MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017569	T	6	6	23410	23415	0 %	100 %	0 %	0 %	386320412
502	NC_017569	TC	3	6	23433	23438	0 %	50 %	0 %	50 %	386320412
503	NC_017569	TCC	3	9	23443	23451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320412
504	NC_017569	TAC	2	6	23463	23468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
505	NC_017569	CTA	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
506	NC_017569	TAG	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
507	NC_017569	TTC	2	6	23619	23624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320412
508	NC_017569	TAT	2	6	23637	23642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320412
509	NC_017569	CAT	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
510	NC_017569	TAG	2	6	23668	23673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
511	NC_017569	TTTA	2	8	23716	23723	25 %	75 %	0 %	0 %	386320412
512	NC_017569	TAG	2	6	23796	23801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
513	NC_017569	AATA	2	8	23845	23852	75 %	25 %	0 %	0 %	386320412
514	NC_017569	TTC	2	6	24488	24493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320413
515	NC_017569	CAAC	2	8	24548	24555	50 %	0 %	0 %	50 %	386320413
516	NC_017569	GAG	2	6	24583	24588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320413
517	NC_017569	TCA	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320414
518	NC_017569	CTT	2	6	25040	25045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
519	NC_017569	AAG	2	6	25062	25067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320414
520	NC_017569	CTT	2	6	25082	25087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
521	NC_017569	TAA	2	6	25103	25108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
522	NC_017569	TA	3	6	25137	25142	50 %	50 %	0 %	0 %	386320414
523	NC_017569	T	6	6	25156	25161	0 %	100 %	0 %	0 %	386320414
524	NC_017569	TTCTT	2	10	25174	25183	0 %	80 %	0 %	20 %	386320414
525	NC_017569	TATTT	2	10	25284	25293	20 %	80 %	0 %	0 %	386320414
526	NC_017569	AAAT	2	8	25377	25384	75 %	25 %	0 %	0 %	386320414
527	NC_017569	TAG	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
528	NC_017569	CTG	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320414
529	NC_017569	TATT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	386320414
530	NC_017569	T	6	6	25409	25414	0 %	100 %	0 %	0 %	386320414
531	NC_017569	CGG	2	6	25451	25456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320414
532	NC_017569	CCA	2	6	25498	25503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
533	NC_017569	CTT	2	6	25514	25519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
534	NC_017569	TAG	2	6	25532	25537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
535	NC_017569	TCC	2	6	25567	25572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320414
536	NC_017569	AAT	2	6	25620	25625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
537	NC_017569	TAA	2	6	25674	25679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
538	NC_017569	ACC	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
539	NC_017569	TAA	2	6	25707	25712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
540	NC_017569	TCT	2	6	25747	25752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
541	NC_017569	ACC	2	6	25833	25838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
542	NC_017569	TGC	2	6	25866	25871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320414
543	NC_017569	GTA	2	6	26059	26064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
544	NC_017569	TAA	2	6	26225	26230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
545	NC_017569	ATTC	2	8	26286	26293	25 %	50 %	0 %	25 %	386320414
546	NC_017569	TTCT	2	8	26375	26382	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
547	NC_017569	CCA	2	6	26424	26429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320415
548	NC_017569	TCTT	2	8	26485	26492	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
549	NC_017569	AAC	2	6	26552	26557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320415
550	NC_017569	TGC	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320415
551	NC_017569	TAT	2	6	26593	26598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320415
552	NC_017569	A	6	6	26605	26610	100 %	0 %	0 %	0 %	386320415
553	NC_017569	TAA	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320415
554	NC_017569	TA	3	6	26653	26658	50 %	50 %	0 %	0 %	386320415
555	NC_017569	TCA	2	6	26672	26677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320415
556	NC_017569	TCTG	2	8	26692	26699	0 %	50 %	25 %	25 %	386320415
557	NC_017569	ATG	2	6	26729	26734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320415
558	NC_017569	ATT	2	6	27094	27099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320416
559	NC_017569	CA	3	6	27100	27105	50 %	0 %	0 %	50 %	386320416
560	NC_017569	AAATA	2	10	27128	27137	80 %	20 %	0 %	0 %	386320416
561	NC_017569	AACCA	2	10	27143	27152	60 %	0 %	0 %	40 %	386320416
562	NC_017569	AGA	2	6	27168	27173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320416
563	NC_017569	TCC	2	6	27178	27183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320416
564	NC_017569	T	6	6	27205	27210	0 %	100 %	0 %	0 %	386320416
565	NC_017569	GA	3	6	27385	27390	50 %	0 %	50 %	0 %	386320417
566	NC_017569	TAA	2	6	27420	27425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320417
567	NC_017569	TTA	2	6	27458	27463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320417
