MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017066	TCATA	2	10	190831	190840	40 %	40 %	0 %	20 %	383752135
4003	NC_017066	AG	3	6	190845	190850	50 %	0 %	50 %	0 %	383752135
4004	NC_017066	TGT	2	6	190889	190894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752135
4005	NC_017066	CAC	2	6	190909	190914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752135
4006	NC_017066	ATA	2	6	190991	190996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752135
4007	NC_017066	TACT	2	8	191011	191018	25 %	50 %	0 %	25 %	383752135
4008	NC_017066	AGT	2	6	191034	191039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752135
4009	NC_017066	AGAAA	2	10	191067	191076	80 %	0 %	20 %	0 %	383752135
4010	NC_017066	ACC	2	6	191090	191095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752135
4011	NC_017066	TAT	2	6	191101	191106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4012	NC_017066	AGA	2	6	191126	191131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752135
4013	NC_017066	TCA	2	6	191142	191147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752135
4014	NC_017066	CAT	2	6	191161	191166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752135
4015	NC_017066	CTTTAG	2	12	191173	191184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383752135
4016	NC_017066	AGCTA	2	10	191189	191198	40 %	20 %	20 %	20 %	383752135
4017	NC_017066	AAT	2	6	191215	191220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752135
4018	NC_017066	AT	3	6	191253	191258	50 %	50 %	0 %	0 %	383752135
4019	NC_017066	CTT	2	6	191278	191283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752135
4020	NC_017066	CTT	2	6	191298	191303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752135
4021	NC_017066	TTA	2	6	191328	191333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4022	NC_017066	ATA	2	6	191334	191339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752135
4023	NC_017066	TTA	2	6	191346	191351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4024	NC_017066	AAT	2	6	191375	191380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752135
4025	NC_017066	T	6	6	191473	191478	0 %	100 %	0 %	0 %	383752135
4026	NC_017066	ATC	2	6	191486	191491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752135
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4028	NC_017066	TTA	2	6	191538	191543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4029	NC_017066	TAT	2	6	191572	191577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4030	NC_017066	AATAG	2	10	191618	191627	60 %	20 %	20 %	0 %	383752135
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4032	NC_017066	TACTC	2	10	191736	191745	20 %	40 %	0 %	40 %	383752135
4033	NC_017066	ATT	2	6	191765	191770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4034	NC_017066	A	6	6	191775	191780	100 %	0 %	0 %	0 %	383752135
4035	NC_017066	AAAT	2	8	191853	191860	75 %	25 %	0 %	0 %	383752135
4036	NC_017066	TGT	2	6	191914	191919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752135
4037	NC_017066	TAG	2	6	191950	191955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752135
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4039	NC_017066	ACT	2	6	192101	192106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752135
4040	NC_017066	CAT	2	6	192145	192150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752135
4041	NC_017066	TA	3	6	192155	192160	50 %	50 %	0 %	0 %	383752135
4042	NC_017066	ATATTT	2	12	192162	192173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4043	NC_017066	AAGTG	2	10	192179	192188	40 %	20 %	40 %	0 %	383752135
4044	NC_017066	TCT	2	6	192213	192218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752135
4045	NC_017066	ATT	2	6	192224	192229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752135
4046	NC_017066	TAG	2	6	192268	192273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752135
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4051	NC_017066	T	6	6	192640	192645	0 %	100 %	0 %	0 %	383752136
4052	NC_017066	TAA	2	6	192668	192673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752136
4053	NC_017066	ATT	3	9	192679	192687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752136
4054	NC_017066	GTA	2	6	192701	192706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752136
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4056	NC_017066	GTA	2	6	192797	192802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752136
4057	NC_017066	TAA	2	6	192807	192812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752136
4058	NC_017066	ATA	2	6	192842	192847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752136
4059	NC_017066	CCT	2	6	192907	192912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752136
4060	NC_017066	ATT	2	6	192940	192945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752136
4061	NC_017066	TAG	2	6	192983	192988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752136
4062	NC_017066	TCC	2	6	193008	193013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752136
4063	NC_017066	T	6	6	193073	193078	0 %	100 %	0 %	0 %	383752136
4064	NC_017066	CTTT	2	8	193082	193089	0 %	75 %	0 %	25 %	383752136
4065	NC_017066	T	6	6	193087	193092	0 %	100 %	0 %	0 %	383752136
4066	NC_017066	AGA	2	6	193170	193175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752136
4067	NC_017066	TTAA	2	8	193186	193193	50 %	50 %	0 %	0 %	383752136
4068	NC_017066	CTT	2	6	193259	193264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752136
4069	NC_017066	CTG	2	6	193280	193285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752136
4070	NC_017066	TGA	2	6	193287	193292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752136
4071	NC_017066	TAT	2	6	193308	193313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752136
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4074	NC_017066	GCAA	2	8	193369	193376	50 %	0 %	25 %	25 %	383752136
4075	NC_017066	TAAT	2	8	193378	193385	50 %	50 %	0 %	0 %	383752136
4076	NC_017066	CTG	2	6	193394	193399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752136
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4078	NC_017066	TGT	2	6	193461	193466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752136
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4082	NC_017066	T	6	6	193548	193553	0 %	100 %	0 %	0 %	383752136
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4090	NC_017066	TAA	2	6	194143	194148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752137
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4102	NC_017066	TGG	2	6	194616	194621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752138
4103	NC_017066	TTA	2	6	194645	194650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752138
4104	NC_017066	ATA	2	6	194660	194665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752138
4105	NC_017066	ATA	2	6	194672	194677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752138
4106	NC_017066	AAT	2	6	194679	194684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752138
4107	NC_017066	TTG	2	6	194714	194719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752138
4108	NC_017066	GAGTT	2	10	194720	194729	20 %	40 %	40 %	0 %	383752138
4109	NC_017066	T	7	7	194742	194748	0 %	100 %	0 %	0 %	383752138
4110	NC_017066	GAA	2	6	194761	194766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752138
4111	NC_017066	ATT	2	6	194770	194775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752138
4112	NC_017066	TAT	2	6	194867	194872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752138
4113	NC_017066	ATT	2	6	194961	194966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752138
4114	NC_017066	ATTT	2	8	195040	195047	25 %	75 %	0 %	0 %	383752138
4115	NC_017066	A	6	6	195061	195066	100 %	0 %	0 %	0 %	383752138
4116	NC_017066	CTA	2	6	196208	196213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752139
4117	NC_017066	ATC	2	6	196215	196220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752139
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4119	NC_017066	TTG	2	6	196430	196435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752140
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4121	NC_017066	CAT	2	6	196525	196530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752140
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4493	NC_017066	ACC	2	6	213726	213731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752154
4494	NC_017066	ATT	2	6	213750	213755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752154
4495	NC_017066	GT	3	6	213847	213852	0 %	50 %	50 %	0 %	383752154
4496	NC_017066	CTT	2	6	213860	213865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752154
4497	NC_017066	TAT	2	6	213872	213877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752154
4498	NC_017066	GTATCT	2	12	213889	213900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383752154
4499	NC_017066	CTT	2	6	213923	213928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752154
4500	NC_017066	AAT	2	6	214030	214035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752154

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