MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 497

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	TGG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683902
2	NC_017558	CGA	2	6	585	590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
3	NC_017558	GAC	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
4	NC_017558	AGC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
5	NC_017558	CAT	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683902
6	NC_017558	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
7	NC_017558	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
8	NC_017558	CGT	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683902
9	NC_017558	CAC	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683902
10	NC_017558	AGC	3	9	1131	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
11	NC_017558	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683903
12	NC_017558	GAG	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683903
13	NC_017558	TGC	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
14	NC_017558	GAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683903
15	NC_017558	TGG	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
16	NC_017558	GTG	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
17	NC_017558	GAC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683903
18	NC_017558	GTA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683903
19	NC_017558	CCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683903
20	NC_017558	CAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
21	NC_017558	GGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
22	NC_017558	TCG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
23	NC_017558	GCG	2	6	2072	2077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
24	NC_017558	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
25	NC_017558	CGT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
26	NC_017558	AAC	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
27	NC_017558	GCT	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683904
28	NC_017558	AAG	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683904
29	NC_017558	CTT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683904
30	NC_017558	GCC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683904
31	NC_017558	AGC	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683905
32	NC_017558	CTA	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683905
33	NC_017558	CGC	2	6	3253	3258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683906
34	NC_017558	GAC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
35	NC_017558	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
36	NC_017558	GCG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683906
37	NC_017558	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
38	NC_017558	ACG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
39	NC_017558	CGA	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
40	NC_017558	GAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
41	NC_017558	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683906
42	NC_017558	CGA	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683907
43	NC_017558	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683908
44	NC_017558	ACG	3	9	4521	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683908
45	NC_017558	GCC	2	6	4602	4607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683908
46	NC_017558	CCG	2	6	4802	4807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
47	NC_017558	CAT	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683909
48	NC_017558	GCA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
49	NC_017558	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
50	NC_017558	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
51	NC_017558	AGC	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
52	NC_017558	GCC	2	6	5311	5316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
53	NC_017558	AGA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683909
54	NC_017558	AGC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
55	NC_017558	GCG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
56	NC_017558	AGG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683909
57	NC_017558	CGA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
58	NC_017558	CCG	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
59	NC_017558	GCA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
60	NC_017558	CGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
61	NC_017558	CGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
62	NC_017558	GTT	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
63	NC_017558	CGC	2	6	6314	6319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
64	NC_017558	CTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683910
65	NC_017558	CGC	2	6	6422	6427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
66	NC_017558	GCT	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683910
67	NC_017558	CGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
68	NC_017558	GCC	3	9	6522	6530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
69	NC_017558	GAT	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683910
70	NC_017558	CCA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683910
71	NC_017558	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
72	NC_017558	GGA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683910
73	NC_017558	GAA	2	6	6927	6932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683910
74	NC_017558	TCG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683910
75	NC_017558	TCA	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683910
76	NC_017558	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
77	NC_017558	CGA	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
78	NC_017558	CAG	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
79	NC_017558	CCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
80	NC_017558	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
81	NC_017558	GCC	2	6	7191	7196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
82	NC_017558	TTG	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683911
83	NC_017558	TCG	2	6	7354	7359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683911
84	NC_017558	GCA	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
85	NC_017558	GCC	2	6	7440	7445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
86	NC_017558	TGG	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683912
87	NC_017558	GCA	2	6	7576	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
88	NC_017558	CGA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
89	NC_017558	ACG	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
90	NC_017558	ATC	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683912
91	NC_017558	CGT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683912
92	NC_017558	TTG	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683912
93	NC_017558	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
94	NC_017558	CTG	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683912
95	NC_017558	CTT	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683912
96	NC_017558	ACG	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
97	NC_017558	AGT	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683912
98	NC_017558	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683912
99	NC_017558	TCA	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683912
100	NC_017558	CCG	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683912
101	NC_017558	GCG	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683912
