MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017559	TGCGC	2	10	54589	54598	0 %	20 %	40 %	40 %	523408278
1002	NC_017559	CG	3	6	54621	54626	0 %	0 %	50 %	50 %	523408278
1003	NC_017559	TC	3	6	54631	54636	0 %	50 %	0 %	50 %	523408278
1004	NC_017559	CGGC	2	8	54686	54693	0 %	0 %	50 %	50 %	523408278
1005	NC_017559	GCA	2	6	54724	54729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408278
1006	NC_017559	CG	5	10	54731	54740	0 %	0 %	50 %	50 %	523408278
1007	NC_017559	GCTC	2	8	54744	54751	0 %	25 %	25 %	50 %	523408278
1008	NC_017559	GAGC	2	8	54787	54794	25 %	0 %	50 %	25 %	523408278
1009	NC_017559	CGG	2	6	54808	54813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408278
1010	NC_017559	CGC	2	6	54834	54839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408278
1011	NC_017559	TGA	2	6	54858	54863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408278
1012	NC_017559	CACCG	2	10	54866	54875	20 %	0 %	20 %	60 %	523408278
1013	NC_017559	CTT	2	6	54880	54885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408278
1014	NC_017559	GCG	2	6	54890	54895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408278
1015	NC_017559	TGG	2	6	54909	54914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408278
1016	NC_017559	TCT	2	6	54939	54944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408278
1017	NC_017559	CGC	2	6	54985	54990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408278
1018	NC_017559	GAG	2	6	54998	55003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408278
1019	NC_017559	GGA	2	6	55015	55020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408278
1020	NC_017559	TGCGG	2	10	55063	55072	0 %	20 %	60 %	20 %	523408278
1021	NC_017559	CTG	2	6	55076	55081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408278
1022	NC_017559	GCC	2	6	55087	55092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408278
1023	NC_017559	GGC	2	6	55108	55113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408278
1024	NC_017559	ATC	2	6	55412	55417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408279
1025	NC_017559	GCC	2	6	55460	55465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
1026	NC_017559	CGG	2	6	55470	55475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1027	NC_017559	CCGCG	2	10	55504	55513	0 %	0 %	40 %	60 %	523408279
1028	NC_017559	ATC	2	6	55517	55522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408279
1029	NC_017559	CG	3	6	55545	55550	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1030	NC_017559	GAT	2	6	55570	55575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408279
1031	NC_017559	CAA	2	6	55633	55638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408279
1032	NC_017559	CTG	2	6	55649	55654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1033	NC_017559	GGC	2	6	55687	55692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1034	NC_017559	GCG	3	9	55782	55790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1035	NC_017559	CAA	2	6	55795	55800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408279
1036	NC_017559	GC	3	6	55857	55862	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1037	NC_017559	GCG	3	9	55901	55909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1038	NC_017559	CGG	3	9	55935	55943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1039	NC_017559	GCTCG	2	10	55954	55963	0 %	20 %	40 %	40 %	523408279
1040	NC_017559	GCT	2	6	55975	55980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1041	NC_017559	TGC	2	6	55983	55988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1042	NC_017559	CTG	2	6	55994	55999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1043	NC_017559	CGG	2	6	56008	56013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1044	NC_017559	GGC	2	6	56026	56031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1045	NC_017559	CG	3	6	56069	56074	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1046	NC_017559	GAC	2	6	56090	56095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1047	NC_017559	CTG	2	6	56105	56110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1048	NC_017559	CAA	2	6	56164	56169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408279
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1050	NC_017559	GC	3	6	56250	56255	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1051	NC_017559	CGA	2	6	56271	56276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1052	NC_017559	CAA	2	6	56302	56307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408279
1053	NC_017559	CG	3	6	56317	56322	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1054	NC_017559	GCC	2	6	56360	56365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
1055	NC_017559	GGT	2	6	56377	56382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408279
1056	NC_017559	GGT	2	6	56389	56394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408279
