MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 22257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017066	TCA	2	6	214039	214044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752154
4502	NC_017066	TAT	2	6	214119	214124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752154
4503	NC_017066	TTG	2	6	214224	214229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752155
4504	NC_017066	TAT	2	6	214232	214237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4505	NC_017066	CTG	2	6	214256	214261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4506	NC_017066	TTC	2	6	214272	214277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4507	NC_017066	TTA	2	6	214300	214305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4508	NC_017066	CTT	2	6	214313	214318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4509	NC_017066	CAT	2	6	214325	214330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4510	NC_017066	TA	3	6	214344	214349	50 %	50 %	0 %	0 %	383752155
4511	NC_017066	TTC	2	6	214374	214379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4512	NC_017066	AAAT	2	8	214388	214395	75 %	25 %	0 %	0 %	383752155
4513	NC_017066	TTA	2	6	214405	214410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4514	NC_017066	T	7	7	214413	214419	0 %	100 %	0 %	0 %	383752155
4515	NC_017066	T	6	6	214439	214444	0 %	100 %	0 %	0 %	383752155
4516	NC_017066	TAT	2	6	214487	214492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4517	NC_017066	AGT	2	6	214599	214604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752155
4518	NC_017066	TCA	2	6	214618	214623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4519	NC_017066	TAA	2	6	214650	214655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752155
4520	NC_017066	GAC	2	6	214706	214711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4521	NC_017066	AGT	2	6	214737	214742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752155
4522	NC_017066	TTC	2	6	214764	214769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4523	NC_017066	TC	3	6	214788	214793	0 %	50 %	0 %	50 %	383752155
4524	NC_017066	AGT	2	6	214843	214848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752155
4525	NC_017066	ACA	2	6	214849	214854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752155
4526	NC_017066	T	6	6	214963	214968	0 %	100 %	0 %	0 %	383752155
4527	NC_017066	ATT	2	6	215064	215069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4528	NC_017066	TA	3	6	215076	215081	50 %	50 %	0 %	0 %	383752155
4529	NC_017066	TGT	2	6	215082	215087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752155
4530	NC_017066	ATC	2	6	215088	215093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4531	NC_017066	CTG	2	6	215207	215212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4532	NC_017066	CAAT	2	8	215218	215225	50 %	25 %	0 %	25 %	383752155
4533	NC_017066	GTT	2	6	215236	215241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752155
4534	NC_017066	AAT	2	6	215263	215268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752155
4535	NC_017066	T	7	7	215339	215345	0 %	100 %	0 %	0 %	383752155
4536	NC_017066	TCC	2	6	215400	215405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752155
4537	NC_017066	ATA	2	6	215490	215495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752155
4538	NC_017066	CCA	2	6	215645	215650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752155
4539	NC_017066	ATC	2	6	215718	215723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4540	NC_017066	AGC	2	6	215745	215750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4541	NC_017066	ATT	2	6	215823	215828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4542	NC_017066	CCA	2	6	215848	215853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752155
4543	NC_017066	CT	3	6	215887	215892	0 %	50 %	0 %	50 %	383752155
4544	NC_017066	CTA	2	6	215894	215899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4545	NC_017066	AGC	2	6	215916	215921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4546	NC_017066	TGC	2	6	215951	215956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4547	NC_017066	ATTG	2	8	216012	216019	25 %	50 %	25 %	0 %	383752155
4548	NC_017066	TCT	2	6	216059	216064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4549	NC_017066	CTG	2	6	216083	216088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752155
4550	NC_017066	TCA	2	6	216130	216135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4551	NC_017066	ACT	2	6	216190	216195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4552	NC_017066	TTAG	2	8	216196	216203	25 %	50 %	25 %	0 %	383752155
4553	NC_017066	CCTC	2	8	216213	216220	0 %	25 %	0 %	75 %	383752155
4554	NC_017066	TTC	2	6	216243	216248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4555	NC_017066	AGA	2	6	216297	216302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752155
4556	NC_017066	CAC	2	6	216305	216310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752155
4557	NC_017066	TGTA	2	8	216345	216352	25 %	50 %	25 %	0 %	383752155
4558	NC_017066	TTCTAC	2	12	216369	216380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383752155
4559	NC_017066	TA	3	6	216443	216448	50 %	50 %	0 %	0 %	383752155
