NC_017569	A	6	6	226725	226730	100 %	0 %	0 %	0 %	386320627
4358	NC_017569	TAATA	2	10	226757	226766	60 %	40 %	0 %	0 %	386320627
4359	NC_017569	GA	3	6	226782	226787	50 %	0 %	50 %	0 %	386320627
4360	NC_017569	TATC	2	8	226832	226839	25 %	50 %	0 %	25 %	386320627
4361	NC_017569	CATTC	2	10	226844	226853	20 %	40 %	0 %	40 %	386320627
4362	NC_017569	TAGTT	2	10	226926	226935	20 %	60 %	20 %	0 %	386320627
4363	NC_017569	TA	3	6	226938	226943	50 %	50 %	0 %	0 %	386320627
4364	NC_017569	TAC	2	6	226986	226991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320627
4365	NC_017569	ATG	2	6	226996	227001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320627
4366	NC_017569	CCT	2	6	227128	227133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320627
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4493	NC_017569	TCT	2	6	234166	234171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320632
4494	NC_017569	TCA	2	6	234211	234216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320632
4495	NC_017569	AAT	2	6	234256	234261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320632
4496	NC_017569	AGA	2	6	234312	234317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320632
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4500	NC_017569	GTT	2	6	234549	234554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320632

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