MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017065	TAAA	2	8	1273211	1273218	75 %	25 %	0 %	0 %	383751986
25003	NC_017065	GACT	2	8	1273256	1273263	25 %	25 %	25 %	25 %	383751986
25004	NC_017065	ATAG	2	8	1273270	1273277	50 %	25 %	25 %	0 %	383751986
25005	NC_017065	TTA	2	6	1273297	1273302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
25006	NC_017065	TTA	2	6	1273388	1273393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
25007	NC_017065	AT	3	6	1273407	1273412	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
25008	NC_017065	TAA	2	6	1273425	1273430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
25009	NC_017065	CTA	2	6	1273515	1273520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751987
25010	NC_017065	T	7	7	1273570	1273576	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
25011	NC_017065	CTACT	2	10	1273635	1273644	20 %	40 %	0 %	40 %	383751987
25012	NC_017065	TAT	2	6	1273744	1273749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
25013	NC_017065	T	6	6	1273749	1273754	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
25014	NC_017065	ATA	2	6	1273776	1273781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
25015	NC_017065	TAAT	2	8	1273812	1273819	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
25016	NC_017065	AATATC	2	12	1273879	1273890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383751987
25017	NC_017065	A	6	6	1273901	1273906	100 %	0 %	0 %	0 %	383751987
25018	NC_017065	GAT	2	6	1273916	1273921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751987
25019	NC_017065	GTA	2	6	1273928	1273933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751987
25020	NC_017065	AAT	2	6	1273958	1273963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751987
25021	NC_017065	ATT	2	6	1273964	1273969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751987
25022	NC_017065	T	7	7	1273984	1273990	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
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25029	NC_017065	T	6	6	1274161	1274166	0 %	100 %	0 %	0 %	383751987
25030	NC_017065	CT	3	6	1274167	1274172	0 %	50 %	0 %	50 %	383751987
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25033	NC_017065	ATTA	2	8	1274221	1274228	50 %	50 %	0 %	0 %	383751987
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25041	NC_017065	TAA	2	6	1274474	1274479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751988
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25043	NC_017065	T	6	6	1274533	1274538	0 %	100 %	0 %	0 %	383751988
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25055	NC_017065	T	6	6	1274855	1274860	0 %	100 %	0 %	0 %	383751988
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25070	NC_017065	TAT	3	9	1275298	1275306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751988

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.