MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 2776

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017559	ACCAC	2	10	1941	1950	40 %	0 %	0 %	60 %	523408233
2	NC_017559	AGCGC	2	10	3884	3893	20 %	0 %	40 %	40 %	523408235
3	NC_017559	TGCGC	2	10	5481	5490	0 %	20 %	40 %	40 %	523408235
4	NC_017559	GTCAA	2	10	6808	6817	40 %	20 %	20 %	20 %	523408236
5	NC_017559	CGAAG	2	10	6936	6945	40 %	0 %	40 %	20 %	523408236
6	NC_017559	GGCGC	2	10	8366	8375	0 %	0 %	60 %	40 %	523408239
7	NC_017559	TTTGA	2	10	9087	9096	20 %	60 %	20 %	0 %	523408239
8	NC_017559	AGCAG	2	10	9354	9363	40 %	0 %	40 %	20 %	523408240
9	NC_017559	GCACG	2	10	10266	10275	20 %	0 %	40 %	40 %	523408240
10	NC_017559	AAGCC	2	10	12726	12735	40 %	0 %	20 %	40 %	523408241
11	NC_017559	TCAAA	2	10	18106	18115	60 %	20 %	0 %	20 %	523408246
12	NC_017559	GCTGG	2	10	21735	21744	0 %	20 %	60 %	20 %	523408251
13	NC_017559	TGCCG	2	10	21812	21821	0 %	20 %	40 %	40 %	523408251
14	NC_017559	CTTGC	2	10	24012	24021	0 %	40 %	20 %	40 %	523408251
15	NC_017559	GCCAC	2	10	24291	24300	20 %	0 %	20 %	60 %	523408251
16	NC_017559	AGCCG	2	10	31010	31019	20 %	0 %	40 %	40 %	523408255
17	NC_017559	GCGCC	2	10	31791	31800	0 %	0 %	40 %	60 %	523408256
18	NC_017559	CTTAC	2	10	31805	31814	20 %	40 %	0 %	40 %	523408256
19	NC_017559	CGGCG	2	10	33296	33305	0 %	0 %	60 %	40 %	523408257
20	NC_017559	TCGCA	2	10	33979	33988	20 %	20 %	20 %	40 %	523408257
21	NC_017559	TCCCG	2	10	36946	36955	0 %	20 %	20 %	60 %	523408263
22	NC_017559	TGCGC	2	10	38232	38241	0 %	20 %	40 %	40 %	523408265
23	NC_017559	TGAGC	2	10	38304	38313	20 %	20 %	40 %	20 %	523408265
24	NC_017559	GCTTG	2	10	38377	38386	0 %	40 %	40 %	20 %	523408265
25	NC_017559	AACGC	2	10	38743	38752	40 %	0 %	20 %	40 %	523408265
26	NC_017559	AACTT	2	10	42390	42399	40 %	40 %	0 %	20 %	523408267
27	NC_017559	GCGAA	2	10	42609	42618	40 %	0 %	40 %	20 %	523408267
28	NC_017559	GGGCG	2	10	43263	43272	0 %	0 %	80 %	20 %	523408267
29	NC_017559	CAAGC	2	10	43748	43757	40 %	0 %	20 %	40 %	523408267
30	NC_017559	GGCCG	2	10	46685	46694	0 %	0 %	60 %	40 %	523408269
31	NC_017559	GCCAT	2	10	48920	48929	20 %	20 %	20 %	40 %	523408272
32	NC_017559	TGCAC	2	10	53459	53468	20 %	20 %	20 %	40 %	523408276
33	NC_017559	TGCGC	2	10	54589	54598	0 %	20 %	40 %	40 %	523408278
34	NC_017559	CACCG	2	10	54866	54875	20 %	0 %	20 %	60 %	523408278
35	NC_017559	TGCGG	2	10	55063	55072	0 %	20 %	60 %	20 %	523408278
