MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017559	CTG	2	6	152014	152019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408365
3502	NC_017559	CGGG	2	8	152024	152031	0 %	0 %	75 %	25 %	523408365
3503	NC_017559	GTCGA	2	10	152098	152107	20 %	20 %	40 %	20 %	523408365
3504	NC_017559	GCCG	2	8	152133	152140	0 %	0 %	50 %	50 %	523408365
3505	NC_017559	ATC	2	6	152152	152157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408365
3506	NC_017559	ACC	3	9	152264	152272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408366
3507	NC_017559	CGG	2	6	152286	152291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408366
3508	NC_017559	TGC	2	6	152316	152321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3509	NC_017559	CGA	2	6	152418	152423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3510	NC_017559	TGC	2	6	152466	152471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3511	NC_017559	ATGACT	2	12	152565	152576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523408366
3512	NC_017559	CCG	2	6	152594	152599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408366
3513	NC_017559	GCT	2	6	152608	152613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3514	NC_017559	CGC	2	6	152632	152637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408366
3515	NC_017559	TGC	2	6	152757	152762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3516	NC_017559	CG	3	6	152778	152783	0 %	0 %	50 %	50 %	523408366
3517	NC_017559	GCA	3	9	152791	152799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408366
3518	NC_017559	GGCGT	2	10	152900	152909	0 %	20 %	60 %	20 %	523408366
3519	NC_017559	GAT	2	6	152959	152964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408366
3520	NC_017559	CG	4	8	152965	152972	0 %	0 %	50 %	50 %	523408366
3521	NC_017559	GAA	3	9	153039	153047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408367
3522	NC_017559	GCT	2	6	153072	153077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3523	NC_017559	CCG	2	6	153086	153091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408367
3524	NC_017559	GC	3	6	153119	153124	0 %	0 %	50 %	50 %	523408367
3525	NC_017559	CGCGCA	2	12	153170	153181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523408367
3526	NC_017559	GCC	2	6	153208	153213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408367
3527	NC_017559	ATC	2	6	153292	153297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408367
3528	NC_017559	GGCC	2	8	153330	153337	0 %	0 %	50 %	50 %	523408367
3529	NC_017559	GCC	3	9	153382	153390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408367
3530	NC_017559	CACG	2	8	153480	153487	25 %	0 %	25 %	50 %	523408367
3531	NC_017559	CTG	2	6	153535	153540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3532	NC_017559	CTG	2	6	153544	153549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3533	NC_017559	CG	3	6	153606	153611	0 %	0 %	50 %	50 %	523408367
3534	NC_017559	GCT	2	6	153615	153620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3535	NC_017559	ATC	2	6	153661	153666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408367
3536	NC_017559	GGA	2	6	153783	153788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408367
3537	NC_017559	CTG	2	6	153802	153807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3538	NC_017559	CGC	2	6	153831	153836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408367
3539	NC_017559	CAG	2	6	153867	153872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3540	NC_017559	CGA	2	6	153876	153881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3541	NC_017559	CGA	2	6	153921	153926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3542	NC_017559	GCC	2	6	154427	154432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408368
3543	NC_017559	TGCA	2	8	154435	154442	25 %	25 %	25 %	25 %	523408368
3544	NC_017559	CTG	2	6	154542	154547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
3545	NC_017559	TG	3	6	154546	154551	0 %	50 %	50 %	0 %	523408368
3546	NC_017559	CGG	2	6	154600	154605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
3547	NC_017559	GGC	2	6	154610	154615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
3548	NC_017559	CTG	2	6	154626	154631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
3549	NC_017559	GGC	3	9	154632	154640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
3550	NC_017559	TG	3	6	154644	154649	0 %	50 %	50 %	0 %	523408368
3551	NC_017559	TGG	3	9	154714	154722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408368
3552	NC_017559	GCT	2	6	154754	154759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
3553	NC_017559	GGT	2	6	154760	154765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408368
3554	NC_017559	TCG	2	6	155212	155217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3555	NC_017559	TCA	2	6	155227	155232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
3556	NC_017559	CG	3	6	155297	155302	0 %	0 %	50 %	50 %	523408369
3557	NC_017559	TCG	2	6	155341	155346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3558	NC_017559	TCG	3	9	155350	155358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3559	NC_017559	CAT	2	6	155384	155389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
3560	NC_017559	CGC	2	6	155413	155418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408369
3561	NC_017559	TGA	2	6	155449	155454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408369
3562	NC_017559	ACC	2	6	155497	155502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
3563	NC_017559	CAC	2	6	155532	155537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
3564	NC_017559	CG	3	6	155538	155543	0 %	0 %	50 %	50 %	523408369
3565	NC_017559	CGG	2	6	155551	155556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408369
3566	NC_017559	TGC	2	6	155593	155598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3567	NC_017559	TGA	2	6	155599	155604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408369
3568	NC_017559	TAC	2	6	155607	155612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
3569	NC_017559	GCGG	2	8	155631	155638	0 %	0 %	75 %	25 %	523408369
3570	NC_017559	GCT	2	6	155651	155656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3571	NC_017559	CAT	2	6	155711	155716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
3572	NC_017559	GTT	2	6	155753	155758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408369
