MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017065	GAC	2	6	306341	306346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750938
6002	NC_017065	GTTTG	2	10	306445	306454	0 %	60 %	40 %	0 %	383750938
6003	NC_017065	AT	3	6	306528	306533	50 %	50 %	0 %	0 %	383750938
6004	NC_017065	TGC	2	6	306538	306543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750938
6005	NC_017065	ACTG	2	8	306583	306590	25 %	25 %	25 %	25 %	383750938
6006	NC_017065	AAG	2	6	306699	306704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750938
6007	NC_017065	GGCAAT	2	12	306801	306812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383750938
6008	NC_017065	TTTTG	2	10	306832	306841	0 %	80 %	20 %	0 %	383750938
6009	NC_017065	GCTA	2	8	306857	306864	25 %	25 %	25 %	25 %	383750938
6010	NC_017065	GCA	2	6	306869	306874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750938
6011	NC_017065	GA	3	6	306879	306884	50 %	0 %	50 %	0 %	383750938
6012	NC_017065	A	7	7	306884	306890	100 %	0 %	0 %	0 %	383750938
6013	NC_017065	GAA	2	6	306953	306958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750938
6014	NC_017065	AGGT	2	8	306964	306971	25 %	25 %	50 %	0 %	383750938
6015	NC_017065	A	6	6	307137	307142	100 %	0 %	0 %	0 %	383750938
6016	NC_017065	GAT	2	6	307147	307152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750938
6017	NC_017065	ACT	2	6	307211	307216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750938
6018	NC_017065	AAG	2	6	307221	307226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750938
6019	NC_017065	TAT	2	6	307227	307232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750938
6020	NC_017065	AGA	2	6	307261	307266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750938
6021	NC_017065	TAT	2	6	307381	307386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750939
6022	NC_017065	A	7	7	307433	307439	100 %	0 %	0 %	0 %	383750939
6023	NC_017065	ATT	2	6	307454	307459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750939
6024	NC_017065	AAT	2	6	307499	307504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750939
6025	NC_017065	ATT	3	9	308959	308967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750940
6026	NC_017065	GCC	2	6	309145	309150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383750941
6027	NC_017065	GA	3	6	309214	309219	50 %	0 %	50 %	0 %	383750941
6028	NC_017065	GTG	2	6	309233	309238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750941
6029	NC_017065	AAG	2	6	309338	309343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750941
6030	NC_017065	AAT	2	6	309387	309392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750941
6031	NC_017065	CTA	2	6	309413	309418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750941
6032	NC_017065	ATT	2	6	309436	309441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750941
6033	NC_017065	AGA	2	6	309465	309470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750941
6034	NC_017065	A	6	6	310196	310201	100 %	0 %	0 %	0 %	383750942
6035	NC_017065	ATTT	2	8	310205	310212	25 %	75 %	0 %	0 %	383750942
6036	NC_017065	T	6	6	310210	310215	0 %	100 %	0 %	0 %	383750942
6037	NC_017065	ATT	2	6	310235	310240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750942
6038	NC_017065	AT	3	6	310243	310248	50 %	50 %	0 %	0 %	383750942
6039	NC_017065	AAT	2	6	310294	310299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750942
6040	NC_017065	TTA	2	6	310315	310320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750942
6041	NC_017065	T	7	7	310547	310553	0 %	100 %	0 %	0 %	383750943
6042	NC_017065	TTGTTC	2	12	310562	310573	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383750943
6043	NC_017065	TCT	2	6	310683	310688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750943
6044	NC_017065	GA	3	6	310690	310695	50 %	0 %	50 %	0 %	383750943
6045	NC_017065	ATTT	2	8	310696	310703	25 %	75 %	0 %	0 %	383750943
6046	NC_017065	TTCT	2	8	310750	310757	0 %	75 %	0 %	25 %	383750943
6047	NC_017065	ATC	2	6	310814	310819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750943
6048	NC_017065	CCT	2	6	310827	310832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750943
6049	NC_017065	CAG	2	6	310834	310839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750943
6050	NC_017065	AT	3	6	310843	310848	50 %	50 %	0 %	0 %	383750943
6051	NC_017065	T	8	8	310848	310855	0 %	100 %	0 %	0 %	383750943
6052	NC_017065	TGC	2	6	310859	310864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750943
6053	NC_017065	TAA	3	9	310889	310897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750943
6054	NC_017065	TAA	2	6	310901	310906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750943
6055	NC_017065	ATTAGA	2	12	310934	310945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383750943
6056	NC_017065	TG	3	6	310980	310985	0 %	50 %	50 %	0 %	383750944
6057	NC_017065	TAA	2	6	311077	311082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750944
6058	NC_017065	CTG	2	6	311183	311188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750945
6059	NC_017065	AAG	2	6	311219	311224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750945
6060	NC_017065	TAA	2	6	311244	311249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750945
6061	NC_017065	T	6	6	311363	311368	0 %	100 %	0 %	0 %	383750945
6062	NC_017065	TAG	2	6	311402	311407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750945
6063	NC_017065	TTA	2	6	311437	311442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750945
6064	NC_017065	AAT	2	6	311463	311468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750945
6065	NC_017065	T	6	6	311511	311516	0 %	100 %	0 %	0 %	383750945
6066	NC_017065	AAT	2	6	311606	311611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750946
6067	NC_017065	T	6	6	311611	311616	0 %	100 %	0 %	0 %	383750946
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6071	NC_017065	ATT	2	6	312172	312177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750947
6072	NC_017065	ACTA	2	8	312178	312185	50 %	25 %	0 %	25 %	383750947
6073	NC_017065	GCA	2	6	312194	312199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750947
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6075	NC_017065	GAG	2	6	312242	312247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750947
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6081	NC_017065	TGG	2	6	312454	312459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750947
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6085	NC_017065	TAA	2	6	312552	312557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750947
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6090	NC_017065	TTA	2	6	312771	312776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750947
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6094	NC_017065	TAC	2	6	312989	312994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750947
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6096	NC_017065	TAC	3	9	313036	313044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750947
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6098	NC_017065	GGGA	2	8	313185	313192	25 %	0 %	75 %	0 %	383750947
6099	NC_017065	AGC	2	6	313198	313203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750947
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6106	NC_017065	GAAGAT	2	12	313614	313625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383750948
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6110	NC_017065	ATA	3	9	313750	313758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750948
6111	NC_017065	GAA	2	6	313779	313784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750948
6112	NC_017065	GCTTG	2	10	313818	313827	0 %	40 %	40 %	20 %	383750948
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6121	NC_017065	T	6	6	314148	314153	0 %	100 %	0 %	0 %	383750950
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