36	NC_017559	CCGCG	2	10	55504	55513	0 %	0 %	40 %	60 %	523408279
37	NC_017559	GCTCG	2	10	55954	55963	0 %	20 %	40 %	40 %	523408279
38	NC_017559	GCGCA	2	10	56570	56579	20 %	0 %	40 %	40 %	523408279
39	NC_017559	CCGCA	2	10	59786	59795	20 %	0 %	20 %	60 %	523408283
40	NC_017559	GCGCG	2	10	60745	60754	0 %	0 %	60 %	40 %	523408284
41	NC_017559	CGCGG	2	10	61446	61455	0 %	0 %	60 %	40 %	523408284
42	NC_017559	AGCGA	2	10	61877	61886	40 %	0 %	40 %	20 %	523408285
43	NC_017559	CGCCA	2	10	64199	64208	20 %	0 %	20 %	60 %	523408288
44	NC_017559	CCAGG	2	10	65087	65096	20 %	0 %	40 %	40 %	523408290
45	NC_017559	GGGCT	2	10	65913	65922	0 %	20 %	60 %	20 %	523408291
46	NC_017559	GGCGC	2	10	66167	66176	0 %	0 %	60 %	40 %	523408291
47	NC_017559	GGGGC	2	10	66589	66598	0 %	0 %	80 %	20 %	523408292
48	NC_017559	ACCGG	2	10	68009	68018	20 %	0 %	40 %	40 %	523408293
49	NC_017559	GCCTG	2	10	68608	68617	0 %	20 %	40 %	40 %	523408294
50	NC_017559	CCTGG	2	10	68983	68992	0 %	20 %	40 %	40 %	523408294
51	NC_017559	CCGGA	2	10	71842	71851	20 %	0 %	40 %	40 %	523408295
52	NC_017559	TCACG	2	10	72244	72253	20 %	20 %	20 %	40 %	523408295
53	NC_017559	CAGGG	2	10	73334	73343	20 %	0 %	60 %	20 %	523408295
54	NC_017559	TGCGG	2	10	75612	75621	0 %	20 %	60 %	20 %	523408295
55	NC_017559	AGCGC	2	10	76066	76075	20 %	0 %	40 %	40 %	523408295
56	NC_017559	CTGGG	2	10	77969	77978	0 %	20 %	60 %	20 %	523408297
57	NC_017559	CGGCC	2	10	79752	79761	0 %	0 %	40 %	60 %	523408299
58	NC_017559	CGCAG	2	10	80276	80285	20 %	0 %	40 %	40 %	523408299
59	NC_017559	GCGAG	2	10	84246	84255	20 %	0 %	60 %	20 %	523408302
60	NC_017559	CCGCA	2	10	85015	85024	20 %	0 %	20 %	60 %	523408303
61	NC_017559	TGGAA	2	10	86437	86446	40 %	20 %	40 %	0 %	523408304
62	NC_017559	CCGAC	2	10	87601	87610	20 %	0 %	20 %	60 %	523408304
63	NC_017559	CCCGG	2	10	87618	87627	0 %	0 %	40 %	60 %	523408304
64	NC_017559	CGGGC	2	10	90951	90960	0 %	0 %	60 %	40 %	523408307
65	NC_017559	CGGCC	2	10	91377	91386	0 %	0 %	40 %	60 %	523408307
66	NC_017559	CCACA	2	10	92095	92104	40 %	0 %	0 %	60 %	523408308
67	NC_017559	GCGCC	2	10	93545	93554	0 %	0 %	40 %	60 %	523408309
68	NC_017559	GCAGC	2	10	94549	94558	20 %	0 %	40 %	40 %	523408310
69	NC_017559	TGGGC	2	10	97752	97761	0 %	20 %	60 %	20 %	523408313
70	NC_017559	CGCAG	2	10	98514	98523	20 %	0 %	40 %	40 %	523408314
71	NC_017559	TGCGC	2	10	98691	98700	0 %	20 %	40 %	40 %	523408314
72	NC_017559	GCGCC	2	10	99174	99183	0 %	0 %	40 %	60 %	523408314
