MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 2877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017065	TTAT	2	8	2699	2706	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
2	NC_017065	TTAT	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	383750645
3	NC_017065	AACT	2	8	3304	3311	50 %	25 %	0 %	25 %	383750646
4	NC_017065	CAAA	2	8	3350	3357	75 %	0 %	0 %	25 %	383750646
5	NC_017065	TATT	2	8	3617	3624	25 %	75 %	0 %	0 %	383750646
6	NC_017065	TCGC	2	8	3747	3754	0 %	25 %	25 %	50 %	383750646
7	NC_017065	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	383750646
8	NC_017065	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	383750646
9	NC_017065	ATTT	2	8	6559	6566	25 %	75 %	0 %	0 %	383750648
10	NC_017065	ATAA	2	8	7112	7119	75 %	25 %	0 %	0 %	383750649
11	NC_017065	ACTT	2	8	7495	7502	25 %	50 %	0 %	25 %	383750650
12	NC_017065	ATTT	2	8	7902	7909	25 %	75 %	0 %	0 %	383750650
13	NC_017065	ATGA	2	8	13446	13453	50 %	25 %	25 %	0 %	383750655
14	NC_017065	TAAA	2	8	14469	14476	75 %	25 %	0 %	0 %	383750656
15	NC_017065	TAAA	2	8	14628	14635	75 %	25 %	0 %	0 %	383750656
16	NC_017065	TCAT	2	8	14749	14756	25 %	50 %	0 %	25 %	383750656
17	NC_017065	CTTT	2	8	14883	14890	0 %	75 %	0 %	25 %	383750656
18	NC_017065	GCAA	2	8	15223	15230	50 %	0 %	25 %	25 %	383750657
19	NC_017065	TCTT	2	8	15300	15307	0 %	75 %	0 %	25 %	383750657
20	NC_017065	AGTA	2	8	15558	15565	50 %	25 %	25 %	0 %	383750658
21	NC_017065	GCTT	2	8	16084	16091	0 %	50 %	25 %	25 %	383750659
22	NC_017065	AATT	2	8	16433	16440	50 %	50 %	0 %	0 %	383750659
23	NC_017065	GCTT	2	8	16704	16711	0 %	50 %	25 %	25 %	383750659
24	NC_017065	AATA	2	8	17057	17064	75 %	25 %	0 %	0 %	383750660
25	NC_017065	TCTA	2	8	17524	17531	25 %	50 %	0 %	25 %	383750660
26	NC_017065	ACGT	2	8	17947	17954	25 %	25 %	25 %	25 %	383750660
27	NC_017065	CTTG	2	8	18062	18069	0 %	50 %	25 %	25 %	383750660
28	NC_017065	AGTA	2	8	19059	19066	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
29	NC_017065	ATTA	2	8	19084	19091	50 %	50 %	0 %	0 %	383750662
30	NC_017065	AATA	2	8	19128	19135	75 %	25 %	0 %	0 %	383750662
31	NC_017065	CTTT	2	8	19173	19180	0 %	75 %	0 %	25 %	383750662
32	NC_017065	TGAA	2	8	19321	19328	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
33	NC_017065	TAAA	2	8	19364	19371	75 %	25 %	0 %	0 %	383750662
34	NC_017065	AGAT	2	8	19552	19559	50 %	25 %	25 %	0 %	383750662
35	NC_017065	TAAA	2	8	19717	19724	75 %	25 %	0 %	0 %	383750663
36	NC_017065	GTAA	2	8	21371	21378	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
37	NC_017065	AGAT	2	8	21625	21632	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
38	NC_017065	AGCA	2	8	21744	21751	50 %	0 %	25 %	25 %	383750665
39	NC_017065	AAAT	2	8	21787	21794	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
40	NC_017065	AATG	2	8	21988	21995	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
41	NC_017065	ATTA	2	8	22289	22296	50 %	50 %	0 %	0 %	383750665
42	NC_017065	ATAG	2	8	22337	22344	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
43	NC_017065	ATAG	2	8	22349	22356	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
44	NC_017065	CGTT	2	8	22767	22774	0 %	50 %	25 %	25 %	383750665
