MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017560	TAT	2	6	152549	152554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081960
3003	NC_017560	TGC	2	6	152561	152566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081960
3004	NC_017560	GCT	2	6	152697	152702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081960
3005	NC_017560	TAA	2	6	152728	152733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081960
3006	NC_017560	ATT	2	6	152820	152825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081960
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3012	NC_017560	TTAA	2	8	152983	152990	50 %	50 %	0 %	0 %	386081960
3013	NC_017560	TAA	2	6	153325	153330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081961
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3017	NC_017560	CGT	2	6	153581	153586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081962
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3019	NC_017560	TAT	2	6	153639	153644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081962
3020	NC_017560	AAT	2	6	153656	153661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081962
3021	NC_017560	GAAA	2	8	153675	153682	75 %	0 %	25 %	0 %	386081962
3022	NC_017560	A	7	7	153726	153732	100 %	0 %	0 %	0 %	386081962
3023	NC_017560	TAA	2	6	153760	153765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081962
3024	NC_017560	GGA	2	6	153815	153820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386081962
3025	NC_017560	ATT	2	6	153884	153889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081962
3026	NC_017560	TGC	2	6	153892	153897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081962
3027	NC_017560	A	6	6	153912	153917	100 %	0 %	0 %	0 %	386081962
3028	NC_017560	TGA	2	6	153918	153923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081962
3029	NC_017560	GTT	2	6	153943	153948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081962
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3031	NC_017560	AAG	2	6	153980	153985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081962
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3033	NC_017560	TAA	2	6	154015	154020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081962
3034	NC_017560	A	7	7	154043	154049	100 %	0 %	0 %	0 %	386081962
3035	NC_017560	ATAA	2	8	154078	154085	75 %	25 %	0 %	0 %	386081963
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3037	NC_017560	TAT	2	6	154162	154167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081963
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3040	NC_017560	TGGAT	2	10	154217	154226	20 %	40 %	40 %	0 %	386081963
3041	NC_017560	GCT	2	6	154264	154269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081963
3042	NC_017560	ACT	2	6	154270	154275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081963
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3044	NC_017560	ATT	2	6	154303	154308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081963
3045	NC_017560	AGGC	2	8	154429	154436	25 %	0 %	50 %	25 %	386081963
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3053	NC_017560	AAGT	2	8	154943	154950	50 %	25 %	25 %	0 %	386081963
3054	NC_017560	GAA	2	6	154957	154962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081963
3055	NC_017560	ATGA	2	8	155017	155024	50 %	25 %	25 %	0 %	386081963
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3057	NC_017560	TTA	2	6	155090	155095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081963
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3059	NC_017560	A	6	6	155117	155122	100 %	0 %	0 %	0 %	386081963
3060	NC_017560	TTA	2	6	155134	155139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081963
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3062	NC_017560	TAA	2	6	155148	155153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081963
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3067	NC_017560	CAG	2	6	155318	155323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081963
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3071	NC_017560	CAT	2	6	155372	155377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081963
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3100	NC_017560	AT	3	6	156901	156906	50 %	50 %	0 %	0 %	386081965
3101	NC_017560	A	8	8	156961	156968	100 %	0 %	0 %	0 %	386081965
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3104	NC_017560	AAT	2	6	157113	157118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081965
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3107	NC_017560	TAA	2	6	157492	157497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081966
3108	NC_017560	CTC	2	6	157522	157527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386081966
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3111	NC_017560	TAG	2	6	157652	157657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081966
3112	NC_017560	CTT	2	6	157687	157692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081966
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3119	NC_017560	AGC	2	6	157832	157837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081966
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3491	NC_017560	TCT	2	6	177923	177928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081978
3492	NC_017560	TCA	2	6	177936	177941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081978
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