73	NC_017559	CGGGG	2	10	101025	101034	0 %	0 %	80 %	20 %	523408315
74	NC_017559	GCCGA	2	10	102120	102129	20 %	0 %	40 %	40 %	523408316
75	NC_017559	CGGAT	2	10	104538	104547	20 %	20 %	40 %	20 %	523408317
76	NC_017559	GGCCC	2	10	106691	106700	0 %	0 %	40 %	60 %	523408321
77	NC_017559	CGACC	2	10	110078	110087	20 %	0 %	20 %	60 %	523408324
78	NC_017559	CGCCC	2	10	112782	112791	0 %	0 %	20 %	80 %	523408326
79	NC_017559	TCGTT	2	10	113788	113797	0 %	60 %	20 %	20 %	523408326
80	NC_017559	CGTCC	2	10	114806	114815	0 %	20 %	20 %	60 %	523408328
81	NC_017559	CCACG	2	10	115582	115591	20 %	0 %	20 %	60 %	523408328
82	NC_017559	TGCCA	2	10	116353	116362	20 %	20 %	20 %	40 %	523408329
83	NC_017559	GGCGC	2	10	118950	118959	0 %	0 %	60 %	40 %	523408332
84	NC_017559	CGACC	2	10	122081	122090	20 %	0 %	20 %	60 %	523408334
85	NC_017559	CGCAG	2	10	122407	122416	20 %	0 %	40 %	40 %	523408334
86	NC_017559	TTCGT	2	10	122605	122614	0 %	60 %	20 %	20 %	523408335
87	NC_017559	ATCGC	2	10	123855	123864	20 %	20 %	20 %	40 %	523408336
88	NC_017559	ACCAG	2	10	125586	125595	40 %	0 %	20 %	40 %	523408337
89	NC_017559	ATCGC	2	10	127827	127836	20 %	20 %	20 %	40 %	523408340
90	NC_017559	GCGCG	2	10	129983	129992	0 %	0 %	60 %	40 %	523408343
91	NC_017559	TCGGC	2	10	131917	131926	0 %	20 %	40 %	40 %	523408345
92	NC_017559	CGAAG	2	10	132254	132263	40 %	0 %	40 %	20 %	523408345
93	NC_017559	GCGCC	2	10	132988	132997	0 %	0 %	40 %	60 %	523408347
94	NC_017559	GCGCG	2	10	133935	133944	0 %	0 %	60 %	40 %	523408347
95	NC_017559	CGGCG	2	10	134867	134876	0 %	0 %	60 %	40 %	523408347
96	NC_017559	GCATG	2	10	135665	135674	20 %	20 %	40 %	20 %	523408349
97	NC_017559	GCCGA	2	10	136332	136341	20 %	0 %	40 %	40 %	523408349
98	NC_017559	GGCAC	2	10	136853	136862	20 %	0 %	40 %	40 %	523408350
99	NC_017559	CGCGG	2	10	137146	137155	0 %	0 %	60 %	40 %	523408350
100	NC_017559	GCCGC	2	10	141476	141485	0 %	0 %	40 %	60 %	523408354
101	NC_017559	GGCCC	2	10	143428	143437	0 %	0 %	40 %	60 %	523408356
102	NC_017559	GCCGC	2	10	143820	143829	0 %	0 %	40 %	60 %	523408357
103	NC_017559	GCCGT	2	10	146867	146876	0 %	20 %	40 %	40 %	523408361
104	NC_017559	GGGCG	2	10	146895	146904	0 %	0 %	80 %	20 %	523408361
105	NC_017559	CGGTG	2	10	147584	147593	0 %	20 %	60 %	20 %	523408362
106	NC_017559	CCGGG	2	10	148275	148284	0 %	0 %	60 %	40 %	523408363
107	NC_017559	AATGC	2	10	149120	149129	40 %	20 %	20 %	20 %	523408363
108	NC_017559	GCAGG	2	10	150748	150757	20 %	0 %	60 %	20 %	523408364
