MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017559	TGG	2	6	132928	132933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3002	NC_017559	CGGC	2	8	132934	132941	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3003	NC_017559	GC	3	6	132948	132953	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3004	NC_017559	CGC	2	6	132979	132984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408347
3005	NC_017559	GCGCC	2	10	132988	132997	0 %	0 %	40 %	60 %	523408347
3006	NC_017559	TGGCCC	2	12	133010	133021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523408347
3007	NC_017559	CGG	2	6	133033	133038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408347
3008	NC_017559	TGG	2	6	133054	133059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3009	NC_017559	TGG	2	6	133066	133071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3010	NC_017559	GGCT	2	8	133074	133081	0 %	25 %	50 %	25 %	523408347
3011	NC_017559	TGC	2	6	133096	133101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
3012	NC_017559	GCT	2	6	133118	133123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
3013	NC_017559	GC	3	6	133150	133155	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3014	NC_017559	GC	3	6	133184	133189	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3015	NC_017559	TGG	2	6	133213	133218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3016	NC_017559	GCTGTG	2	12	133250	133261	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523408347
3017	NC_017559	GTC	2	6	133314	133319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
3018	NC_017559	GC	4	8	133353	133360	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3019	NC_017559	CG	3	6	133386	133391	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3020	NC_017559	CCGC	2	8	133414	133421	0 %	0 %	25 %	75 %	523408347
3021	NC_017559	GC	3	6	133493	133498	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3022	NC_017559	GGT	2	6	133526	133531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3023	NC_017559	GCCA	2	8	133539	133546	25 %	0 %	25 %	50 %	523408347
3024	NC_017559	GC	3	6	133592	133597	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3025	NC_017559	CGGC	2	8	133612	133619	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3026	NC_017559	TGC	2	6	133639	133644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
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3028	NC_017559	CAT	2	6	133688	133693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408347
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3030	NC_017559	GCC	2	6	133724	133729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408347
3031	NC_017559	TGG	2	6	133741	133746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3032	NC_017559	GCCG	2	8	133769	133776	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3033	NC_017559	TGG	2	6	133780	133785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
3034	NC_017559	GAT	2	6	133811	133816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408347
3035	NC_017559	GCGGTG	2	12	133851	133862	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408347
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3037	NC_017559	GCGCG	2	10	133935	133944	0 %	0 %	60 %	40 %	523408347
3038	NC_017559	GC	4	8	133976	133983	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3039	NC_017559	GTG	2	6	133998	134003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
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3041	NC_017559	TGG	2	6	134044	134049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
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3043	NC_017559	CGC	2	6	134099	134104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408347
3044	NC_017559	CG	3	6	134143	134148	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3045	NC_017559	GC	3	6	134160	134165	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3046	NC_017559	GGCC	2	8	134204	134211	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3047	NC_017559	GCG	2	6	134221	134226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408347
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3049	NC_017559	TGGA	2	8	134265	134272	25 %	25 %	50 %	0 %	523408347
3050	NC_017559	CTGG	2	8	134345	134352	0 %	25 %	50 %	25 %	523408347
3051	NC_017559	GCGG	2	8	134364	134371	0 %	0 %	75 %	25 %	523408347
3052	NC_017559	GC	3	6	134422	134427	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
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3055	NC_017559	GGC	2	6	134537	134542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408347
3056	NC_017559	TGC	2	6	134548	134553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
3057	NC_017559	CG	3	6	134567	134572	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3058	NC_017559	GCG	2	6	134590	134595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408347
3059	NC_017559	GTG	2	6	134601	134606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
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3062	NC_017559	GCG	2	6	134722	134727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408347
3063	NC_017559	GCCG	2	8	134741	134748	0 %	0 %	50 %	50 %	523408347
3064	NC_017559	GTG	2	6	134817	134822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
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3067	NC_017559	CGGCG	2	10	134867	134876	0 %	0 %	60 %	40 %	523408347
3068	NC_017559	CGT	2	6	134897	134902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408347
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3071	NC_017559	ACG	2	6	134991	134996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408348
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3074	NC_017559	GAT	2	6	135058	135063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408348
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3080	NC_017559	GCT	2	6	135208	135213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408348
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3082	NC_017559	CG	3	6	135289	135294	0 %	0 %	50 %	50 %	523408348
3083	NC_017559	CGA	2	6	135355	135360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408348
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3091	NC_017559	TCG	2	6	135898	135903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408349
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3093	NC_017559	CG	4	8	135917	135924	0 %	0 %	50 %	50 %	523408349
3094	NC_017559	GCG	2	6	135937	135942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408349
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3102	NC_017559	TCG	2	6	136231	136236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408349
3103	NC_017559	GC	3	6	136267	136272	0 %	0 %	50 %	50 %	523408349
3104	NC_017559	GCCGA	2	10	136332	136341	20 %	0 %	40 %	40 %	523408349
3105	NC_017559	GCG	2	6	136345	136350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408349
3106	NC_017559	TGGC	2	8	136374	136381	0 %	25 %	50 %	25 %	523408349
3107	NC_017559	CAT	3	9	136461	136469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408350
