MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017560	CTATG	2	10	55342	55351	20 %	40 %	20 %	20 %	386081881
1003	NC_017560	T	6	6	55354	55359	0 %	100 %	0 %	0 %	386081881
1004	NC_017560	TTA	2	6	55418	55423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081881
1005	NC_017560	A	7	7	55460	55466	100 %	0 %	0 %	0 %	386081881
1006	NC_017560	A	6	6	55498	55503	100 %	0 %	0 %	0 %	386081881
1007	NC_017560	AAT	2	6	55511	55516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081881
1008	NC_017560	TA	3	6	55551	55556	50 %	50 %	0 %	0 %	386081881
1009	NC_017560	AAAAAG	2	12	55557	55568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386081881
1010	NC_017560	GTT	2	6	55584	55589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081881
1011	NC_017560	TA	4	8	55624	55631	50 %	50 %	0 %	0 %	386081881
1012	NC_017560	TGTA	2	8	55638	55645	25 %	50 %	25 %	0 %	386081881
1013	NC_017560	ATCT	2	8	55689	55696	25 %	50 %	0 %	25 %	386081881
1014	NC_017560	CTA	3	9	55707	55715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081881
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1016	NC_017560	CAT	2	6	55752	55757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081881
1017	NC_017560	TGA	2	6	55761	55766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081881
1018	NC_017560	A	6	6	55812	55817	100 %	0 %	0 %	0 %	386081881
1019	NC_017560	TTAT	2	8	55880	55887	25 %	75 %	0 %	0 %	386081881
1020	NC_017560	TAG	2	6	55891	55896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081881
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1022	NC_017560	AAT	2	6	55931	55936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081881
1023	NC_017560	CAA	2	6	55952	55957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081881
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1029	NC_017560	TTA	2	6	56042	56047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081882
1030	NC_017560	TA	3	6	56059	56064	50 %	50 %	0 %	0 %	386081882
1031	NC_017560	AAT	2	6	56065	56070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081882
1032	NC_017560	ATT	3	9	56094	56102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081882
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1034	NC_017560	TAG	2	6	56207	56212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081882
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1038	NC_017560	TAGT	2	8	56291	56298	25 %	50 %	25 %	0 %	386081882
1039	NC_017560	GCTAA	2	10	56353	56362	40 %	20 %	20 %	20 %	386081882
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1041	NC_017560	TAG	2	6	56438	56443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081882
1042	NC_017560	AAT	2	6	56448	56453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081882
1043	NC_017560	TGC	2	6	56463	56468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081882
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1045	NC_017560	ATT	2	6	56479	56484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081882
1046	NC_017560	AT	4	8	56554	56561	50 %	50 %	0 %	0 %	386081883
1047	NC_017560	AT	3	6	56565	56570	50 %	50 %	0 %	0 %	386081883
1048	NC_017560	TAT	2	6	56583	56588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081883
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1051	NC_017560	AAG	2	6	56638	56643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081883
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1053	NC_017560	CTA	2	6	56696	56701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081883
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1055	NC_017560	AGA	2	6	56769	56774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081883
1056	NC_017560	CACTTG	2	12	56807	56818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386081883
1057	NC_017560	AGA	2	6	56853	56858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081883
1058	NC_017560	ATA	2	6	56885	56890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081883
1059	NC_017560	GAAAAA	2	12	56971	56982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386081883
1060	NC_017560	ATA	2	6	57019	57024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081883
1061	NC_017560	T	6	6	57057	57062	0 %	100 %	0 %	0 %	386081883
1062	NC_017560	GTA	2	6	57079	57084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081883
1063	NC_017560	ATT	2	6	57205	57210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081884
1064	NC_017560	TAT	2	6	57228	57233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081884
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1067	NC_017560	TA	3	6	57333	57338	50 %	50 %	0 %	0 %	386081884
1068	NC_017560	TTA	2	6	57353	57358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081884
1069	NC_017560	TTC	2	6	57391	57396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081884
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1072	NC_017560	TCTT	2	8	57482	57489	0 %	75 %	0 %	25 %	386081884
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1084	NC_017560	AT	3	6	58875	58880	50 %	50 %	0 %	0 %	386081885
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1089	NC_017560	ATG	2	6	59411	59416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081886
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1093	NC_017560	AT	3	6	59512	59517	50 %	50 %	0 %	0 %	386081886
1094	NC_017560	TAC	2	6	59520	59525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081886
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1098	NC_017560	ATT	2	6	59629	59634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081886
1099	NC_017560	ATG	2	6	59792	59797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081886
1100	NC_017560	TAT	2	6	59805	59810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081886
1101	NC_017560	A	6	6	59934	59939	100 %	0 %	0 %	0 %	386081886
1102	NC_017560	AGT	2	6	59996	60001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081886
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1105	NC_017560	A	9	9	60084	60092	100 %	0 %	0 %	0 %	386081886
1106	NC_017560	ATT	2	6	60163	60168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081886
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1109	NC_017560	AT	4	8	60260	60267	50 %	50 %	0 %	0 %	386081886
1110	NC_017560	GGGTT	2	10	60289	60298	0 %	40 %	60 %	0 %	386081886
1111	NC_017560	GTA	2	6	60321	60326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081886
1112	NC_017560	ATG	2	6	60377	60382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081886
1113	NC_017560	T	7	7	60401	60407	0 %	100 %	0 %	0 %	386081886
1114	NC_017560	T	6	6	60416	60421	0 %	100 %	0 %	0 %	386081886
1115	NC_017560	GGA	2	6	60617	60622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386081886
1116	NC_017560	TAT	2	6	60646	60651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081886
1117	NC_017560	TTTAT	2	10	60665	60674	20 %	80 %	0 %	0 %	386081886
1118	NC_017560	TAAA	2	8	60765	60772	75 %	25 %	0 %	0 %	386081886
1119	NC_017560	TAAA	2	8	60789	60796	75 %	25 %	0 %	0 %	386081886
1120	NC_017560	TAAAAT	2	12	60898	60909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081887
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1123	NC_017560	TTGG	2	8	61065	61072	0 %	50 %	50 %	0 %	386081887
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