MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017066	TA	3	6	267672	267677	50 %	50 %	0 %	0 %	383752189
5503	NC_017066	ATC	2	6	267689	267694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752189
5504	NC_017066	AT	3	6	267969	267974	50 %	50 %	0 %	0 %	383752190
5505	NC_017066	A	7	7	267976	267982	100 %	0 %	0 %	0 %	383752190
5506	NC_017066	TAT	2	6	267993	267998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752190
5507	NC_017066	GAA	2	6	268009	268014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752190
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5509	NC_017066	TGA	2	6	268056	268061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752190
5510	NC_017066	TAG	3	9	268067	268075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752190
5511	NC_017066	TGA	2	6	268089	268094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752190
5512	NC_017066	CTTGG	2	10	268142	268151	0 %	40 %	40 %	20 %	383752190
5513	NC_017066	TG	3	6	268184	268189	0 %	50 %	50 %	0 %	383752190
5514	NC_017066	TGA	2	6	268218	268223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752190
5515	NC_017066	ATCAA	2	10	268298	268307	60 %	20 %	0 %	20 %	383752190
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5518	NC_017066	TA	3	6	268376	268381	50 %	50 %	0 %	0 %	383752190
5519	NC_017066	A	6	6	268384	268389	100 %	0 %	0 %	0 %	383752190
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5522	NC_017066	ATT	2	6	268499	268504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752190
5523	NC_017066	TAAA	2	8	268529	268536	75 %	25 %	0 %	0 %	383752190
5524	NC_017066	AGCA	2	8	268556	268563	50 %	0 %	25 %	25 %	383752190
5525	NC_017066	A	6	6	268584	268589	100 %	0 %	0 %	0 %	383752190
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5529	NC_017066	AAT	2	6	268692	268697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752190
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5537	NC_017066	A	6	6	269019	269024	100 %	0 %	0 %	0 %	383752191
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5547	NC_017066	TTTA	2	8	269549	269556	25 %	75 %	0 %	0 %	383752191
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5552	NC_017066	CAT	2	6	269729	269734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752191
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5554	NC_017066	TGG	3	9	269784	269792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752191
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5559	NC_017066	AGTA	2	8	269973	269980	50 %	25 %	25 %	0 %	383752191
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5587	NC_017066	T	6	6	270820	270825	0 %	100 %	0 %	0 %	383752192
5588	NC_017066	TTAT	2	8	270833	270840	25 %	75 %	0 %	0 %	383752192
5589	NC_017066	TTG	2	6	270858	270863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752192
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5596	NC_017066	A	6	6	272065	272070	100 %	0 %	0 %	0 %	383752193
5597	NC_017066	ATTTTC	2	12	272075	272086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383752193
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5606	NC_017066	TTA	3	9	272681	272689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752194
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5610	NC_017066	GGGATA	2	12	272794	272805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383752194
5611	NC_017066	T	8	8	272817	272824	0 %	100 %	0 %	0 %	383752194
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5617	NC_017066	GGTAT	2	10	273159	273168	20 %	40 %	40 %	0 %	383752194
5618	NC_017066	TA	4	8	273191	273198	50 %	50 %	0 %	0 %	383752194
5619	NC_017066	AT	3	6	273212	273217	50 %	50 %	0 %	0 %	383752194
5620	NC_017066	A	9	9	273221	273229	100 %	0 %	0 %	0 %	383752194
5621	NC_017066	AT	3	6	273242	273247	50 %	50 %	0 %	0 %	383752194
5622	NC_017066	GAT	2	6	273342	273347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752194
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5998	NC_017066	AATA	2	8	289926	289933	75 %	25 %	0 %	0 %	383752205
5999	NC_017066	AGC	2	6	289947	289952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752205
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