MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 22553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017560	CCATA	2	10	27831	27840	40 %	20 %	0 %	40 %	386081859
502	NC_017560	TTA	2	6	27862	27867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081859
503	NC_017560	GCTT	2	8	27947	27954	0 %	50 %	25 %	25 %	386081859
504	NC_017560	AAT	2	6	27977	27982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081859
505	NC_017560	AT	3	6	27998	28003	50 %	50 %	0 %	0 %	386081859
506	NC_017560	TGA	2	6	28014	28019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081859
507	NC_017560	TAT	2	6	28109	28114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081859
508	NC_017560	AT	3	6	28175	28180	50 %	50 %	0 %	0 %	386081859
509	NC_017560	ATT	2	6	28306	28311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081860
510	NC_017560	ATA	2	6	28449	28454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081860
511	NC_017560	T	8	8	30167	30174	0 %	100 %	0 %	0 %	386081861
512	NC_017560	T	6	6	30199	30204	0 %	100 %	0 %	0 %	386081861
513	NC_017560	T	6	6	30256	30261	0 %	100 %	0 %	0 %	386081861
514	NC_017560	GTTTC	2	10	30309	30318	0 %	60 %	20 %	20 %	386081861
515	NC_017560	TTA	2	6	30375	30380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081861
516	NC_017560	TTA	2	6	30449	30454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081861
517	NC_017560	AAT	2	6	30489	30494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081861
518	NC_017560	TAA	2	6	30580	30585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081861
519	NC_017560	TTC	2	6	30667	30672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081861
520	NC_017560	TTC	2	6	30685	30690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081861
521	NC_017560	T	8	8	30771	30778	0 %	100 %	0 %	0 %	386081861
522	NC_017560	ATT	2	6	30796	30801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081861
523	NC_017560	ATT	2	6	31665	31670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081862
524	NC_017560	T	6	6	31684	31689	0 %	100 %	0 %	0 %	386081862
525	NC_017560	ATTAA	2	10	31709	31718	60 %	40 %	0 %	0 %	386081862
526	NC_017560	ATTT	2	8	31812	31819	25 %	75 %	0 %	0 %	386081862
527	NC_017560	GTT	2	6	31829	31834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081862
528	NC_017560	TTCT	2	8	31854	31861	0 %	75 %	0 %	25 %	386081862
529	NC_017560	AT	3	6	31899	31904	50 %	50 %	0 %	0 %	386081862
530	NC_017560	ATT	2	6	31949	31954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081862
531	NC_017560	ATT	2	6	32012	32017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081862
532	NC_017560	ATA	2	6	32018	32023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081862
533	NC_017560	TA	3	6	32029	32034	50 %	50 %	0 %	0 %	386081862
534	NC_017560	ATA	2	6	32645	32650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081863
535	NC_017560	TAT	2	6	32664	32669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081863
536	NC_017560	ATA	2	6	32704	32709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081863
537	NC_017560	TATT	2	8	32716	32723	25 %	75 %	0 %	0 %	386081863
538	NC_017560	TTC	2	6	32727	32732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081863
539	NC_017560	GAT	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081863
540	NC_017560	AAATT	2	10	32783	32792	60 %	40 %	0 %	0 %	386081863
541	NC_017560	AAC	2	6	32804	32809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081863
542	NC_017560	A	6	6	32815	32820	100 %	0 %	0 %	0 %	386081863
543	NC_017560	ATTT	2	8	32857	32864	25 %	75 %	0 %	0 %	386081863
544	NC_017560	AGA	2	6	32910	32915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081863
545	NC_017560	TAT	2	6	32916	32921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081863
546	NC_017560	AG	4	8	32933	32940	50 %	0 %	50 %	0 %	386081863
547	NC_017560	AGT	2	6	32955	32960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081863
548	NC_017560	TTA	2	6	32963	32968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081863
549	NC_017560	A	6	6	33017	33022	100 %	0 %	0 %	0 %	386081863
550	NC_017560	ACA	2	6	33141	33146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081863
551	NC_017560	ATT	3	9	33194	33202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081863
552	NC_017560	A	7	7	33212	33218	100 %	0 %	0 %	0 %	386081863
553	NC_017560	TGA	2	6	33247	33252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081864
554	NC_017560	AT	3	6	33256	33261	50 %	50 %	0 %	0 %	386081864
555	NC_017560	TCA	2	6	33263	33268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081864
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557	NC_017560	AAAT	2	8	33321	33328	75 %	25 %	0 %	0 %	386081864
558	NC_017560	TAC	2	6	33333	33338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081864
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561	NC_017560	TCT	2	6	33452	33457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081864
562	NC_017560	TAT	2	6	33516	33521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081864
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564	NC_017560	A	6	6	33538	33543	100 %	0 %	0 %	0 %	386081864
565	NC_017560	AT	3	6	33574	33579	50 %	50 %	0 %	0 %	386081864
566	NC_017560	TTTTA	2	10	33613	33622	20 %	80 %	0 %	0 %	386081864
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575	NC_017560	T	6	6	33939	33944	0 %	100 %	0 %	0 %	386081865
576	NC_017560	AT	3	6	33999	34004	50 %	50 %	0 %	0 %	386081865
577	NC_017560	AT	3	6	34023	34028	50 %	50 %	0 %	0 %	386081865
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599	NC_017560	TA	3	6	35196	35201	50 %	50 %	0 %	0 %	386081866
600	NC_017560	TAT	2	6	35253	35258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081866
601	NC_017560	GTT	2	6	35286	35291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081866
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611	NC_017560	CAT	2	6	35641	35646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081866
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616	NC_017560	CTT	2	6	35760	35765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081866
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626	NC_017560	T	7	7	36751	36757	0 %	100 %	0 %	0 %	386081867
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628	NC_017560	AT	3	6	36822	36827	50 %	50 %	0 %	0 %	386081867
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