MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 41163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017569	ATT	2	6	234579	234584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320632
4502	NC_017569	TCT	2	6	234663	234668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320633
4503	NC_017569	T	6	6	234752	234757	0 %	100 %	0 %	0 %	386320633
4504	NC_017569	TAT	2	6	234763	234768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320633
4505	NC_017569	AT	3	6	234837	234842	50 %	50 %	0 %	0 %	386320633
4506	NC_017569	TC	3	6	234850	234855	0 %	50 %	0 %	50 %	386320633
4507	NC_017569	T	6	6	235058	235063	0 %	100 %	0 %	0 %	386320633
4508	NC_017569	TGTA	2	8	235091	235098	25 %	50 %	25 %	0 %	386320633
4509	NC_017569	TCA	2	6	235164	235169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4510	NC_017569	TTG	2	6	235185	235190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320633
4511	NC_017569	TCA	2	6	235198	235203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4512	NC_017569	CTT	2	6	235207	235212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320633
4513	NC_017569	GTA	2	6	235303	235308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320633
4514	NC_017569	ATC	2	6	235319	235324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4515	NC_017569	CTG	2	6	235357	235362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320633
4516	NC_017569	TAT	2	6	235438	235443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320633
4517	NC_017569	ACC	3	9	235494	235502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320633
4518	NC_017569	TTC	2	6	235554	235559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320633
4519	NC_017569	TGA	2	6	235566	235571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320633
4520	NC_017569	ACC	2	6	235619	235624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320633
4521	NC_017569	CAC	2	6	235682	235687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320633
4522	NC_017569	ACA	2	6	235693	235698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320633
4523	NC_017569	CGCCAT	2	12	235700	235711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386320633
4524	NC_017569	ACA	2	6	235798	235803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320633
4525	NC_017569	ACT	2	6	235823	235828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4526	NC_017569	AGT	2	6	235892	235897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320633
4527	NC_017569	GAA	2	6	235928	235933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320633
4528	NC_017569	TAA	2	6	235940	235945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320633
4529	NC_017569	AAAT	2	8	235976	235983	75 %	25 %	0 %	0 %	386320633
4530	NC_017569	A	7	7	235991	235997	100 %	0 %	0 %	0 %	386320633
4531	NC_017569	ACC	2	6	236013	236018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320633
4532	NC_017569	AGC	2	6	236034	236039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320633
4533	NC_017569	TAT	2	6	236065	236070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320633
4534	NC_017569	ATA	2	6	236101	236106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320633
4535	NC_017569	AC	3	6	236116	236121	50 %	0 %	0 %	50 %	386320633
4536	NC_017569	TCA	2	6	236122	236127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4537	NC_017569	ACT	2	6	236153	236158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320633
4538	NC_017569	AAT	2	6	236185	236190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320634
4539	NC_017569	AC	3	6	236202	236207	50 %	0 %	0 %	50 %	386320634
4540	NC_017569	T	6	6	236248	236253	0 %	100 %	0 %	0 %	386320634
4541	NC_017569	ATG	2	6	236260	236265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320634
4542	NC_017569	CTT	2	6	236304	236309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320634
4543	NC_017569	ACC	2	6	236385	236390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320634
4544	NC_017569	ATA	2	6	236461	236466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320634
4545	NC_017569	AAGA	2	8	236467	236474	75 %	0 %	25 %	0 %	386320634
4546	NC_017569	TAAAT	2	10	236488	236497	60 %	40 %	0 %	0 %	386320634
4547	NC_017569	ACT	2	6	236568	236573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320634
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4549	NC_017569	TGA	2	6	236600	236605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320634
4550	NC_017569	AAAT	2	8	236646	236653	75 %	25 %	0 %	0 %	386320634
4551	NC_017569	ATAA	2	8	236724	236731	75 %	25 %	0 %	0 %	386320634
4552	NC_017569	ATC	2	6	236788	236793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320634
4553	NC_017569	TGA	2	6	236815	236820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320634
4554	NC_017569	CTTC	2	8	236837	236844	0 %	50 %	0 %	50 %	386320634
4555	NC_017569	GATA	2	8	236865	236872	50 %	25 %	25 %	0 %	386320634
4556	NC_017569	ATC	2	6	236902	236907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320634
4557	NC_017569	AAC	2	6	236908	236913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320634
4558	NC_017569	ACA	2	6	236965	236970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320634
4559	NC_017569	CATTAC	2	12	236979	236990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320634
4560	NC_017569	TAA	2	6	237139	237144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320635