1057	NC_017559	ATG	2	6	56399	56404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408279
1058	NC_017559	AAG	2	6	56426	56431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408279
1059	NC_017559	CAT	2	6	56440	56445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408279
1060	NC_017559	CGC	2	6	56494	56499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
1061	NC_017559	GGC	2	6	56506	56511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1062	NC_017559	CG	3	6	56513	56518	0 %	0 %	50 %	50 %	523408279
1063	NC_017559	GGT	2	6	56542	56547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408279
1064	NC_017559	CGC	2	6	56548	56553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
1065	NC_017559	GCGCA	2	10	56570	56579	20 %	0 %	40 %	40 %	523408279
1066	NC_017559	GCC	2	6	56588	56593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
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1069	NC_017559	CGA	2	6	56670	56675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408279
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1071	NC_017559	CGC	2	6	56812	56817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408279
1072	NC_017559	GCG	2	6	56834	56839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408279
1073	NC_017559	AGC	2	6	56846	56851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408279
1074	NC_017559	GCA	2	6	56866	56871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408279
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1076	NC_017559	GCA	2	6	57121	57126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408280
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1081	NC_017559	GCC	2	6	57215	57220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408280
1082	NC_017559	GCG	2	6	57231	57236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408280
1083	NC_017559	GC	3	6	57290	57295	0 %	0 %	50 %	50 %	523408280
1084	NC_017559	GC	4	8	57378	57385	0 %	0 %	50 %	50 %	523408280
1085	NC_017559	CTCGGG	2	12	57386	57397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408280
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1087	NC_017559	GC	3	6	57481	57486	0 %	0 %	50 %	50 %	523408280
1088	NC_017559	CAGG	2	8	57533	57540	25 %	0 %	50 %	25 %	523408280
1089	NC_017559	GGT	2	6	57548	57553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408280
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1091	NC_017559	GCG	2	6	57656	57661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408280
1092	NC_017559	TTG	2	6	57729	57734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408280
1093	NC_017559	CGG	2	6	57745	57750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408280
1094	NC_017559	GCG	2	6	57773	57778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408280
1095	NC_017559	CAG	2	6	57833	57838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408280
1096	NC_017559	CGT	2	6	57847	57852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408280
1097	NC_017559	CTCG	2	8	58129	58136	0 %	25 %	25 %	50 %	523408281
1098	NC_017559	GCG	2	6	58149	58154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408281
1099	NC_017559	TCCA	2	8	58226	58233	25 %	25 %	0 %	50 %	523408281
1100	NC_017559	GAT	2	6	58237	58242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408281
1101	NC_017559	CCG	2	6	58257	58262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408281
1102	NC_017559	GGCG	2	8	58270	58277	0 %	0 %	75 %	25 %	523408281
1103	NC_017559	GCA	2	6	58294	58299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408281
1104	NC_017559	CAT	2	6	58348	58353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408281
1105	NC_017559	CGG	2	6	58356	58361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408281
1106	NC_017559	GC	5	10	58379	58388	0 %	0 %	50 %	50 %	523408281
1107	NC_017559	GGT	2	6	58390	58395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408281
1108	NC_017559	CTG	2	6	58433	58438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408281
1109	NC_017559	CGA	2	6	58447	58452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408281
1110	NC_017559	CTCG	2	8	58468	58475	0 %	25 %	25 %	50 %	523408281
1111	NC_017559	GGT	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408281
1112	NC_017559	GC	3	6	58500	58505	0 %	0 %	50 %	50 %	523408281
1113	NC_017559	CAA	2	6	58534	58539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408281
1114	NC_017559	CG	3	6	58590	58595	0 %	0 %	50 %	50 %	523408281
1115	NC_017559	TG	3	6	58720	58725	0 %	50 %	50 %	0 %	523408281
1116	NC_017559	TGG	2	6	58728	58733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408281
1117	NC_017559	CAA	2	6	58768	58773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408281
1118	NC_017559	CAT	2	6	58847	58852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408282
