MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 88123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017559	GCC	2	6	232460	232465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5502	NC_017559	GCC	2	6	232534	232539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5503	NC_017559	CCG	2	6	232544	232549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5504	NC_017559	CGC	2	6	232555	232560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5505	NC_017559	CCG	2	6	232562	232567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5506	NC_017559	GCC	2	6	232568	232573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408440
5507	NC_017559	TCG	2	6	232649	232654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408440
5508	NC_017559	TGG	2	6	234737	234742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408441
5509	NC_017559	AAGA	2	8	234935	234942	75 %	0 %	25 %	0 %	523408442
5510	NC_017559	CAGT	2	8	234952	234959	25 %	25 %	25 %	25 %	523408442
5511	NC_017559	GAA	2	6	234983	234988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408442
5512	NC_017559	TCA	2	6	234990	234995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408442
5513	NC_017559	GGT	2	6	235042	235047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408442
5514	NC_017559	TGG	2	6	235104	235109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408442
5515	NC_017559	AGTGA	2	10	235130	235139	40 %	20 %	40 %	0 %	523408442
5516	NC_017559	CGC	2	6	236353	236358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408443
5517	NC_017559	TG	3	6	236700	236705	0 %	50 %	50 %	0 %	523408444
5518	NC_017559	GAG	2	6	236725	236730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408444
5519	NC_017559	GC	3	6	236742	236747	0 %	0 %	50 %	50 %	523408444
5520	NC_017559	GAC	2	6	236761	236766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408444
5521	NC_017559	CG	3	6	236844	236849	0 %	0 %	50 %	50 %	523408444
5522	NC_017559	CGGCG	2	10	236860	236869	0 %	0 %	60 %	40 %	523408444
5523	NC_017559	ACG	2	6	237413	237418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408445
5524	NC_017559	GAC	2	6	237428	237433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408445
5525	NC_017559	GGC	2	6	237524	237529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408445
5526	NC_017559	CGC	2	6	237555	237560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408445
5527	NC_017559	GCG	2	6	237593	237598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408445
5528	NC_017559	TTG	2	6	237657	237662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408445
5529	NC_017559	CAT	2	6	237670	237675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408445
5530	NC_017559	ACCGGC	2	12	237699	237710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523408445
5531	NC_017559	CTG	2	6	237717	237722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408445
5532	NC_017559	GCC	2	6	237733	237738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408445
5533	NC_017559	TCA	2	6	238030	238035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408446
5534	NC_017559	CGA	2	6	238132	238137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408446
5535	NC_017559	CGC	2	6	238242	238247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408446
5536	NC_017559	GCC	2	6	238406	238411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408446
5537	NC_017559	GC	3	6	238466	238471	0 %	0 %	50 %	50 %	523408446
5538	NC_017559	GCC	2	6	238496	238501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408446
5539	NC_017559	GATTGG	2	12	238571	238582	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	523408446
5540	NC_017559	ATG	2	6	238667	238672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408446
5541	NC_017559	GAA	2	6	238799	238804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408446
5542	NC_017559	GTT	2	6	238882	238887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408446
5543	NC_017559	GAG	2	6	238901	238906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408446
5544	NC_017559	GAG	2	6	238933	238938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408446
5545	NC_017559	TGC	2	6	238972	238977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408446
5546	NC_017559	GCA	2	6	238999	239004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408446
5547	NC_017559	ACA	2	6	239055	239060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408446
5548	NC_017559	GGCT	2	8	239105	239112	0 %	25 %	50 %	25 %	523408446
5549	NC_017559	CTG	2	6	239207	239212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408446
5550	NC_017559	GCC	2	6	239997	240002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408447
5551	NC_017559	CGG	2	6	240040	240045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408447
5552	NC_017559	CGAT	2	8	240099	240106	25 %	25 %	25 %	25 %	523408447
5553	NC_017559	CCA	2	6	240136	240141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5554	NC_017559	CAG	2	6	240185	240190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408447
5555	NC_017559	CCA	2	6	240301	240306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5556	NC_017559	GCA	2	6	240307	240312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408447
5557	NC_017559	GGC	2	6	240416	240421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408447
5558	NC_017559	CAC	2	6	240578	240583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5559	NC_017559	CAA	2	6	240599	240604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408447
5560	NC_017559	CAC	2	6	240641	240646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5561	NC_017559	ACC	2	6	240723	240728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5562	NC_017559	TGGC	2	8	240736	240743	0 %	25 %	50 %	25 %	523408447
5563	NC_017559	AAC	2	6	240744	240749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408447
5564	NC_017559	GAT	2	6	240753	240758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408447
5565	NC_017559	CAC	2	6	240794	240799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408447
5566	NC_017559	CAA	2	6	240815	240820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408447
5567	NC_017559	GGC	2	6	240848	240853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408447