45	NC_017065	CAAA	2	8	23084	23091	75 %	0 %	0 %	25 %	383750665
46	NC_017065	TAGT	2	8	23214	23221	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
47	NC_017065	AGTT	2	8	23314	23321	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
48	NC_017065	GTTA	2	8	24005	24012	25 %	50 %	25 %	0 %	383750665
49	NC_017065	TAAA	2	8	24561	24568	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
50	NC_017065	AAGT	2	8	25086	25093	50 %	25 %	25 %	0 %	383750665
51	NC_017065	TTCA	2	8	25644	25651	25 %	50 %	0 %	25 %	383750665
52	NC_017065	AATA	2	8	26137	26144	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
53	NC_017065	TAAA	2	8	26283	26290	75 %	25 %	0 %	0 %	383750665
54	NC_017065	TAAT	2	8	27953	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
55	NC_017065	AAGA	2	8	28105	28112	75 %	0 %	25 %	0 %	383750666
56	NC_017065	AAAT	2	8	28197	28204	75 %	25 %	0 %	0 %	383750666
57	NC_017065	ATTA	2	8	28225	28232	50 %	50 %	0 %	0 %	383750666
58	NC_017065	TAAA	2	8	29405	29412	75 %	25 %	0 %	0 %	383750669
59	NC_017065	GCTA	2	8	29415	29422	25 %	25 %	25 %	25 %	383750669
60	NC_017065	TCTA	2	8	30164	30171	25 %	50 %	0 %	25 %	383750671
61	NC_017065	ATTT	2	8	30208	30215	25 %	75 %	0 %	0 %	383750671
62	NC_017065	TGTC	2	8	30272	30279	0 %	50 %	25 %	25 %	383750671
63	NC_017065	ATAC	2	8	30869	30876	50 %	25 %	0 %	25 %	383750674
64	NC_017065	ATAA	2	8	31293	31300	75 %	25 %	0 %	0 %	383750674
65	NC_017065	CACT	2	8	31387	31394	25 %	25 %	0 %	50 %	383750674
66	NC_017065	TATT	2	8	32211	32218	25 %	75 %	0 %	0 %	383750676
67	NC_017065	AATT	2	8	33845	33852	50 %	50 %	0 %	0 %	383750679
68	NC_017065	TACC	2	8	33935	33942	25 %	25 %	0 %	50 %	383750679
69	NC_017065	GTTA	2	8	34317	34324	25 %	50 %	25 %	0 %	383750679
70	NC_017065	AAAC	2	8	35744	35751	75 %	0 %	0 %	25 %	383750681
71	NC_017065	TTAG	2	8	35920	35927	25 %	50 %	25 %	0 %	383750681
72	NC_017065	TTGC	2	8	36215	36222	0 %	50 %	25 %	25 %	383750681
73	NC_017065	ACTA	2	8	36369	36376	50 %	25 %	0 %	25 %	383750681
74	NC_017065	TTCC	2	8	36455	36462	0 %	50 %	0 %	50 %	383750681
75	NC_017065	TGTT	2	8	36923	36930	0 %	75 %	25 %	0 %	383750682
76	NC_017065	TATT	2	8	37564	37571	25 %	75 %	0 %	0 %	383750683
77	NC_017065	GTAA	2	8	37575	37582	50 %	25 %	25 %	0 %	383750683
78	NC_017065	GCTT	2	8	39139	39146	0 %	50 %	25 %	25 %	383750684
79	NC_017065	TAAA	2	8	41751	41758	75 %	25 %	0 %	0 %	383750688
80	NC_017065	ATTT	2	8	41856	41863	25 %	75 %	0 %	0 %	383750688
81	NC_017065	TAAT	2	8	43098	43105	50 %	50 %	0 %	0 %	383750689
82	NC_017065	GAAA	2	8	43482	43489	75 %	0 %	25 %	0 %	383750690
83	NC_017065	ATTT	2	8	43526	43533	25 %	75 %	0 %	0 %	383750690
84	NC_017065	ACAA	2	8	43793	43800	75 %	0 %	0 %	25 %	383750690
85	NC_017065	AAAT	2	8	43997	44004	75 %	25 %	0 %	0 %	383750691
86	NC_017065	TAAC	2	8	45882	45889	50 %	25 %	0 %	25 %	383750693
87	NC_017065	ATTC	2	8	46310	46317	25 %	50 %	0 %	25 %	383750693
88	NC_017065	ATCA	2	8	47351	47358	50 %	25 %	0 %	25 %	383750694
89	NC_017065	TGCC	2	8	47661	47668	0 %	25 %	25 %	50 %	383750694
90	NC_017065	TATC	2	8	48220	48227	25 %	50 %	0 %	25 %	383750694
91	NC_017065	TTAA	2	8	48243	48250	50 %	50 %	0 %	0 %	383750694