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3110	NC_017559	CGG	2	6	136548	136553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3111	NC_017559	GAC	2	6	136558	136563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3112	NC_017559	CGCA	2	8	136633	136640	25 %	0 %	25 %	50 %	523408350
3113	NC_017559	CG	3	6	136679	136684	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3114	NC_017559	GCT	2	6	136700	136705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408350
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3118	NC_017559	TTC	2	6	136810	136815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408350
3119	NC_017559	CGG	2	6	136836	136841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3120	NC_017559	GGCAC	2	10	136853	136862	20 %	0 %	40 %	40 %	523408350
3121	NC_017559	CGG	2	6	136863	136868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3122	NC_017559	GGA	2	6	136956	136961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408350
3123	NC_017559	CGGC	2	8	137050	137057	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3124	NC_017559	CGGC	2	8	137118	137125	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3125	NC_017559	CGCGG	2	10	137146	137155	0 %	0 %	60 %	40 %	523408350
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3227	NC_017559	CTG	2	6	140791	140796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
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3231	NC_017559	GCC	2	6	140893	140898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
3232	NC_017559	CGGC	2	8	140939	140946	0 %	0 %	50 %	50 %	523408353
3233	NC_017559	GAA	2	6	140979	140984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408353
3234	NC_017559	CTT	2	6	141000	141005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408353
3235	NC_017559	GAA	2	6	141084	141089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408353
3236	NC_017559	GCCG	2	8	141147	141154	0 %	0 %	50 %	50 %	523408353
3237	NC_017559	GCT	2	6	141168	141173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
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3239	NC_017559	GTC	2	6	141202	141207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3240	NC_017559	GCG	2	6	141221	141226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
3241	NC_017559	CAGC	2	8	141292	141299	25 %	0 %	25 %	50 %	523408354
3242	NC_017559	TGC	2	6	141300	141305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3243	NC_017559	GCT	2	6	141367	141372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3244	NC_017559	TCA	2	6	141378	141383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408354
3245	NC_017559	GC	3	6	141396	141401	0 %	0 %	50 %	50 %	523408354
3246	NC_017559	GCCGC	2	10	141476	141485	0 %	0 %	40 %	60 %	523408354
3247	NC_017559	GTG	2	6	141497	141502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3248	NC_017559	GTG	2	6	141506	141511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3249	NC_017559	TGC	2	6	141525	141530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3250	NC_017559	ACC	2	6	141549	141554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408354
3251	NC_017559	CTG	3	9	141563	141571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3252	NC_017559	GCT	2	6	141652	141657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3253	NC_017559	TGC	2	6	141687	141692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3254	NC_017559	GTG	2	6	141710	141715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3255	NC_017559	GCG	2	6	141716	141721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
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3257	NC_017559	GGC	2	6	141877	141882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
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3259	NC_017559	ATC	2	6	141944	141949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408354
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3262	NC_017559	GGT	2	6	142045	142050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3263	NC_017559	GTG	2	6	142073	142078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3264	NC_017559	TGC	2	6	142098	142103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3265	NC_017559	CGG	2	6	142113	142118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
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3270	NC_017559	TCG	2	6	142221	142226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3272	NC_017559	TCG	2	6	142254	142259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3273	NC_017559	GCT	2	6	142264	142269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3274	NC_017559	CTG	2	6	142301	142306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3275	NC_017559	GCT	2	6	142321	142326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3281	NC_017559	GCT	2	6	142462	142467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3287	NC_017559	GCT	2	6	142597	142602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3324	NC_017559	CTG	2	6	144075	144080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408357
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3351	NC_017559	ACG	2	6	144976	144981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408358
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3357	NC_017559	AGTC	2	8	145829	145836	25 %	25 %	25 %	25 %	523408360
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3361	NC_017559	GCA	3	9	146008	146016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408360
3362	NC_017559	GGCCGT	2	12	146047	146058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408360
3363	NC_017559	CGGC	2	8	146176	146183	0 %	0 %	50 %	50 %	523408360
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3365	NC_017559	GC	3	6	146201	146206	0 %	0 %	50 %	50 %	523408360
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3484	NC_017559	TCGA	2	8	151337	151344	25 %	25 %	25 %	25 %	523408364
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3486	NC_017559	GCA	2	6	151363	151368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408364
3487	NC_017559	GCT	3	9	151429	151437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408364
3488	NC_017559	GAA	2	6	151447	151452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408364
3489	NC_017559	TGC	2	6	151458	151463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408364
3490	NC_017559	TGA	2	6	151502	151507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408364
3491	NC_017559	GC	6	12	151550	151561	0 %	0 %	50 %	50 %	523408365
3492	NC_017559	CTG	2	6	151597	151602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408365
3493	NC_017559	TGC	2	6	151613	151618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408365
3494	NC_017559	CTG	2	6	151687	151692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408365
3495	NC_017559	GGC	2	6	151701	151706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408365
3496	NC_017559	CG	3	6	151754	151759	0 %	0 %	50 %	50 %	523408365
3497	NC_017559	GGC	2	6	151780	151785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408365
3498	NC_017559	AGA	3	9	151850	151858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408365
3499	NC_017559	TCA	2	6	151958	151963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408365
3500	NC_017559	CG	3	6	151967	151972	0 %	0 %	50 %	50 %	523408365

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