109	NC_017559	GTCGA	2	10	152098	152107	20 %	20 %	40 %	20 %	523408365
110	NC_017559	GGCGT	2	10	152900	152909	0 %	20 %	60 %	20 %	523408366
111	NC_017559	TGGCT	2	10	156554	156563	0 %	40 %	40 %	20 %	523408371
112	NC_017559	CCGCC	2	10	158591	158600	0 %	0 %	20 %	80 %	523408373
113	NC_017559	CTCGA	2	10	161047	161056	20 %	20 %	20 %	40 %	523408375
114	NC_017559	CCACG	2	10	163332	163341	20 %	0 %	20 %	60 %	523408377
115	NC_017559	CGGCA	2	10	163596	163605	20 %	0 %	40 %	40 %	523408377
116	NC_017559	CACCG	2	10	163617	163626	20 %	0 %	20 %	60 %	523408377
117	NC_017559	GCCGT	2	10	163861	163870	0 %	20 %	40 %	40 %	523408377
118	NC_017559	CCGGC	2	10	165601	165610	0 %	0 %	40 %	60 %	523408378
119	NC_017559	GACCT	2	10	166828	166837	20 %	20 %	20 %	40 %	523408380
120	NC_017559	TGGCC	2	10	167463	167472	0 %	20 %	40 %	40 %	523408380
121	NC_017559	AGCGG	2	10	167562	167571	20 %	0 %	60 %	20 %	523408380
122	NC_017559	CGGCG	2	10	169727	169736	0 %	0 %	60 %	40 %	523408383
123	NC_017559	GGCGA	2	10	171716	171725	20 %	0 %	60 %	20 %	523408385
124	NC_017559	GCGAT	2	10	172158	172167	20 %	20 %	40 %	20 %	523408385
125	NC_017559	GCGCA	2	10	172706	172715	20 %	0 %	40 %	40 %	523408385
126	NC_017559	CGATG	2	10	174842	174851	20 %	20 %	40 %	20 %	523408389
127	NC_017559	TGGAC	2	10	175411	175420	20 %	20 %	40 %	20 %	523408389
128	NC_017559	CGACC	2	10	175481	175490	20 %	0 %	20 %	60 %	523408389
129	NC_017559	CGCCA	2	10	176661	176670	20 %	0 %	20 %	60 %	523408390
130	NC_017559	GCTGC	2	10	177752	177761	0 %	20 %	40 %	40 %	523408390
131	NC_017559	TCCAA	2	10	184223	184232	40 %	20 %	0 %	40 %	523408393
132	NC_017559	CGGCG	2	10	185186	185195	0 %	0 %	60 %	40 %	523408395
133	NC_017559	GCCCA	2	10	187689	187698	20 %	0 %	20 %	60 %	523408397
134	NC_017559	GCCGG	2	10	188172	188181	0 %	0 %	60 %	40 %	523408397
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253	NC_017559	GGGCG	2	10	343980	343989	0 %	0 %	80 %	20 %	523408540
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256	NC_017559	CGGTT	2	10	348240	348249	0 %	40 %	40 %	20 %	523408542
257	NC_017559	GTGAT	2	10	350552	350561	20 %	40 %	40 %	0 %	523408545
258	NC_017559	GGAAG	2	10	351588	351597	40 %	0 %	60 %	0 %	523408547
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261	NC_017559	CTGGC	2	10	354087	354096	0 %	20 %	40 %	40 %	523408549
262	NC_017559	GCTGG	2	10	354796	354805	0 %	20 %	60 %	20 %	523408550
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