MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017559	CAC	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408252
502	NC_017559	CGC	2	6	26936	26941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408252
503	NC_017559	CTT	2	6	26943	26948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408252
504	NC_017559	TCA	2	6	26956	26961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408252
505	NC_017559	TGA	2	6	26972	26977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
506	NC_017559	GCA	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
507	NC_017559	ACA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408252
508	NC_017559	TGC	2	6	27121	27126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
509	NC_017559	GTG	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408252
510	NC_017559	AGCC	2	8	27208	27215	25 %	0 %	25 %	50 %	523408252
511	NC_017559	CGG	2	6	27228	27233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408252
512	NC_017559	TTC	2	6	27315	27320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408252
513	NC_017559	TGA	2	6	27378	27383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
514	NC_017559	TCG	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
515	NC_017559	TCT	2	6	27871	27876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408253
516	NC_017559	TCGG	2	8	27899	27906	0 %	25 %	50 %	25 %	523408253
517	NC_017559	GT	3	6	27919	27924	0 %	50 %	50 %	0 %	523408253
518	NC_017559	ACC	2	6	27968	27973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408253
519	NC_017559	GCA	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408253
520	NC_017559	GT	3	6	28006	28011	0 %	50 %	50 %	0 %	523408253
521	NC_017559	CCGC	2	8	28027	28034	0 %	0 %	25 %	75 %	523408253
522	NC_017559	CAT	2	6	28035	28040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408253
523	NC_017559	GC	3	6	28102	28107	0 %	0 %	50 %	50 %	523408253
524	NC_017559	GTC	2	6	28479	28484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408254
525	NC_017559	GCC	2	6	28488	28493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408254
526	NC_017559	CGC	2	6	28498	28503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408254
527	NC_017559	CG	3	6	28638	28643	0 %	0 %	50 %	50 %	523408254
528	NC_017559	CAGCCG	2	12	28655	28666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523408254
529	NC_017559	GA	3	6	28705	28710	50 %	0 %	50 %	0 %	523408254
530	NC_017559	CTGG	2	8	28786	28793	0 %	25 %	50 %	25 %	523408254
531	NC_017559	CGA	2	6	28840	28845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408254
532	NC_017559	CG	3	6	28864	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	523408254
533	NC_017559	TCC	2	6	28917	28922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408254
534	NC_017559	CCG	2	6	29001	29006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408254
535	NC_017559	GCG	2	6	29026	29031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408254
536	NC_017559	CTTG	2	8	29104	29111	0 %	50 %	25 %	25 %	523408254
537	NC_017559	GGT	2	6	29114	29119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408254
538	NC_017559	CTGC	2	8	29200	29207	0 %	25 %	25 %	50 %	523408254
539	NC_017559	CGC	2	6	29258	29263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408255
540	NC_017559	CG	3	6	29306	29311	0 %	0 %	50 %	50 %	523408255
541	NC_017559	TTG	2	6	29375	29380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408255
542	NC_017559	GCG	2	6	29440	29445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408255
543	NC_017559	GGA	2	6	29451	29456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
544	NC_017559	GGA	2	6	29565	29570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
545	NC_017559	AGG	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
546	NC_017559	CGC	2	6	29588	29593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408255
547	NC_017559	CGC	2	6	29609	29614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408255
548	NC_017559	CGA	2	6	29618	29623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408255
549	NC_017559	GAACAA	2	12	29673	29684	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	523408255
550	NC_017559	AAG	2	6	29711	29716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408255
551	NC_017559	GAC	2	6	29719	29724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408255
552	NC_017559	AGC	2	6	29744	29749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408255
553	NC_017559	TTG	2	6	29755	29760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408255
554	NC_017559	CGA	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408255
555	NC_017559	TGC	2	6	29915	29920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408255
556	NC_017559	CGG	2	6	29921	29926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408255
557	NC_017559	GAA	2	6	29952	29957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408255
558	NC_017559	TCG	2	6	30017	30022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408255
559	NC_017559	CTG	2	6	30075	30080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408255
560	NC_017559	ACCG	2	8	30120	30127	25 %	0 %	25 %	50 %	523408255
561	NC_017559	AAG	3	9	30160	30168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408255
562	NC_017559	TG	4	8	30204	30211	0 %	50 %	50 %	0 %	523408255