1119	NC_017559	CTG	2	6	58899	58904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1120	NC_017559	GGT	2	6	58913	58918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408282
1121	NC_017559	CTG	2	6	58947	58952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1122	NC_017559	GCTGGC	2	12	58967	58978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408282
1123	NC_017559	CGG	2	6	59011	59016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408282
1124	NC_017559	GTC	2	6	59028	59033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1125	NC_017559	CAT	2	6	59036	59041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408282
1126	NC_017559	ATC	2	6	59055	59060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408282
1127	NC_017559	TGC	2	6	59086	59091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1128	NC_017559	GGCG	2	8	59123	59130	0 %	0 %	75 %	25 %	523408282
1129	NC_017559	CG	3	6	59178	59183	0 %	0 %	50 %	50 %	523408282
1130	NC_017559	GGC	2	6	59216	59221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408282
1131	NC_017559	GCG	2	6	59255	59260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408282
1132	NC_017559	GCC	2	6	59294	59299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408282
1133	NC_017559	TGA	2	6	59317	59322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408282
1134	NC_017559	TCG	2	6	59334	59339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1135	NC_017559	CCA	2	6	59347	59352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408282
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1137	NC_017559	TGG	2	6	59428	59433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408282
1138	NC_017559	GCT	2	6	59435	59440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1139	NC_017559	CTG	2	6	59445	59450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408282
1140	NC_017559	GAT	2	6	59518	59523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408282
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1142	NC_017559	TGC	2	6	59565	59570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408283
1143	NC_017559	GCG	2	6	59571	59576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408283
1144	NC_017559	GGT	2	6	59602	59607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408283
1145	NC_017559	TCGGGC	2	12	59624	59635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408283
1146	NC_017559	ACG	2	6	59676	59681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408283
1147	NC_017559	GCATGG	2	12	59751	59762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523408283
1148	NC_017559	CCGCA	2	10	59786	59795	20 %	0 %	20 %	60 %	523408283
1149	NC_017559	GC	4	8	59855	59862	0 %	0 %	50 %	50 %	523408283
1150	NC_017559	GCT	2	6	59875	59880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408283
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1152	NC_017559	CGG	2	6	59932	59937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408283
1153	NC_017559	CAG	3	9	59939	59947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408283
1154	NC_017559	CGA	2	6	59998	60003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408283
1155	NC_017559	GC	4	8	60055	60062	0 %	0 %	50 %	50 %	523408283
1156	NC_017559	GAT	2	6	60082	60087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408283
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1159	NC_017559	CG	4	8	60112	60119	0 %	0 %	50 %	50 %	523408283
1160	NC_017559	TCG	2	6	60159	60164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408283
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1163	NC_017559	CGCA	2	8	60209	60216	25 %	0 %	25 %	50 %	523408283
1164	NC_017559	TGC	2	6	60234	60239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408283
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1166	NC_017559	CGG	2	6	60306	60311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408284
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1176	NC_017559	CATG	2	8	60720	60727	25 %	25 %	25 %	25 %	523408284
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1182	NC_017559	CGGG	2	8	60838	60845	0 %	0 %	75 %	25 %	523408284
1183	NC_017559	CG	4	8	60867	60874	0 %	0 %	50 %	50 %	523408284
1184	NC_017559	GCGG	2	8	60894	60901	0 %	0 %	75 %	25 %	523408284
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1238	NC_017559	CGCC	2	8	63092	63099	0 %	0 %	25 %	75 %	523408286
1239	NC_017559	GCA	2	6	63109	63114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408286
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1241	NC_017559	GC	3	6	63128	63133	0 %	0 %	50 %	50 %	523408286
1242	NC_017559	GAT	2	6	63134	63139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408286
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1245	NC_017559	GATC	2	8	63336	63343	25 %	25 %	25 %	25 %	523408286
1246	NC_017559	CGG	2	6	63394	63399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408287