5568	NC_017559	ACTC	2	8	240931	240938	25 %	25 %	0 %	50 %	523408447
5569	NC_017559	TCAA	2	8	241014	241021	50 %	25 %	0 %	25 %	523408447
5570	NC_017559	GGC	2	6	241064	241069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408447
5571	NC_017559	CTCG	2	8	241085	241092	0 %	25 %	25 %	50 %	523408447
5572	NC_017559	GAC	2	6	241116	241121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408447
5573	NC_017559	ACA	2	6	241174	241179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408447
5574	NC_017559	GGC	2	6	241208	241213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408447
5575	NC_017559	AAC	2	6	241320	241325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408447
5576	NC_017559	CGCT	2	8	241362	241369	0 %	25 %	25 %	50 %	523408447
5577	NC_017559	GCTCTG	2	12	241413	241424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408447
5578	NC_017559	CGCT	2	8	241434	241441	0 %	25 %	25 %	50 %	523408447
5579	NC_017559	TGG	2	6	241495	241500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408447
5580	NC_017559	GTC	2	6	241637	241642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408448
5581	NC_017559	TGG	2	6	241669	241674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408448
5582	NC_017559	CGC	2	6	241752	241757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408448
5583	NC_017559	TC	3	6	241968	241973	0 %	50 %	0 %	50 %	523408449
5584	NC_017559	CG	3	6	241975	241980	0 %	0 %	50 %	50 %	523408449
5585	NC_017559	CGC	2	6	242009	242014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408449
5586	NC_017559	GAA	2	6	242050	242055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408449
5587	NC_017559	GC	3	6	242077	242082	0 %	0 %	50 %	50 %	523408449
5588	NC_017559	GTC	2	6	242092	242097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408449
5589	NC_017559	CGG	2	6	242115	242120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408449
5590	NC_017559	CAT	2	6	242139	242144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408449
5591	NC_017559	GGCA	2	8	242256	242263	25 %	0 %	50 %	25 %	523408449
5592	NC_017559	CGG	2	6	242268	242273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408449
5593	NC_017559	TGG	2	6	242383	242388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408449
5594	NC_017559	CAG	2	6	242427	242432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408449
5595	NC_017559	GCG	2	6	242442	242447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408450
5596	NC_017559	CGC	2	6	242453	242458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408450
5597	NC_017559	CGTG	2	8	242459	242466	0 %	25 %	50 %	25 %	523408450
5598	NC_017559	CGTG	2	8	242478	242485	0 %	25 %	50 %	25 %	523408450
5599	NC_017559	CGA	2	6	242528	242533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408450
5600	NC_017559	TCG	2	6	242551	242556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408450
5601	NC_017559	ATCG	2	8	242604	242611	25 %	25 %	25 %	25 %	523408450
5602	NC_017559	CGT	2	6	242639	242644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408450
5603	NC_017559	GCG	2	6	242709	242714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408450
5604	NC_017559	GCC	2	6	242716	242721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408450
5605	NC_017559	CCG	3	9	242740	242748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408450
5606	NC_017559	GATG	2	8	242762	242769	25 %	25 %	50 %	0 %	523408450
5607	NC_017559	TCGA	2	8	242812	242819	25 %	25 %	25 %	25 %	523408450
5608	NC_017559	GCC	2	6	242944	242949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408450
5609	NC_017559	GTG	2	6	242972	242977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408450
5610	NC_017559	CGGGC	2	10	243053	243062	0 %	0 %	60 %	40 %	523408450
5611	NC_017559	CGG	2	6	243122	243127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408450
5612	NC_017559	CAG	2	6	243189	243194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408450
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5614	NC_017559	CAG	2	6	243204	243209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408450
5615	NC_017559	CGG	2	6	243224	243229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408450
5616	NC_017559	CGCC	2	8	243308	243315	0 %	0 %	25 %	75 %	523408451
5617	NC_017559	CG	4	8	243344	243351	0 %	0 %	50 %	50 %	523408451
5618	NC_017559	CAG	2	6	243402	243407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408451
5619	NC_017559	GCA	2	6	243431	243436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408451
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5621	NC_017559	AGG	2	6	243499	243504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408451
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5854	NC_017559	CACCC	2	10	252971	252980	20 %	0 %	0 %	80 %	523408456
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5986	NC_017559	CCG	3	9	260294	260302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408467
5987	NC_017559	TTC	2	6	260330	260335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408467
5988	NC_017559	ATCG	2	8	260410	260417	25 %	25 %	25 %	25 %	523408467
5989	NC_017559	GTC	2	6	260452	260457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408467
5990	NC_017559	GGT	2	6	260527	260532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408467
5991	NC_017559	TTG	2	6	260537	260542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408467
5992	NC_017559	CTG	2	6	260617	260622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408467
5993	NC_017559	GTA	2	6	260659	260664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408467
5994	NC_017559	CGCA	2	8	260806	260813	25 %	0 %	25 %	50 %	523408467
5995	NC_017559	CGA	2	6	260814	260819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408467
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5997	NC_017559	AAGCG	2	10	260840	260849	40 %	0 %	40 %	20 %	523408467
5998	NC_017559	CGC	2	6	260877	260882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408467
5999	NC_017559	CCGA	2	8	260897	260904	25 %	0 %	25 %	50 %	523408467
6000	NC_017559	GCT	2	6	260971	260976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408467

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