MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017569	TAGT	2	8	48708	48715	25 %	50 %	25 %	0 %	386320431
1003	NC_017569	A	6	6	48734	48739	100 %	0 %	0 %	0 %	386320431
1004	NC_017569	TTC	2	6	48803	48808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320431
1005	NC_017569	AGG	2	6	48859	48864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320431
1006	NC_017569	AGA	2	6	48923	48928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320431
1007	NC_017569	T	6	6	48943	48948	0 %	100 %	0 %	0 %	386320431
1008	NC_017569	CTT	2	6	49017	49022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320431
1009	NC_017569	AAT	2	6	49079	49084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320431
1010	NC_017569	ATT	2	6	49101	49106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320431
1011	NC_017569	TAT	2	6	49236	49241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320431
1012	NC_017569	TA	3	6	49251	49256	50 %	50 %	0 %	0 %	386320431
1013	NC_017569	CTT	2	6	49284	49289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320431
1014	NC_017569	AT	3	6	49333	49338	50 %	50 %	0 %	0 %	386320431
1015	NC_017569	A	6	6	49359	49364	100 %	0 %	0 %	0 %	386320431
1016	NC_017569	TGC	2	6	49396	49401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320431
1017	NC_017569	A	7	7	49485	49491	100 %	0 %	0 %	0 %	386320431
1018	NC_017569	AG	3	6	49493	49498	50 %	0 %	50 %	0 %	386320431
1019	NC_017569	CAA	2	6	49546	49551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320431
1020	NC_017569	ATT	2	6	49602	49607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320431
1021	NC_017569	CTG	2	6	49614	49619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320431
1022	NC_017569	ACG	2	6	49629	49634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320431
1023	NC_017569	CAA	2	6	49641	49646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320431
1024	NC_017569	GTAT	2	8	49692	49699	25 %	50 %	25 %	0 %	386320431
1025	NC_017569	CTG	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320431
1026	NC_017569	TAT	2	6	49738	49743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320431
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1029	NC_017569	A	6	6	49801	49806	100 %	0 %	0 %	0 %	386320431
1030	NC_017569	CGGA	2	8	49863	49870	25 %	0 %	50 %	25 %	386320431
1031	NC_017569	TA	3	6	49878	49883	50 %	50 %	0 %	0 %	386320431
1032	NC_017569	GCT	3	9	49994	50002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320431
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1034	NC_017569	AGT	2	6	50119	50124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320431
1035	NC_017569	AGA	2	6	50174	50179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320431
1036	NC_017569	AAG	2	6	50254	50259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320431
1037	NC_017569	AAC	2	6	50269	50274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320431
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1039	NC_017569	TAG	2	6	50386	50391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320432
1040	NC_017569	ATTT	2	8	50409	50416	25 %	75 %	0 %	0 %	386320432
1041	NC_017569	T	6	6	50414	50419	0 %	100 %	0 %	0 %	386320432
1042	NC_017569	AGA	2	6	50458	50463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320432
1043	NC_017569	T	6	6	50532	50537	0 %	100 %	0 %	0 %	386320432
1044	NC_017569	TATC	2	8	50571	50578	25 %	50 %	0 %	25 %	386320432
1045	NC_017569	TAT	2	6	50605	50610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320432
1046	NC_017569	TAT	2	6	50664	50669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320432
1047	NC_017569	TAA	2	6	50707	50712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320432
1048	NC_017569	ATC	2	6	50787	50792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320432
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1055	NC_017569	AAG	2	6	51189	51194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320432
1056	NC_017569	TAG	2	6	51286	51291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320432
1057	NC_017569	AGA	2	6	51382	51387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320432
1058	NC_017569	TTC	2	6	51399	51404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320432
1059	NC_017569	TC	3	6	51416	51421	0 %	50 %	0 %	50 %	386320432
1060	NC_017569	ATT	2	6	51434	51439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320432
1061	NC_017569	ACT	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320432
1062	NC_017569	CTA	2	6	51548	51553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320432
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1064	NC_017569	GATT	2	8	51616	51623	25 %	50 %	25 %	0 %	386320433
1065	NC_017569	CTT	2	6	51706	51711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320433
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1067	NC_017569	T	7	7	51786	51792	0 %	100 %	0 %	0 %	386320433
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1070	NC_017569	CTT	2	6	51880	51885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320433
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1082	NC_017569	GAAG	2	8	52242	52249	50 %	0 %	50 %	0 %	386320434
1083	NC_017569	TAAA	2	8	52261	52268	75 %	25 %	0 %	0 %	386320434
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1089	NC_017569	TCA	2	6	52585	52590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320434
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1099	NC_017569	CTT	2	6	52977	52982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320435
1100	NC_017569	GTTT	2	8	53147	53154	0 %	75 %	25 %	0 %	386320435
1101	NC_017569	A	6	6	53196	53201	100 %	0 %	0 %	0 %	386320435
1102	NC_017569	ATAG	2	8	53212	53219	50 %	25 %	25 %	0 %	386320435
1103	NC_017569	TTGT	2	8	53252	53259	0 %	75 %	25 %	0 %	386320435
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1107	NC_017569	TGGAA	2	10	53440	53449	40 %	20 %	40 %	0 %	386320436
1108	NC_017569	TAT	2	6	53489	53494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320436
1109	NC_017569	GATA	2	8	53534	53541	50 %	25 %	25 %	0 %	386320436
1110	NC_017569	ACC	2	6	53585	53590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320436
1111	NC_017569	CAT	2	6	53696	53701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320436
1112	NC_017569	ATA	2	6	53737	53742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320436
1113	NC_017569	TCTTT	2	10	53786	53795	0 %	80 %	0 %	20 %	386320436
1114	NC_017569	TAG	2	6	53800	53805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320436
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1117	NC_017569	T	7	7	53879	53885	0 %	100 %	0 %	0 %	386320436
1118	NC_017569	TGA	2	6	53966	53971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320436
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1121	NC_017569	CTT	2	6	54031	54036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320436
1122	NC_017569	ATAA	2	8	54245	54252	75 %	25 %	0 %	0 %	386320436
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1126	NC_017569	GCA	2	6	54472	54477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320436
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