4561	NC_017569	CT	3	6	237187	237192	0 %	50 %	0 %	50 %	386320635
4562	NC_017569	TGG	2	6	237234	237239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320635
4563	NC_017569	TTG	2	6	237241	237246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320635
4564	NC_017569	GCA	2	6	237272	237277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320635
4565	NC_017569	TCT	2	6	237368	237373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320635
4566	NC_017569	GT	3	6	237381	237386	0 %	50 %	50 %	0 %	386320635
4567	NC_017569	GAT	2	6	237484	237489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320635
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4569	NC_017569	TCGG	2	8	237502	237509	0 %	25 %	50 %	25 %	386320635
4570	NC_017569	TTC	2	6	237568	237573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320635
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4572	NC_017569	TAAA	2	8	237708	237715	75 %	25 %	0 %	0 %	386320635
4573	NC_017569	A	7	7	238233	238239	100 %	0 %	0 %	0 %	386320636
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4580	NC_017569	AGT	2	6	238699	238704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320637
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4584	NC_017569	A	6	6	238820	238825	100 %	0 %	0 %	0 %	386320637
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4588	NC_017569	AGA	3	9	239013	239021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320637
4589	NC_017569	TCT	2	6	239041	239046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320637
4590	NC_017569	ATT	2	6	239087	239092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320637
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4592	NC_017569	GAAA	2	8	239107	239114	75 %	0 %	25 %	0 %	386320637
4593	NC_017569	TTA	2	6	239138	239143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320637
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4596	NC_017569	GTG	2	6	239284	239289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320637
4597	NC_017569	CT	3	6	239370	239375	0 %	50 %	0 %	50 %	386320637
4598	NC_017569	GAC	2	6	239387	239392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320637
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4601	NC_017569	TGT	2	6	239472	239477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320637
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4603	NC_017569	TGA	2	6	239537	239542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320637
4604	NC_017569	GTT	2	6	239554	239559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320637
4605	NC_017569	AACT	2	8	239603	239610	50 %	25 %	0 %	25 %	386320637
4606	NC_017569	ACT	2	6	239689	239694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320637
4607	NC_017569	TCT	2	6	239714	239719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320637
4608	NC_017569	CTAT	2	8	239795	239802	25 %	50 %	0 %	25 %	386320637
4609	NC_017569	GAA	2	6	239823	239828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320637
4610	NC_017569	TTGT	2	8	239831	239838	0 %	75 %	25 %	0 %	386320637
4611	NC_017569	TTA	2	6	239872	239877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320637
4612	NC_017569	TTTA	2	8	239902	239909	25 %	75 %	0 %	0 %	386320638
4613	NC_017569	TAT	2	6	239930	239935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320638
4614	NC_017569	T	6	6	239940	239945	0 %	100 %	0 %	0 %	386320638
4615	NC_017569	T	6	6	240080	240085	0 %	100 %	0 %	0 %	386320638
4616	NC_017569	TTA	2	6	240097	240102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320638
4617	NC_017569	A	7	7	240139	240145	100 %	0 %	0 %	0 %	386320638
4618	NC_017569	CTT	2	6	240154	240159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320638
4619	NC_017569	TCTAC	2	10	240161	240170	20 %	40 %	0 %	40 %	386320638
4620	NC_017569	A	8	8	240177	240184	100 %	0 %	0 %	0 %	386320638
4621	NC_017569	AGAA	2	8	240217	240224	75 %	0 %	25 %	0 %	386320638
4622	NC_017569	AAT	2	6	240253	240258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320638
4623	NC_017569	GGC	2	6	240290	240295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320639
4624	NC_017569	ACC	2	6	240363	240368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320639
4625	NC_017569	CAT	2	6	240391	240396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320639
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4631	NC_017569	GAAG	2	8	240856	240863	50 %	0 %	50 %	0 %	386320639
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4742	NC_017569	TTC	2	6	245701	245706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320644
4743	NC_017569	A	6	6	245710	245715	100 %	0 %	0 %	0 %	386320644
4744	NC_017569	TTTC	2	8	245778	245785	0 %	75 %	0 %	25 %	386320644
4745	NC_017569	T	7	7	245838	245844	0 %	100 %	0 %	0 %	386320644
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4995	NC_017569	AT	3	6	258196	258201	50 %	50 %	0 %	0 %	386320657
4996	NC_017569	ATA	2	6	258223	258228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320657
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4998	NC_017569	TA	3	6	258294	258299	50 %	50 %	0 %	0 %	386320657
4999	NC_017569	TAAA	2	8	258336	258343	75 %	25 %	0 %	0 %	386320657
5000	NC_017569	TTA	2	6	258344	258349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320657

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