102	NC_017558	TCA	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683913
103	NC_017558	GGC	2	6	8342	8347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683913
104	NC_017558	ACC	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683913
105	NC_017558	CGA	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683913
106	NC_017558	GCT	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683913
107	NC_017558	TCG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683913
108	NC_017558	CTA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683914
109	NC_017558	CAT	2	6	8662	8667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683914
110	NC_017558	CGC	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683915
111	NC_017558	CGG	2	6	9125	9130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683915
112	NC_017558	GAA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683915
113	NC_017558	CGA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683915
114	NC_017558	CGC	2	6	9338	9343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683915
115	NC_017558	GGA	2	6	9383	9388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683915
116	NC_017558	GCT	2	6	9541	9546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683916
117	NC_017558	CGC	2	6	9726	9731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683917
118	NC_017558	CGG	2	6	9748	9753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683917
119	NC_017558	ACC	2	6	9782	9787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683917
120	NC_017558	GAC	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683917
121	NC_017558	CCG	2	6	9907	9912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683917
122	NC_017558	GCC	2	6	9958	9963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683917
123	NC_017558	ACC	2	6	10173	10178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683917
124	NC_017558	CAT	2	6	10246	10251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683917
125	NC_017558	GTG	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683917
126	NC_017558	AAC	2	6	10340	10345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683917
127	NC_017558	TCT	2	6	10369	10374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683917
128	NC_017558	ATG	2	6	10478	10483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683917
129	NC_017558	TCA	2	6	10572	10577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683917
130	NC_017558	GAC	2	6	10597	10602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683917
131	NC_017558	CGA	2	6	10752	10757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683917
132	NC_017558	GGC	2	6	10783	10788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683917
133	NC_017558	GCT	2	6	10854	10859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683917
134	NC_017558	CGG	2	6	10879	10884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683917
135	NC_017558	ACG	2	6	10955	10960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683917
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152	NC_017558	CGT	2	6	12260	12265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683918
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159	NC_017558	CCG	2	6	12634	12639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683918
160	NC_017558	TCG	2	6	12700	12705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683918
161	NC_017558	CGA	2	6	12706	12711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683918
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236	NC_017558	AGC	2	6	17945	17950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683925
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238	NC_017558	GTT	2	6	17988	17993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683925
239	NC_017558	TCA	3	9	18017	18025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683925
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241	NC_017558	CAG	3	9	18042	18050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683925
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243	NC_017558	GGC	2	6	18143	18148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683926
244	NC_017558	CGG	2	6	18200	18205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683926
245	NC_017558	GTC	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683926
246	NC_017558	ACA	2	6	18267	18272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683926
247	NC_017558	CGC	2	6	18274	18279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683926
248	NC_017558	TGC	2	6	18324	18329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683926
249	NC_017558	GTA	2	6	18344	18349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683926
250	NC_017558	AGC	2	6	18419	18424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683926
251	NC_017558	CTG	2	6	18484	18489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683927
252	NC_017558	TGC	2	6	18630	18635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683927
253	NC_017558	ACC	2	6	18704	18709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683927
254	NC_017558	ACC	2	6	18730	18735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683927
255	NC_017558	CTT	2	6	18759	18764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683927
256	NC_017558	CGC	2	6	18777	18782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683927
257	NC_017558	CGT	2	6	18840	18845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683927
258	NC_017558	TTC	2	6	18883	18888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683927
259	NC_017558	GTT	2	6	18983	18988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683928
260	NC_017558	ACG	3	9	18996	19004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683928
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262	NC_017558	CGT	2	6	19031	19036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683928
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264	NC_017558	CAG	2	6	19142	19147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683928
265	NC_017558	CCA	3	9	19204	19212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683928
266	NC_017558	TCG	2	6	19393	19398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683928
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270	NC_017558	TCG	2	6	19636	19641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683929
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272	NC_017558	CAT	2	6	19698	19703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683929
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274	NC_017558	CCA	2	6	19764	19769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683929
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280	NC_017558	CGC	2	6	20209	20214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683930
281	NC_017558	GCG	2	6	20348	20353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683930
282	NC_017558	GCC	2	6	20371	20376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683930
283	NC_017558	GCC	2	6	20420	20425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683930
284	NC_017558	CGG	2	6	20469	20474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683930
285	NC_017558	ACG	2	6	20504	20509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683930
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289	NC_017558	CCG	2	6	20907	20912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683930
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372	NC_017558	GAA	2	6	26189	26194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683937
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