4560	NC_017066	T	7	7	216454	216460	0 %	100 %	0 %	0 %	383752155
4561	NC_017066	TCT	2	6	216589	216594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4562	NC_017066	ACT	2	6	216600	216605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752155
4563	NC_017066	AAT	2	6	216689	216694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752155
4564	NC_017066	ATT	3	9	216762	216770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4565	NC_017066	ATTAGG	2	12	216789	216800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752155
4566	NC_017066	TTA	2	6	216823	216828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4567	NC_017066	ATT	2	6	216837	216842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4568	NC_017066	A	6	6	216858	216863	100 %	0 %	0 %	0 %	383752155
4569	NC_017066	TA	3	6	216911	216916	50 %	50 %	0 %	0 %	383752155
4570	NC_017066	TTC	2	6	216918	216923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752155
4571	NC_017066	AAAT	2	8	216945	216952	75 %	25 %	0 %	0 %	383752155
4572	NC_017066	TTA	2	6	216961	216966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752155
4573	NC_017066	ATT	2	6	217364	217369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4574	NC_017066	TCA	2	6	217431	217436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752156
4575	NC_017066	AGTT	2	8	217502	217509	25 %	50 %	25 %	0 %	383752156
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4578	NC_017066	CTG	2	6	217570	217575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752156
4579	NC_017066	TTC	2	6	217580	217585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752156
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4581	NC_017066	T	7	7	217637	217643	0 %	100 %	0 %	0 %	383752156
4582	NC_017066	ATAA	2	8	217659	217666	75 %	25 %	0 %	0 %	383752156
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4585	NC_017066	ATT	2	6	217896	217901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4586	NC_017066	T	6	6	217967	217972	0 %	100 %	0 %	0 %	383752156
4587	NC_017066	TTA	2	6	217984	217989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4588	NC_017066	A	6	6	218017	218022	100 %	0 %	0 %	0 %	383752156
4589	NC_017066	TAC	2	6	218035	218040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752156
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4591	NC_017066	TTAA	2	8	218055	218062	50 %	50 %	0 %	0 %	383752156
4592	NC_017066	CTT	2	6	218110	218115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752156
4593	NC_017066	GT	3	6	218141	218146	0 %	50 %	50 %	0 %	383752156
4594	NC_017066	TAAA	2	8	218149	218156	75 %	25 %	0 %	0 %	383752156
4595	NC_017066	ATT	2	6	218165	218170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4596	NC_017066	T	6	6	218169	218174	0 %	100 %	0 %	0 %	383752156
4597	NC_017066	TTGCT	2	10	218176	218185	0 %	60 %	20 %	20 %	383752156
4598	NC_017066	GTA	3	9	218202	218210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752156
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4600	NC_017066	T	9	9	218222	218230	0 %	100 %	0 %	0 %	383752156
4601	NC_017066	TGTT	2	8	218235	218242	0 %	75 %	25 %	0 %	383752156
4602	NC_017066	T	7	7	218263	218269	0 %	100 %	0 %	0 %	383752156
4603	NC_017066	TTA	2	6	218295	218300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4604	NC_017066	TGA	2	6	218329	218334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752156
4605	NC_017066	AGA	2	6	218348	218353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752156
4606	NC_017066	ACG	2	6	218374	218379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752156
4607	NC_017066	TTA	2	6	218386	218391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752156
4608	NC_017066	TCGT	2	8	218394	218401	0 %	50 %	25 %	25 %	383752156
4609	NC_017066	AT	3	6	218449	218454	50 %	50 %	0 %	0 %	383752156
4610	NC_017066	TCTT	2	8	218619	218626	0 %	75 %	0 %	25 %	383752157
4611	NC_017066	TAA	2	6	218659	218664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752157
4612	NC_017066	TCTG	2	8	218726	218733	0 %	50 %	25 %	25 %	383752157
4613	NC_017066	T	6	6	218790	218795	0 %	100 %	0 %	0 %	383752157
4614	NC_017066	GT	3	6	218839	218844	0 %	50 %	50 %	0 %	383752157
4615	NC_017066	T	7	7	218875	218881	0 %	100 %	0 %	0 %	383752157
4616	NC_017066	TCA	2	6	218933	218938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752157
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4618	NC_017066	AAG	2	6	218973	218978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752157
4619	NC_017066	AGCA	2	8	218986	218993	50 %	0 %	25 %	25 %	383752157
4620	NC_017066	CAC	2	6	219009	219014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752157
4621	NC_017066	TTA	2	6	219026	219031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752157
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4996	NC_017066	A	6	6	239611	239616	100 %	0 %	0 %	0 %	383752171
4997	NC_017066	TCA	2	6	239618	239623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752171
4998	NC_017066	T	6	6	239655	239660	0 %	100 %	0 %	0 %	383752171
4999	NC_017066	ATA	2	6	239671	239676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752171
5000	NC_017066	TTG	2	6	239740	239745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752171

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