92	NC_017065	TTGC	2	8	49690	49697	0 %	50 %	25 %	25 %	383750696
93	NC_017065	TGTT	2	8	50059	50066	0 %	75 %	25 %	0 %	383750697
94	NC_017065	AAGT	2	8	50096	50103	50 %	25 %	25 %	0 %	383750697
95	NC_017065	TAAA	2	8	53216	53223	75 %	25 %	0 %	0 %	383750698
96	NC_017065	GAGG	2	8	53242	53249	25 %	0 %	75 %	0 %	383750698
97	NC_017065	ATTG	2	8	53625	53632	25 %	50 %	25 %	0 %	383750698
98	NC_017065	TTAT	2	8	53839	53846	25 %	75 %	0 %	0 %	383750698
99	NC_017065	TGCT	2	8	53921	53928	0 %	50 %	25 %	25 %	383750698
100	NC_017065	GTGA	2	8	54028	54035	25 %	25 %	50 %	0 %	383750698
101	NC_017065	GTTC	2	8	54806	54813	0 %	50 %	25 %	25 %	383750698
102	NC_017065	GACC	2	8	54824	54831	25 %	0 %	25 %	50 %	383750698
103	NC_017065	AAAT	2	8	55544	55551	75 %	25 %	0 %	0 %	383750698
104	NC_017065	TAAG	2	8	55954	55961	50 %	25 %	25 %	0 %	383750699
105	NC_017065	ATAA	2	8	56581	56588	75 %	25 %	0 %	0 %	383750700
106	NC_017065	CTTT	2	8	57281	57288	0 %	75 %	0 %	25 %	383750700
107	NC_017065	TTGC	2	8	58250	58257	0 %	50 %	25 %	25 %	383750701
108	NC_017065	ATAA	2	8	58282	58289	75 %	25 %	0 %	0 %	383750701
109	NC_017065	ATAA	2	8	58336	58343	75 %	25 %	0 %	0 %	383750701
110	NC_017065	CATC	2	8	58473	58480	25 %	25 %	0 %	50 %	383750701
111	NC_017065	ATTT	3	12	58649	58660	25 %	75 %	0 %	0 %	383750701
112	NC_017065	TTTA	2	8	58999	59006	25 %	75 %	0 %	0 %	383750702
113	NC_017065	AACG	2	8	59021	59028	50 %	0 %	25 %	25 %	383750702
114	NC_017065	GTTA	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	383750703
115	NC_017065	AGAA	2	8	60037	60044	75 %	0 %	25 %	0 %	383750704
116	NC_017065	AAAG	2	8	60417	60424	75 %	0 %	25 %	0 %	383750705
117	NC_017065	TAAA	2	8	60484	60491	75 %	25 %	0 %	0 %	383750705
118	NC_017065	AAGA	2	8	61602	61609	75 %	0 %	25 %	0 %	383750707
119	NC_017065	TAAT	2	8	62418	62425	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
120	NC_017065	ATTA	2	8	62494	62501	50 %	50 %	0 %	0 %	383750707
121	NC_017065	GAAT	2	8	63316	63323	50 %	25 %	25 %	0 %	383750708
122	NC_017065	CAAG	2	8	63547	63554	50 %	0 %	25 %	25 %	383750708
123	NC_017065	ATGG	2	8	63870	63877	25 %	25 %	50 %	0 %	383750708
124	NC_017065	AAGA	2	8	64155	64162	75 %	0 %	25 %	0 %	383750708
125	NC_017065	GAAA	2	8	64241	64248	75 %	0 %	25 %	0 %	383750708
126	NC_017065	TTAA	2	8	66024	66031	50 %	50 %	0 %	0 %	383750711
127	NC_017065	GGAA	2	8	66080	66087	50 %	0 %	50 %	0 %	383750711
128	NC_017065	GCAT	2	8	66132	66139	25 %	25 %	25 %	25 %	383750711
129	NC_017065	TGCT	2	8	66359	66366	0 %	50 %	25 %	25 %	383750711
130	NC_017065	AATT	2	8	67204	67211	50 %	50 %	0 %	0 %	383750713
131	NC_017065	TGTT	2	8	67464	67471	0 %	75 %	25 %	0 %	383750713
132	NC_017065	TGAT	2	8	68013	68020	25 %	50 %	25 %	0 %	383750713
133	NC_017065	AATT	2	8	68394	68401	50 %	50 %	0 %	0 %	383750713
134	NC_017065	AAAC	2	8	68968	68975	75 %	0 %	0 %	25 %	383750714
135	NC_017065	TGTT	2	8	69478	69485	0 %	75 %	25 %	0 %	383750716
136	NC_017065	TTAT	2	8	69611	69618	25 %	75 %	0 %	0 %	383750716
137	NC_017065	AACT	2	8	70000	70007	50 %	25 %	0 %	25 %	383750716
138	NC_017065	GAAT	2	8	70779	70786	50 %	25 %	25 %	0 %	383750717
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