3573	NC_017559	CTG	2	6	155790	155795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3574	NC_017559	GCT	2	6	155801	155806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3575	NC_017559	GTG	2	6	155862	155867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408369
3576	NC_017559	TGC	3	9	155905	155913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
3577	NC_017559	CTTCAT	2	12	155918	155929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523408369
3578	NC_017559	ACC	2	6	155965	155970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
3579	NC_017559	TCA	2	6	156051	156056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
3580	NC_017559	CAT	3	9	156106	156114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
3581	NC_017559	GCCT	2	8	156134	156141	0 %	25 %	25 %	50 %	523408370
3582	NC_017559	GGC	2	6	156158	156163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408370
3583	NC_017559	TGA	2	6	156198	156203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408370
3584	NC_017559	CTG	2	6	156227	156232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
3585	NC_017559	GGCGTG	2	12	156263	156274	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408370
3586	NC_017559	GTTCGC	2	12	156283	156294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
3587	NC_017559	GCT	2	6	156301	156306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
3588	NC_017559	TCA	2	6	156312	156317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
3589	NC_017559	TCG	2	6	156448	156453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408371
3590	NC_017559	TTC	2	6	156468	156473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408371
3591	NC_017559	TGG	2	6	156480	156485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408371
3592	NC_017559	GTT	2	6	156486	156491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408371
3593	NC_017559	GCC	2	6	156506	156511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408371
3594	NC_017559	CGA	2	6	156527	156532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408371
3595	NC_017559	CG	3	6	156534	156539	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
3596	NC_017559	TGGCT	2	10	156554	156563	0 %	40 %	40 %	20 %	523408371
3597	NC_017559	GAGCTG	2	12	156585	156596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523408371
3598	NC_017559	CAA	2	6	156599	156604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408371
3599	NC_017559	GC	3	6	156630	156635	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
3600	NC_017559	GC	3	6	156643	156648	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
3601	NC_017559	CG	3	6	156722	156727	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
3602	NC_017559	TCG	2	6	156730	156735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408371
3603	NC_017559	CAG	2	6	156759	156764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408371
3604	NC_017559	GC	4	8	156770	156777	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
3605	NC_017559	CTCA	2	8	156873	156880	25 %	25 %	0 %	50 %	523408371
3606	NC_017559	CCGT	2	8	156925	156932	0 %	25 %	25 %	50 %	523408372
3607	NC_017559	CGC	2	6	157012	157017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
3608	NC_017559	GAT	2	6	157043	157048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408372
3609	NC_017559	CTG	2	6	157136	157141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
3610	NC_017559	CAA	2	6	157147	157152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408372
3611	NC_017559	GCT	2	6	157162	157167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
3612	NC_017559	TGC	2	6	157194	157199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
3613	NC_017559	GCC	2	6	157217	157222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
3614	NC_017559	GC	3	6	157257	157262	0 %	0 %	50 %	50 %	523408372
3615	NC_017559	AAG	2	6	157304	157309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408372
3616	NC_017559	CGAT	2	8	157326	157333	25 %	25 %	25 %	25 %	523408372
3617	NC_017559	CGG	2	6	157345	157350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408372
3618	NC_017559	CGA	2	6	157369	157374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408372
3619	NC_017559	GC	5	10	157393	157402	0 %	0 %	50 %	50 %	523408372
3620	NC_017559	CCG	2	6	157428	157433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
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3738	NC_017559	CCGGAC	2	12	162497	162508	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523408377
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3853	NC_017559	CGA	2	6	167055	167060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408380
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3860	NC_017559	CGC	2	6	167411	167416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408380
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3984	NC_017559	GCA	2	6	172939	172944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408385
3985	NC_017559	CGC	2	6	172948	172953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408385
3986	NC_017559	TGG	2	6	172956	172961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408385
3987	NC_017559	TCG	2	6	172979	172984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408385
3988	NC_017559	GC	3	6	173012	173017	0 %	0 %	50 %	50 %	523408385
3989	NC_017559	GGC	2	6	173112	173117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408386
3990	NC_017559	GCA	2	6	173157	173162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408386
3991	NC_017559	TGC	2	6	173202	173207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408386
3992	NC_017559	CAG	2	6	173233	173238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408386
3993	NC_017559	CAC	2	6	173260	173265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408386
3994	NC_017559	CG	4	8	173307	173314	0 %	0 %	50 %	50 %	523408386
3995	NC_017559	GCCA	2	8	173327	173334	25 %	0 %	25 %	50 %	523408386
3996	NC_017559	GAA	2	6	173398	173403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408386
3997	NC_017559	GAC	2	6	173416	173421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408386
3998	NC_017559	TGG	2	6	173427	173432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408386
3999	NC_017559	CCG	2	6	173491	173496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408387
4000	NC_017559	CCA	2	6	173533	173538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408387

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