MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017560	GAC	2	6	78676	78681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081901
1503	NC_017560	CAG	2	6	78760	78765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081901
1504	NC_017560	TTC	2	6	78859	78864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081901
1505	NC_017560	ATT	2	6	78884	78889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081901
1506	NC_017560	ACC	2	6	78902	78907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081901
1507	NC_017560	A	6	6	78968	78973	100 %	0 %	0 %	0 %	386081901
1508	NC_017560	TCT	2	6	78980	78985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081901
1509	NC_017560	T	6	6	78997	79002	0 %	100 %	0 %	0 %	386081901
1510	NC_017560	TTGAT	2	10	79005	79014	20 %	60 %	20 %	0 %	386081901
1511	NC_017560	ACC	2	6	79120	79125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081901
1512	NC_017560	TTA	2	6	79146	79151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081901
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1516	NC_017560	AAAT	2	8	79430	79437	75 %	25 %	0 %	0 %	386081901
1517	NC_017560	AGAA	2	8	79472	79479	75 %	0 %	25 %	0 %	386081901
1518	NC_017560	TTC	2	6	79493	79498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081901
1519	NC_017560	TAA	3	9	79538	79546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081901
1520	NC_017560	T	6	6	79547	79552	0 %	100 %	0 %	0 %	386081901
1521	NC_017560	TAT	2	6	79827	79832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081902
1522	NC_017560	GCA	2	6	79888	79893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081902
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1524	NC_017560	ATT	2	6	79924	79929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081902
1525	NC_017560	TCT	2	6	79942	79947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081902
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1527	NC_017560	CTA	2	6	80003	80008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081902
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1530	NC_017560	TAC	2	6	80241	80246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081902
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1532	NC_017560	TTTTTA	2	12	80290	80301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386081902
1533	NC_017560	AT	3	6	80349	80354	50 %	50 %	0 %	0 %	386081902
1534	NC_017560	AT	3	6	80644	80649	50 %	50 %	0 %	0 %	386081903
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1540	NC_017560	TAT	2	6	80892	80897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081903
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1543	NC_017560	AAT	2	6	81236	81241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081904
1544	NC_017560	TTA	2	6	81249	81254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081904
1545	NC_017560	A	6	6	81496	81501	100 %	0 %	0 %	0 %	386081904
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1553	NC_017560	TGA	2	6	81785	81790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081904
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1555	NC_017560	TATT	2	8	81814	81821	25 %	75 %	0 %	0 %	386081904
1556	NC_017560	A	6	6	81834	81839	100 %	0 %	0 %	0 %	386081904
1557	NC_017560	TGC	2	6	81848	81853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081904
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1559	NC_017560	ATG	2	6	81910	81915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081904
1560	NC_017560	ACA	2	6	81920	81925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081904
1561	NC_017560	TAAT	2	8	81951	81958	50 %	50 %	0 %	0 %	386081904
1562	NC_017560	CTT	2	6	81970	81975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081905
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1595	NC_017560	AT	3	6	83065	83070	50 %	50 %	0 %	0 %	386081906
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1598	NC_017560	TAC	2	6	83150	83155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081906
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1608	NC_017560	ACGT	2	8	83798	83805	25 %	25 %	25 %	25 %	386081907
1609	NC_017560	AT	3	6	83824	83829	50 %	50 %	0 %	0 %	386081907
1610	NC_017560	GAT	2	6	83898	83903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081907
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1612	NC_017560	TGC	2	6	83921	83926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081907
1613	NC_017560	CTC	2	6	83927	83932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386081907
1614	NC_017560	ATC	2	6	83957	83962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081907
1615	NC_017560	AT	3	6	83965	83970	50 %	50 %	0 %	0 %	386081907
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1619	NC_017560	TA	3	6	84050	84055	50 %	50 %	0 %	0 %	386081907
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1623	NC_017560	CTAC	2	8	84192	84199	25 %	25 %	0 %	50 %	386081907
1624	NC_017560	TAT	2	6	84203	84208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081907
1625	NC_017560	ATA	3	9	84232	84240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081907
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