563	NC_017559	TTCA	2	8	30354	30361	25 %	50 %	0 %	25 %	523408255
564	NC_017559	GGA	2	6	30456	30461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
565	NC_017559	TAC	2	6	30487	30492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408255
566	NC_017559	GTG	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408255
567	NC_017559	CGCC	2	8	30566	30573	0 %	0 %	25 %	75 %	523408255
568	NC_017559	GAG	2	6	30592	30597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
569	NC_017559	GAT	2	6	30787	30792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408255
570	NC_017559	ATGTCT	2	12	30800	30811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523408255
571	NC_017559	TCA	2	6	30833	30838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408255
572	NC_017559	GC	4	8	30930	30937	0 %	0 %	50 %	50 %	523408255
573	NC_017559	AGCCG	2	10	31010	31019	20 %	0 %	40 %	40 %	523408255
574	NC_017559	TCG	2	6	31044	31049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408255
575	NC_017559	CG	3	6	31048	31053	0 %	0 %	50 %	50 %	523408255
576	NC_017559	AGG	2	6	31055	31060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408255
577	NC_017559	CG	5	10	31071	31080	0 %	0 %	50 %	50 %	523408255
578	NC_017559	GCC	4	12	31095	31106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408255
579	NC_017559	GAA	2	6	31126	31131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408255
580	NC_017559	GCT	2	6	31188	31193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408255
581	NC_017559	TGT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408255
582	NC_017559	GAA	2	6	31241	31246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408256
583	NC_017559	GTT	2	6	31286	31291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408256
584	NC_017559	TGC	2	6	31343	31348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408256
585	NC_017559	TCA	2	6	31399	31404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408256
586	NC_017559	GGT	2	6	31460	31465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408256
587	NC_017559	TGC	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408256
588	NC_017559	CG	3	6	31606	31611	0 %	0 %	50 %	50 %	523408256
589	NC_017559	GAA	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408256
590	NC_017559	GC	3	6	31653	31658	0 %	0 %	50 %	50 %	523408256
591	NC_017559	GCC	2	6	31661	31666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408256
592	NC_017559	CA	3	6	31705	31710	50 %	0 %	0 %	50 %	523408256
593	NC_017559	TGCGCA	2	12	31774	31785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523408256
594	NC_017559	GCGCC	2	10	31791	31800	0 %	0 %	40 %	60 %	523408256
595	NC_017559	CTTAC	2	10	31805	31814	20 %	40 %	0 %	40 %	523408256
596	NC_017559	TG	3	6	31854	31859	0 %	50 %	50 %	0 %	523408256
597	NC_017559	CGG	2	6	31946	31951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408256
598	NC_017559	CGC	2	6	32011	32016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408256
599	NC_017559	AGC	2	6	32063	32068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408256
600	NC_017559	CGC	2	6	32129	32134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408256
601	NC_017559	TCA	2	6	32138	32143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408256
602	NC_017559	TGA	2	6	32158	32163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408256
603	NC_017559	TAC	2	6	32267	32272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408257
604	NC_017559	GGCG	2	8	32326	32333	0 %	0 %	75 %	25 %	523408257
605	NC_017559	GCCT	2	8	32489	32496	0 %	25 %	25 %	50 %	523408257
606	NC_017559	GAG	2	6	32501	32506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408257
607	NC_017559	ATT	2	6	32520	32525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523408257
608	NC_017559	CAC	2	6	32558	32563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408257
609	NC_017559	GGC	2	6	32732	32737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408257
610	NC_017559	GAG	2	6	32754	32759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408257
611	NC_017559	CAT	2	6	32764	32769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408257
612	NC_017559	TCG	2	6	32830	32835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408257
613	NC_017559	GGTC	2	8	32853	32860	0 %	25 %	50 %	25 %	523408257
614	NC_017559	CGC	2	6	32883	32888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408257
615	NC_017559	GCT	2	6	32896	32901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408257
616	NC_017559	CGC	2	6	32947	32952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408257
617	NC_017559	CG	3	6	32965	32970	0 %	0 %	50 %	50 %	523408257
618	NC_017559	CTC	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408257
619	NC_017559	ATC	3	9	33053	33061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408257
620	NC_017559	TGG	2	6	33117	33122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408257
621	NC_017559	AGG	2	6	33123	33128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408257
622	NC_017559	CG	3	6	33243	33248	0 %	0 %	50 %	50 %	523408257
623	NC_017559	GC	3	6	33281	33286	0 %	0 %	50 %	50 %	523408257
624	NC_017559	CGGCG	2	10	33296	33305	0 %	0 %	60 %	40 %	523408257
625	NC_017559	GCG	2	6	33315	33320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408257
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