MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017066	GTA	2	6	166731	166736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3502	NC_017066	TCA	2	6	166754	166759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3503	NC_017066	A	7	7	166773	166779	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
3504	NC_017066	TTTA	2	8	166803	166810	25 %	75 %	0 %	0 %	383752116
3505	NC_017066	GCT	2	6	166851	166856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3506	NC_017066	TGG	2	6	166864	166869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
3507	NC_017066	AG	3	6	166914	166919	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
3508	NC_017066	TTGT	2	8	167020	167027	0 %	75 %	25 %	0 %	383752116
3509	NC_017066	ATG	2	6	167115	167120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3510	NC_017066	ACAA	2	8	167124	167131	75 %	0 %	0 %	25 %	383752116
3511	NC_017066	TAT	2	6	167159	167164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3512	NC_017066	TAT	2	6	167196	167201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3513	NC_017066	GAT	2	6	167237	167242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3514	NC_017066	TA	3	6	167275	167280	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3515	NC_017066	TAC	2	6	167366	167371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3516	NC_017066	TGGT	2	8	167386	167393	0 %	50 %	50 %	0 %	383752116
3517	NC_017066	TTA	2	6	167397	167402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3518	NC_017066	TAA	2	6	167435	167440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752116
3519	NC_017066	CTAA	2	8	167445	167452	50 %	25 %	0 %	25 %	383752116
3520	NC_017066	A	6	6	167451	167456	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
3521	NC_017066	AT	3	6	167458	167463	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3522	NC_017066	TTC	2	6	167558	167563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752116
3523	NC_017066	AAC	2	6	167653	167658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752116
3524	NC_017066	AGT	2	6	167702	167707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3525	NC_017066	ATG	2	6	167748	167753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3526	NC_017066	CCA	2	6	167769	167774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752116
3527	NC_017066	ATC	2	6	167791	167796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3528	NC_017066	TA	4	8	167810	167817	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3529	NC_017066	CAG	2	6	167850	167855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3530	NC_017066	AGC	2	6	167860	167865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3531	NC_017066	GGT	2	6	167868	167873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
3532	NC_017066	TAT	2	6	167921	167926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3533	NC_017066	AAGG	2	8	167937	167944	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
3534	NC_017066	TAT	2	6	168068	168073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3535	NC_017066	GA	3	6	168133	168138	50 %	0 %	50 %	0 %	383752116
3536	NC_017066	CTG	2	6	168175	168180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3537	NC_017066	AT	3	6	168187	168192	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3538	NC_017066	TTA	2	6	168235	168240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3539	NC_017066	AGT	2	6	168315	168320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3540	NC_017066	AGG	2	6	168458	168463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752116
3541	NC_017066	TGC	2	6	168464	168469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3542	NC_017066	TCT	2	6	168489	168494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752116
3543	NC_017066	GTT	2	6	168540	168545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
3544	NC_017066	GAA	2	6	168555	168560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752116
3545	NC_017066	ATT	3	9	168590	168598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3546	NC_017066	TGA	2	6	168602	168607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3547	NC_017066	TTG	2	6	168658	168663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
3548	NC_017066	ATG	2	6	168664	168669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3549	NC_017066	TATAC	2	10	168714	168723	40 %	40 %	0 %	20 %	383752116
3550	NC_017066	ATT	2	6	168726	168731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3551	NC_017066	TGA	2	6	168797	168802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3552	NC_017066	TTA	2	6	168826	168831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3553	NC_017066	GTG	2	6	168853	168858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
3554	NC_017066	TTAC	2	8	168938	168945	25 %	50 %	0 %	25 %	383752116
3555	NC_017066	AGA	2	6	168968	168973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752116
3556	NC_017066	ACT	3	9	169026	169034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3557	NC_017066	TGG	2	6	169046	169051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
3558	NC_017066	GTAGA	2	10	169123	169132	40 %	20 %	40 %	0 %	383752116
3559	NC_017066	TAT	3	9	169163	169171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3560	NC_017066	AT	3	6	169202	169207	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3561	NC_017066	TGT	2	6	169226	169231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752116
3562	NC_017066	A	6	6	169254	169259	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
3563	NC_017066	ATTG	2	8	169268	169275	25 %	50 %	25 %	0 %	383752116
3564	NC_017066	TAC	2	6	169288	169293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3565	NC_017066	AGG	2	6	169345	169350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752116
3566	NC_017066	TGA	2	6	169385	169390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3567	NC_017066	TTA	2	6	169405	169410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116
3568	NC_017066	GGT	2	6	169449	169454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752116
3569	NC_017066	TAG	2	6	169465	169470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3570	NC_017066	A	6	6	169474	169479	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
3571	NC_017066	TGA	2	6	169496	169501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752116
3572	NC_017066	CTG	2	6	169537	169542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
3573	NC_017066	CAT	2	6	169609	169614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3574	NC_017066	ACT	2	6	169623	169628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752116
3575	NC_017066	CTG	2	6	169714	169719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
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3582	NC_017066	TAA	2	6	171037	171042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752117
3583	NC_017066	TAG	2	6	171043	171048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752117
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3585	NC_017066	ACA	2	6	171110	171115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752117
3586	NC_017066	CTA	2	6	171136	171141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752117
3587	NC_017066	AATA	2	8	171164	171171	75 %	25 %	0 %	0 %	383752117
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3589	NC_017066	CTT	2	6	171223	171228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752117
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3591	NC_017066	AAG	2	6	171259	171264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752117
3592	NC_017066	AAT	2	6	171306	171311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752117
3593	NC_017066	ATT	2	6	171326	171331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752117
3594	NC_017066	A	6	6	171339	171344	100 %	0 %	0 %	0 %	383752117
3595	NC_017066	T	6	6	171363	171368	0 %	100 %	0 %	0 %	383752117
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3600	NC_017066	GGT	2	6	171630	171635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752117
3601	NC_017066	GATAT	2	10	171673	171682	40 %	40 %	20 %	0 %	383752117
3602	NC_017066	GCA	2	6	171693	171698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752117
3603	NC_017066	TTG	2	6	171766	171771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752117
3604	NC_017066	TGT	2	6	171809	171814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752117
3605	NC_017066	CTG	2	6	171835	171840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752117
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3608	NC_017066	TGA	2	6	172001	172006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752117
3609	NC_017066	TAA	2	6	172021	172026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752117
3610	NC_017066	GAA	2	6	172035	172040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752117
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3619	NC_017066	ATA	2	6	172420	172425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752118
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