MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017066	T	6	6	144023	144028	0 %	100 %	0 %	0 %	383752096
3003	NC_017066	CTG	2	6	144045	144050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752096
3004	NC_017066	CAG	2	6	144060	144065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752096
3005	NC_017066	TATCA	2	10	144070	144079	40 %	40 %	0 %	20 %	383752096
3006	NC_017066	GGT	2	6	144080	144085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752096
3007	NC_017066	TAA	2	6	144106	144111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752096
3008	NC_017066	GTA	2	6	144141	144146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752096
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3010	NC_017066	TGA	2	6	144186	144191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752096
3011	NC_017066	GCA	2	6	144215	144220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752096
3012	NC_017066	TG	3	6	144236	144241	0 %	50 %	50 %	0 %	383752096
3013	NC_017066	ATC	2	6	144253	144258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752096
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3015	NC_017066	TAA	2	6	144306	144311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752097
3016	NC_017066	ATATT	2	10	144385	144394	40 %	60 %	0 %	0 %	383752097
3017	NC_017066	T	6	6	144393	144398	0 %	100 %	0 %	0 %	383752097
3018	NC_017066	T	6	6	144518	144523	0 %	100 %	0 %	0 %	383752097
3019	NC_017066	GTG	2	6	144524	144529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752097
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3022	NC_017066	ATT	2	6	144627	144632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752097
3023	NC_017066	ATA	2	6	144647	144652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752097
3024	NC_017066	ATAA	2	8	144687	144694	75 %	25 %	0 %	0 %	383752097
3025	NC_017066	A	6	6	144714	144719	100 %	0 %	0 %	0 %	383752097
3026	NC_017066	AAT	2	6	144729	144734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752097
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3029	NC_017066	CTA	2	6	144839	144844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752097
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3031	NC_017066	CTA	2	6	144929	144934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752097
3032	NC_017066	T	8	8	144941	144948	0 %	100 %	0 %	0 %	383752097
3033	NC_017066	T	6	6	144981	144986	0 %	100 %	0 %	0 %	383752097
3034	NC_017066	TTC	2	6	145074	145079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752097
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3045	NC_017066	GCA	2	6	145561	145566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752098
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3057	NC_017066	ATA	3	9	146114	146122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752098
3058	NC_017066	CTG	2	6	146147	146152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752098
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3102	NC_017066	ATAG	2	8	147935	147942	50 %	25 %	25 %	0 %	383752100
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3114	NC_017066	AGTA	2	8	148300	148307	50 %	25 %	25 %	0 %	383752100
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3492	NC_017066	TAAT	2	8	166480	166487	50 %	50 %	0 %	0 %	383752116
3493	NC_017066	AAT	2	6	166491	166496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752116
3494	NC_017066	ATA	2	6	166533	166538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752116
3495	NC_017066	A	6	6	166549	166554	100 %	0 %	0 %	0 %	383752116
3496	NC_017066	AAG	2	6	166564	166569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752116
3497	NC_017066	GTC	2	6	166594	166599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752116
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3500	NC_017066	ATT	2	6	166708	166713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752116

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