MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017569	ATGGA	2	10	322028	322037	40 %	20 %	40 %	0 %	386320731
6002	NC_017569	CCA	2	6	322086	322091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320731
6003	NC_017569	A	6	6	322206	322211	100 %	0 %	0 %	0 %	386320731
6004	NC_017569	A	6	6	322239	322244	100 %	0 %	0 %	0 %	386320731
6005	NC_017569	AAG	2	6	322257	322262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320731
6006	NC_017569	TAA	2	6	322281	322286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320731
6007	NC_017569	AAG	2	6	322407	322412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320731
6008	NC_017569	TCA	2	6	322428	322433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320731
6009	NC_017569	A	6	6	322443	322448	100 %	0 %	0 %	0 %	386320731
6010	NC_017569	AAAGA	2	10	322454	322463	80 %	0 %	20 %	0 %	386320731
6011	NC_017569	GA	3	6	322692	322697	50 %	0 %	50 %	0 %	386320732
6012	NC_017569	A	6	6	322727	322732	100 %	0 %	0 %	0 %	386320732
6013	NC_017569	T	6	6	322748	322753	0 %	100 %	0 %	0 %	386320732
6014	NC_017569	AG	3	6	322778	322783	50 %	0 %	50 %	0 %	386320732
6015	NC_017569	ACC	2	6	322910	322915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320732
6016	NC_017569	AAG	2	6	322952	322957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320732
6017	NC_017569	AAAATA	2	12	322961	322972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386320732
6018	NC_017569	CCA	2	6	323049	323054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320732
6019	NC_017569	AGT	2	6	323055	323060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320732
6020	NC_017569	TGG	2	6	323082	323087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320732
6021	NC_017569	ATG	2	6	323089	323094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320732
6022	NC_017569	TGG	2	6	323124	323129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320732
6023	NC_017569	TAGGTG	2	12	323147	323158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386320732
6024	NC_017569	AGG	2	6	323304	323309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320732
6025	NC_017569	CTA	2	6	323405	323410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320732
6026	NC_017569	ATA	2	6	323429	323434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320732
6027	NC_017569	TAC	2	6	323545	323550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320732
6028	NC_017569	TC	3	6	323606	323611	0 %	50 %	0 %	50 %	386320732
6029	NC_017569	CTA	2	6	323669	323674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320732
6030	NC_017569	CTT	2	6	323711	323716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320732
6031	NC_017569	TGC	2	6	323733	323738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320732
6032	NC_017569	A	7	7	323939	323945	100 %	0 %	0 %	0 %	386320732
6033	NC_017569	AG	3	6	323981	323986	50 %	0 %	50 %	0 %	386320732
6034	NC_017569	TAAC	2	8	324089	324096	50 %	25 %	0 %	25 %	386320732
6035	NC_017569	GAA	2	6	324106	324111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320732
6036	NC_017569	TTA	2	6	324115	324120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320732
6037	NC_017569	TCC	2	6	324144	324149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320732
6038	NC_017569	TCAAGT	2	12	324204	324215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386320732
6039	NC_017569	GTT	2	6	324297	324302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320732
6040	NC_017569	TAC	2	6	324324	324329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320732
6041	NC_017569	ATA	2	6	324380	324385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320732
6042	NC_017569	CAA	2	6	324390	324395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320732
6043	NC_017569	CAA	2	6	324435	324440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320732
6044	NC_017569	GGC	2	6	324501	324506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320732
6045	NC_017569	ATA	2	6	324533	324538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320732
6046	NC_017569	AAG	2	6	324704	324709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320732
6047	NC_017569	AC	3	6	324777	324782	50 %	0 %	0 %	50 %	386320732
6048	NC_017569	GGTT	2	8	324838	324845	0 %	50 %	50 %	0 %	386320732
6049	NC_017569	AGCAAC	2	12	324875	324886	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386320732
6050	NC_017569	AAT	2	6	324890	324895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320732
6051	NC_017569	T	6	6	324977	324982	0 %	100 %	0 %	0 %	386320733
6052	NC_017569	CTT	2	6	324986	324991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320733
6053	NC_017569	TTA	2	6	324992	324997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320733
6054	NC_017569	CTT	2	6	325010	325015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320733
6055	NC_017569	CTT	2	6	325049	325054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320733
