MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017065	CTT	3	9	204542	204550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750830
4002	NC_017065	CGC	2	6	204572	204577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750830
4003	NC_017065	ATT	2	6	204607	204612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750830
4004	NC_017065	CAAG	2	8	204626	204633	50 %	0 %	25 %	25 %	383750830
4005	NC_017065	ATG	2	6	204670	204675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750830
4006	NC_017065	GAATT	2	10	204680	204689	40 %	40 %	20 %	0 %	383750830
4007	NC_017065	CGC	2	6	204725	204730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750830
4008	NC_017065	T	6	6	204823	204828	0 %	100 %	0 %	0 %	383750830
4009	NC_017065	GCT	2	6	204838	204843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750830
4010	NC_017065	TGA	2	6	204852	204857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750830
4011	NC_017065	AAT	2	6	205094	205099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750830
4012	NC_017065	ATTT	3	12	205121	205132	25 %	75 %	0 %	0 %	383750830
4013	NC_017065	AAGCCC	2	12	205140	205151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383750830
4014	NC_017065	TGC	2	6	205209	205214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750830
4015	NC_017065	TGC	2	6	205245	205250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750830
4016	NC_017065	TAC	2	6	205259	205264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750830
4017	NC_017065	A	6	6	205271	205276	100 %	0 %	0 %	0 %	383750830
4018	NC_017065	AT	3	6	205351	205356	50 %	50 %	0 %	0 %	383750830
4019	NC_017065	CAG	2	6	205498	205503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750831
4020	NC_017065	TAAA	2	8	205546	205553	75 %	25 %	0 %	0 %	383750831
4021	NC_017065	ATA	2	6	205566	205571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4022	NC_017065	ATT	2	6	205655	205660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750831
4023	NC_017065	ACG	2	6	205679	205684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750831
4024	NC_017065	ATA	2	6	205703	205708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4025	NC_017065	GAT	2	6	205725	205730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750831
4026	NC_017065	ATA	2	6	205749	205754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4027	NC_017065	TCC	2	6	205767	205772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750831
4028	NC_017065	GAA	2	6	205875	205880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750831
4029	NC_017065	TAA	2	6	205902	205907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4030	NC_017065	AGT	2	6	205971	205976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750831
4031	NC_017065	ATA	2	6	206001	206006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4032	NC_017065	AAT	2	6	206015	206020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750831
4033	NC_017065	CAT	2	6	206141	206146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750831
4034	NC_017065	GCC	2	6	206303	206308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750831
4035	NC_017065	AGC	2	6	206324	206329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750831
4036	NC_017065	CTG	2	6	206350	206355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750831
4037	NC_017065	GAA	2	6	206370	206375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750831
4038	NC_017065	ATC	2	6	206399	206404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750831
4039	NC_017065	AAC	2	6	206437	206442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750831
4040	NC_017065	GCT	2	6	206673	206678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750831
4041	NC_017065	T	6	6	206793	206798	0 %	100 %	0 %	0 %	383750831
4042	NC_017065	GTTT	2	8	206827	206834	0 %	75 %	25 %	0 %	383750831
4043	NC_017065	ATT	2	6	206847	206852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750832
4044	NC_017065	CAA	2	6	206853	206858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750832
4045	NC_017065	CTT	2	6	206883	206888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750832
4046	NC_017065	ATA	2	6	207050	207055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750832
4047	NC_017065	A	6	6	207070	207075	100 %	0 %	0 %	0 %	383750832
4048	NC_017065	TCT	2	6	207089	207094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750832
4049	NC_017065	CTT	3	9	207132	207140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750832
4050	NC_017065	AT	3	6	207457	207462	50 %	50 %	0 %	0 %	383750833
4051	NC_017065	CTT	2	6	207504	207509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750833
4052	NC_017065	TAG	2	6	207511	207516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750833
4053	NC_017065	T	6	6	207521	207526	0 %	100 %	0 %	0 %	383750833
4054	NC_017065	AAT	2	6	207527	207532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750833
4055	NC_017065	CCTG	2	8	207574	207581	0 %	25 %	25 %	50 %	383750833
4056	NC_017065	CTAA	2	8	207611	207618	50 %	25 %	0 %	25 %	383750833
4057	NC_017065	ATTTT	2	10	207626	207635	20 %	80 %	0 %	0 %	383750833
4058	NC_017065	TTG	2	6	207730	207735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750834
4059	NC_017065	CTG	2	6	207751	207756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750834
4060	NC_017065	ATT	2	6	207797	207802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750834
4061	NC_017065	T	6	6	207807	207812	0 %	100 %	0 %	0 %	383750834
4062	NC_017065	CAA	2	6	207875	207880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750834
4063	NC_017065	CCT	2	6	207884	207889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750834
4064	NC_017065	ATG	2	6	207894	207899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750834
4065	NC_017065	ATT	2	6	207956	207961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750835
4066	NC_017065	TTA	2	6	207978	207983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750835
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4068	NC_017065	ATC	2	6	208006	208011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750835
4069	NC_017065	ATG	2	6	208042	208047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750835
4070	NC_017065	TCT	2	6	208105	208110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750835
4071	NC_017065	TCTT	2	8	208177	208184	0 %	75 %	0 %	25 %	383750835
4072	NC_017065	CCGT	2	8	208220	208227	0 %	25 %	25 %	50 %	383750835
4073	NC_017065	GAT	2	6	208274	208279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750835
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4075	NC_017065	ATTT	2	8	208884	208891	25 %	75 %	0 %	0 %	383750836
4076	NC_017065	TTA	2	6	208934	208939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750836
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4078	NC_017065	T	8	8	208988	208995	0 %	100 %	0 %	0 %	383750836
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4081	NC_017065	TAC	2	6	209125	209130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750836
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4090	NC_017065	T	6	6	209488	209493	0 %	100 %	0 %	0 %	383750836
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4103	NC_017065	ATATA	2	10	209820	209829	60 %	40 %	0 %	0 %	383750837
4104	NC_017065	AATTT	2	10	209830	209839	40 %	60 %	0 %	0 %	383750837
4105	NC_017065	TAG	2	6	209890	209895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750838
4106	NC_017065	AT	3	6	209931	209936	50 %	50 %	0 %	0 %	383750838
4107	NC_017065	TATT	2	8	209937	209944	25 %	75 %	0 %	0 %	383750838
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4118	NC_017065	TAT	2	6	210234	210239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750838
4119	NC_017065	AAAAC	2	10	210250	210259	80 %	0 %	0 %	20 %	383750838
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4493	NC_017065	AAT	2	6	229936	229941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750855
4494	NC_017065	AAGT	2	8	229998	230005	50 %	25 %	25 %	0 %	383750855
4495	NC_017065	AAAT	2	8	230261	230268	75 %	25 %	0 %	0 %	383750856
4496	NC_017065	CCG	2	6	230304	230309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750856
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4500	NC_017065	ACA	2	6	230660	230665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750857

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