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569	NC_017569	GCT	2	6	27514	27519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320417
570	NC_017569	A	6	6	27520	27525	100 %	0 %	0 %	0 %	386320417
571	NC_017569	TGA	2	6	27531	27536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320417
572	NC_017569	TAA	2	6	27594	27599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320417
573	NC_017569	ATA	2	6	27611	27616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320417
574	NC_017569	GAC	2	6	27697	27702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320417
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577	NC_017569	TTTA	2	8	27864	27871	25 %	75 %	0 %	0 %	386320417
578	NC_017569	GAA	2	6	27910	27915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320417
579	NC_017569	CGA	2	6	27969	27974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320417
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582	NC_017569	GATA	2	8	28236	28243	50 %	25 %	25 %	0 %	386320417
583	NC_017569	AAAG	2	8	28249	28256	75 %	0 %	25 %	0 %	386320417
584	NC_017569	TCA	2	6	28269	28274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320417
585	NC_017569	TAC	2	6	28374	28379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320417
586	NC_017569	TGA	2	6	28392	28397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320417
587	NC_017569	ATA	2	6	28504	28509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320417
588	NC_017569	TAG	2	6	28689	28694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320418
589	NC_017569	AGA	2	6	28765	28770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320418
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591	NC_017569	A	6	6	28777	28782	100 %	0 %	0 %	0 %	386320418
592	NC_017569	CAA	2	6	28784	28789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320418
593	NC_017569	TAT	3	9	28794	28802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320418
594	NC_017569	TTTG	2	8	28826	28833	0 %	75 %	25 %	0 %	386320418
595	NC_017569	AAG	2	6	28857	28862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320418
596	NC_017569	CTT	2	6	28905	28910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320418
597	NC_017569	AC	3	6	28944	28949	50 %	0 %	0 %	50 %	386320418
598	NC_017569	TGG	2	6	28960	28965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320418
599	NC_017569	TTAC	2	8	28977	28984	25 %	50 %	0 %	25 %	386320418
600	NC_017569	ATG	2	6	29052	29057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320418
601	NC_017569	AAG	2	6	29058	29063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320418
602	NC_017569	GAAAT	2	10	29064	29073	60 %	20 %	20 %	0 %	386320418
603	NC_017569	GAA	2	6	29249	29254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320418
604	NC_017569	ATGC	2	8	29267	29274	25 %	25 %	25 %	25 %	386320418
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606	NC_017569	CAA	2	6	29423	29428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320419
607	NC_017569	A	6	6	29510	29515	100 %	0 %	0 %	0 %	386320419
608	NC_017569	ACCT	2	8	29601	29608	25 %	25 %	0 %	50 %	386320419
609	NC_017569	TGC	2	6	29614	29619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320419
610	NC_017569	ACCA	2	8	29654	29661	50 %	0 %	0 %	50 %	386320419
611	NC_017569	TAA	2	6	29674	29679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320419
612	NC_017569	ATA	2	6	29739	29744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320420
613	NC_017569	AGC	2	6	29758	29763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320420
614	NC_017569	GAA	3	9	29810	29818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320420
615	NC_017569	CAT	2	6	29870	29875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320420
616	NC_017569	AAG	2	6	29883	29888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320420
617	NC_017569	ATAG	2	8	29942	29949	50 %	25 %	25 %	0 %	386320420
618	NC_017569	TTTC	2	8	30200	30207	0 %	75 %	0 %	25 %	386320421
619	NC_017569	CTA	2	6	30244	30249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
620	NC_017569	CTA	2	6	30332	30337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
621	NC_017569	GTTAAA	2	12	30400	30411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386320421
622	NC_017569	T	6	6	30438	30443	0 %	100 %	0 %	0 %	386320421
623	NC_017569	TCT	2	6	30470	30475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320421
624	NC_017569	T	6	6	30582	30587	0 %	100 %	0 %	0 %	386320421
625	NC_017569	TGA	2	6	30644	30649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320421
626	NC_017569	TCA	2	6	30667	30672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
627	NC_017569	TCTAC	2	10	30742	30751	20 %	40 %	0 %	40 %	386320421
628	NC_017569	CAT	2	6	30809	30814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
629	NC_017569	AAT	2	6	30821	30826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320421
630	NC_017569	CAT	2	6	30851	30856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
631	NC_017569	CAT	2	6	30918	30923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320421
632	NC_017569	T	6	6	30948	30953	0 %	100 %	0 %	0 %	386320421
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643	NC_017569	T	6	6	31635	31640	0 %	100 %	0 %	0 %	386320421
644	NC_017569	AAT	2	6	31654	31659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320421
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753	NC_017569	TGAA	2	8	37259	37266	50 %	25 %	25 %	0 %	386320424
754	NC_017569	GTA	2	6	37267	37272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320424
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