MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017065	CTT	2	6	157421	157426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750790
3003	NC_017065	TA	3	6	157470	157475	50 %	50 %	0 %	0 %	383750790
3004	NC_017065	TAC	3	9	157494	157502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750790
3005	NC_017065	AAT	2	6	157580	157585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750791
3006	NC_017065	TAA	2	6	157613	157618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750791
3007	NC_017065	GATTTT	2	12	157623	157634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383750791
3008	NC_017065	A	6	6	157644	157649	100 %	0 %	0 %	0 %	383750791
3009	NC_017065	GTTA	2	8	157650	157657	25 %	50 %	25 %	0 %	383750791
3010	NC_017065	ATT	2	6	157668	157673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750791
3011	NC_017065	TA	4	8	157703	157710	50 %	50 %	0 %	0 %	383750791
3012	NC_017065	AATTT	2	10	157711	157720	40 %	60 %	0 %	0 %	383750791
3013	NC_017065	CGG	2	6	157736	157741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383750791
3014	NC_017065	AGGTG	2	10	157817	157826	20 %	20 %	60 %	0 %	383750791
3015	NC_017065	GTA	3	9	157873	157881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750791
3016	NC_017065	GAA	2	6	157884	157889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750791
3017	NC_017065	TTAA	2	8	157911	157918	50 %	50 %	0 %	0 %	383750791
3018	NC_017065	TCTT	2	8	158031	158038	0 %	75 %	0 %	25 %	383750791
3019	NC_017065	TGC	2	6	158174	158179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750791
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3021	NC_017065	GTA	2	6	158217	158222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750791
3022	NC_017065	AT	3	6	158223	158228	50 %	50 %	0 %	0 %	383750791
3023	NC_017065	A	8	8	158262	158269	100 %	0 %	0 %	0 %	383750791
3024	NC_017065	T	6	6	158406	158411	0 %	100 %	0 %	0 %	383750791
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3033	NC_017065	TAG	2	6	158901	158906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750792
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3035	NC_017065	AT	3	6	158949	158954	50 %	50 %	0 %	0 %	383750792
3036	NC_017065	TTGC	3	12	158986	158997	0 %	50 %	25 %	25 %	383750792
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3038	NC_017065	AAG	2	6	159096	159101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750792
3039	NC_017065	ATTT	2	8	159146	159153	25 %	75 %	0 %	0 %	383750792
3040	NC_017065	GAA	2	6	159185	159190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750792
3041	NC_017065	A	6	6	159218	159223	100 %	0 %	0 %	0 %	383750792
3042	NC_017065	GCC	2	6	159241	159246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750792
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3045	NC_017065	AGT	2	6	159310	159315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750792
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3047	NC_017065	ATTG	2	8	159457	159464	25 %	50 %	25 %	0 %	383750792
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3050	NC_017065	TTC	2	6	159526	159531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750792
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3052	NC_017065	TAT	2	6	159619	159624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750792
3053	NC_017065	ATT	2	6	159647	159652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750792
3054	NC_017065	CATG	2	8	159682	159689	25 %	25 %	25 %	25 %	383750792
3055	NC_017065	ATG	2	6	159746	159751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750792
3056	NC_017065	A	6	6	159773	159778	100 %	0 %	0 %	0 %	383750792
3057	NC_017065	GAAA	2	8	159808	159815	75 %	0 %	25 %	0 %	383750792
3058	NC_017065	ATA	2	6	160125	160130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750793
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3060	NC_017065	CTTTTG	2	12	160173	160184	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383750793
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3062	NC_017065	TTA	2	6	160215	160220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750793
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3071	NC_017065	TA	4	8	160630	160637	50 %	50 %	0 %	0 %	383750793
3072	NC_017065	GATA	2	8	160640	160647	50 %	25 %	25 %	0 %	383750793
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3082	NC_017065	ACTT	2	8	161190	161197	25 %	50 %	0 %	25 %	383750794
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3109	NC_017065	ATC	2	6	162150	162155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750795
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3111	NC_017065	AT	3	6	162217	162222	50 %	50 %	0 %	0 %	383750795
3112	NC_017065	GAC	2	6	162263	162268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750795
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3115	NC_017065	AGAA	2	8	162336	162343	75 %	0 %	25 %	0 %	383750795
3116	NC_017065	TAG	2	6	162420	162425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750795
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3492	NC_017065	A	6	6	178874	178879	100 %	0 %	0 %	0 %	383750813
3493	NC_017065	TAA	2	6	178958	178963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750813
3494	NC_017065	AAG	2	6	178981	178986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750813
3495	NC_017065	AGA	2	6	179066	179071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750813
3496	NC_017065	A	7	7	179083	179089	100 %	0 %	0 %	0 %	383750813
3497	NC_017065	GCT	2	6	179487	179492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750814
3498	NC_017065	CCT	2	6	179508	179513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750814
3499	NC_017065	GCA	2	6	179550	179555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750814
3500	NC_017065	ATG	2	6	179572	179577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750814

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