1247	NC_017559	CGG	3	9	63409	63417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408287
1248	NC_017559	TCGACA	2	12	63481	63492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523408287
1249	NC_017559	GC	4	8	63493	63500	0 %	0 %	50 %	50 %	523408287
1250	NC_017559	CGC	2	6	63518	63523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408287
1251	NC_017559	GTG	2	6	63588	63593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408287
1252	NC_017559	CTT	2	6	63836	63841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408288
1253	NC_017559	CTGA	2	8	63851	63858	25 %	25 %	25 %	25 %	523408288
1254	NC_017559	TCA	2	6	63883	63888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408288
1255	NC_017559	GTT	2	6	64004	64009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408288
1256	NC_017559	CAC	2	6	64025	64030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408288
1257	NC_017559	GATC	2	8	64039	64046	25 %	25 %	25 %	25 %	523408288
1258	NC_017559	ACC	2	6	64140	64145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408288
1259	NC_017559	CGCCA	2	10	64199	64208	20 %	0 %	20 %	60 %	523408288
1260	NC_017559	CATC	2	8	64231	64238	25 %	25 %	0 %	50 %	523408288
1261	NC_017559	C	6	6	64291	64296	0 %	0 %	0 %	100 %	523408288
1262	NC_017559	GGA	2	6	64321	64326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408288
1263	NC_017559	GTT	2	6	64380	64385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408289
1264	NC_017559	CCG	3	9	64423	64431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408289
1265	NC_017559	CTG	2	6	64449	64454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408289
1266	NC_017559	GGC	2	6	64479	64484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408290
1267	NC_017559	GC	3	6	64507	64512	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1268	NC_017559	GCGT	2	8	64534	64541	0 %	25 %	50 %	25 %	523408290
1269	NC_017559	GCG	2	6	64547	64552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408290
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1271	NC_017559	GCC	2	6	64590	64595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408290
1272	NC_017559	CAG	2	6	64662	64667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408290
1273	NC_017559	GCA	2	6	64685	64690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408290
1274	NC_017559	GC	3	6	64720	64725	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1275	NC_017559	GC	3	6	64779	64784	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1276	NC_017559	TCC	2	6	64849	64854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408290
1277	NC_017559	GAC	2	6	64878	64883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408290
1278	NC_017559	GC	3	6	64885	64890	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1279	NC_017559	TGC	2	6	64928	64933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408290
1280	NC_017559	GCA	2	6	64985	64990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408290
1281	NC_017559	GGC	2	6	65010	65015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408290
1282	NC_017559	CG	3	6	65036	65041	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1283	NC_017559	CCAGG	2	10	65087	65096	20 %	0 %	40 %	40 %	523408290
1284	NC_017559	CGGG	2	8	65185	65192	0 %	0 %	75 %	25 %	523408290
1285	NC_017559	GC	3	6	65212	65217	0 %	0 %	50 %	50 %	523408290
1286	NC_017559	AGG	2	6	65242	65247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408290
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1290	NC_017559	CCG	2	6	65524	65529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408291
1291	NC_017559	CTG	2	6	65535	65540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408291
1292	NC_017559	TGC	2	6	65578	65583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408291
1293	NC_017559	GC	3	6	65611	65616	0 %	0 %	50 %	50 %	523408291
1294	NC_017559	GCT	2	6	65642	65647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408291
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1302	NC_017559	GGGCT	2	10	65913	65922	0 %	20 %	60 %	20 %	523408291
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1310	NC_017559	TGC	2	6	66121	66126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408291
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1326	NC_017559	GC	3	6	66569	66574	0 %	0 %	50 %	50 %	523408292
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1368	NC_017559	CAC	2	6	67849	67854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408293
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1372	NC_017559	ACCGG	2	10	68009	68018	20 %	0 %	40 %	40 %	523408293
1373	NC_017559	CG	5	10	68036	68045	0 %	0 %	50 %	50 %	523408293
1374	NC_017559	GGGGCT	2	12	68092	68103	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408293
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