MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017066	T	6	6	290034	290039	0 %	100 %	0 %	0 %	383752205
6003	NC_017066	ATA	3	9	290060	290068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752205
6004	NC_017066	TA	3	6	290108	290113	50 %	50 %	0 %	0 %	383752205
6005	NC_017066	ATA	2	6	290126	290131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752205
6006	NC_017066	TTA	2	6	290181	290186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752205
6007	NC_017066	ATA	2	6	290201	290206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752205
6008	NC_017066	AAAT	2	8	290249	290256	75 %	25 %	0 %	0 %	383752205
6009	NC_017066	TGT	2	6	290463	290468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752206
6010	NC_017066	TGG	2	6	290509	290514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752206
6011	NC_017066	A	6	6	290526	290531	100 %	0 %	0 %	0 %	383752206
6012	NC_017066	TAT	2	6	290565	290570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752206
6013	NC_017066	ATA	2	6	290621	290626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752206
6014	NC_017066	TAA	2	6	290633	290638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752206
6015	NC_017066	A	6	6	290665	290670	100 %	0 %	0 %	0 %	383752206
6016	NC_017066	TAT	2	6	290695	290700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752206
6017	NC_017066	TAC	2	6	290733	290738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752206
6018	NC_017066	GA	3	6	290770	290775	50 %	0 %	50 %	0 %	383752206
6019	NC_017066	TTA	2	6	290777	290782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752206
6020	NC_017066	CAG	2	6	290881	290886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752206
6021	NC_017066	A	6	6	290919	290924	100 %	0 %	0 %	0 %	383752206
6022	NC_017066	AGT	2	6	290970	290975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752207
6023	NC_017066	GTT	2	6	291118	291123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752207
6024	NC_017066	AAT	2	6	291124	291129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752207
6025	NC_017066	TA	3	6	291163	291168	50 %	50 %	0 %	0 %	383752207
6026	NC_017066	ATG	2	6	291215	291220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752207
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6028	NC_017066	GTA	2	6	291361	291366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752207
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6031	NC_017066	TAT	2	6	293046	293051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752208
6032	NC_017066	GTT	2	6	293079	293084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752208
6033	NC_017066	CAT	2	6	293136	293141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752208
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6035	NC_017066	TCT	2	6	293195	293200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752208
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6041	NC_017066	TAC	2	6	293427	293432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752209
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6045	NC_017066	T	6	6	293508	293513	0 %	100 %	0 %	0 %	383752209
6046	NC_017066	T	8	8	293540	293547	0 %	100 %	0 %	0 %	383752209
6047	NC_017066	AT	3	6	293581	293586	50 %	50 %	0 %	0 %	383752209
6048	NC_017066	ATATCT	2	12	293632	293643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383752209
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6053	NC_017066	TTA	2	6	293827	293832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752209
6054	NC_017066	TTTG	2	8	293846	293853	0 %	75 %	25 %	0 %	383752209
6055	NC_017066	ACG	2	6	293871	293876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752209
6056	NC_017066	TAAA	2	8	293879	293886	75 %	25 %	0 %	0 %	383752209
6057	NC_017066	GCT	2	6	293905	293910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752209
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