6056	NC_017569	TCC	2	6	325117	325122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320733
6057	NC_017569	GGC	2	6	325132	325137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320733
6058	NC_017569	TCC	2	6	325162	325167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320733
6059	NC_017569	T	6	6	325178	325183	0 %	100 %	0 %	0 %	386320733
6060	NC_017569	TTCT	2	8	325201	325208	0 %	75 %	0 %	25 %	386320733
6061	NC_017569	T	6	6	325221	325226	0 %	100 %	0 %	0 %	386320733
6062	NC_017569	TGG	2	6	325235	325240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320733
6063	NC_017569	TCC	2	6	325270	325275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320733
6064	NC_017569	ACA	2	6	325295	325300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320733
6065	NC_017569	ATC	2	6	325326	325331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320733
6066	NC_017569	T	6	6	325491	325496	0 %	100 %	0 %	0 %	386320733
6067	NC_017569	CTA	2	6	325574	325579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320733
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6069	NC_017569	TCT	2	6	325664	325669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320733
6070	NC_017569	ATT	2	6	325726	325731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320733
6071	NC_017569	ATA	2	6	325747	325752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320733
6072	NC_017569	TCA	2	6	325856	325861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320733
6073	NC_017569	TCA	2	6	325873	325878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320733
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6075	NC_017569	CCA	2	6	325952	325957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320733
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6078	NC_017569	TCT	2	6	326029	326034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320733
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6081	NC_017569	CT	3	6	326306	326311	0 %	50 %	0 %	50 %	386320733
6082	NC_017569	AT	3	6	326371	326376	50 %	50 %	0 %	0 %	386320733
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6086	NC_017569	TA	3	6	328474	328479	50 %	50 %	0 %	0 %	386320734
6087	NC_017569	TTTCTA	2	12	328558	328569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386320734
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6090	NC_017569	GGT	2	6	328705	328710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320734
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6093	NC_017569	ATA	2	6	328831	328836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320734
6094	NC_017569	TAT	2	6	328909	328914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320734
6095	NC_017569	TTG	2	6	328922	328927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320734
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6098	NC_017569	CTATC	2	10	329025	329034	20 %	40 %	0 %	40 %	386320734
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6101	NC_017569	A	6	6	329223	329228	100 %	0 %	0 %	0 %	386320735
6102	NC_017569	CGG	2	6	329254	329259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320735
6103	NC_017569	GT	3	6	329491	329496	0 %	50 %	50 %	0 %	386320735
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6107	NC_017569	AACT	2	8	329960	329967	50 %	25 %	0 %	25 %	386320736
6108	NC_017569	TTC	2	6	330017	330022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320736
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6110	NC_017569	TAA	2	6	330046	330051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320736
6111	NC_017569	TGT	2	6	330114	330119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320736
6112	NC_017569	TAT	2	6	330161	330166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320736
6113	NC_017569	TTCATT	2	12	330167	330178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386320736
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6116	NC_017569	TC	3	6	330241	330246	0 %	50 %	0 %	50 %	386320736
6117	NC_017569	GAA	2	6	330290	330295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320736
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6119	NC_017569	TATTT	2	10	330467	330476	20 %	80 %	0 %	0 %	386320736
6120	NC_017569	ATTT	2	8	330490	330497	25 %	75 %	0 %	0 %	386320736
6121	NC_017569	GA	3	6	330613	330618	50 %	0 %	50 %	0 %	386320736
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6496	NC_017569	TCT	2	6	350587	350592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320754
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6498	NC_017569	CAT	2	6	350610	350615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320754
6499	NC_017569	T	6	6	350681	350686	0 %	100 %	0 %	0 %	386320754
6500	NC_017569	AAT	2	6	350689	350694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320754

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