MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 25070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017065	GTA	2	6	280243	280248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5502	NC_017065	ATT	3	9	280302	280310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750913
5503	NC_017065	AAGGC	2	10	280335	280344	40 %	0 %	40 %	20 %	383750913
5504	NC_017065	TGA	2	6	280406	280411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5505	NC_017065	AAAG	2	8	280448	280455	75 %	0 %	25 %	0 %	383750913
5506	NC_017065	AGT	2	6	280469	280474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5507	NC_017065	TTA	2	6	280522	280527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750913
5508	NC_017065	TGCT	2	8	280528	280535	0 %	50 %	25 %	25 %	383750913
5509	NC_017065	TGA	2	6	280558	280563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5510	NC_017065	AAG	2	6	280570	280575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5511	NC_017065	AGT	2	6	280604	280609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5512	NC_017065	TA	3	6	280625	280630	50 %	50 %	0 %	0 %	383750913
5513	NC_017065	ACTA	2	8	280673	280680	50 %	25 %	0 %	25 %	383750913
5514	NC_017065	ATA	2	6	280704	280709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750913
5515	NC_017065	TAT	2	6	280712	280717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750913
5516	NC_017065	GTTG	2	8	280802	280809	0 %	50 %	50 %	0 %	383750913
5517	NC_017065	TTAAAG	2	12	281020	281031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383750913
5518	NC_017065	CTC	2	6	281044	281049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750913
5519	NC_017065	AGA	2	6	281090	281095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5520	NC_017065	GAA	2	6	281109	281114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5521	NC_017065	TGA	2	6	281219	281224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5522	NC_017065	GTA	2	6	281251	281256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5523	NC_017065	TGT	2	6	281269	281274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750913
5524	NC_017065	TCT	2	6	281275	281280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750913
5525	NC_017065	AGGGTA	2	12	281338	281349	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383750913
5526	NC_017065	AT	3	6	281362	281367	50 %	50 %	0 %	0 %	383750913
5527	NC_017065	AGA	2	6	281475	281480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5528	NC_017065	TTA	2	6	281487	281492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750913
5529	NC_017065	TGA	2	6	281537	281542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5530	NC_017065	AGA	2	6	281576	281581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5531	NC_017065	TTA	2	6	281647	281652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750913
5532	NC_017065	TAG	2	6	281735	281740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5533	NC_017065	TTAT	2	8	281762	281769	25 %	75 %	0 %	0 %	383750913
5534	NC_017065	CCGTG	2	10	281770	281779	0 %	20 %	40 %	40 %	383750913
5535	NC_017065	GAA	2	6	281823	281828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5536	NC_017065	GAA	2	6	281877	281882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5537	NC_017065	GCGGTA	2	12	281956	281967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383750913
5538	NC_017065	GTC	2	6	282003	282008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750913
5539	NC_017065	GAT	2	6	282030	282035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5540	NC_017065	GCG	2	6	282115	282120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383750913
5541	NC_017065	GAT	2	6	282138	282143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750913
5542	NC_017065	GTCT	2	8	282158	282165	0 %	50 %	25 %	25 %	383750913
5543	NC_017065	CTG	2	6	282181	282186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383750913
5544	NC_017065	GAA	2	6	282192	282197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750913
5545	NC_017065	TAT	2	6	282568	282573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5546	NC_017065	TCTA	2	8	282640	282647	25 %	50 %	0 %	25 %	383750914
5547	NC_017065	ATT	2	6	282661	282666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5548	NC_017065	ATT	2	6	282677	282682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5549	NC_017065	TGT	2	6	282703	282708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750914
5550	NC_017065	ATT	2	6	282748	282753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5551	NC_017065	TGTT	2	8	282772	282779	0 %	75 %	25 %	0 %	383750914
5552	NC_017065	TA	3	6	282805	282810	50 %	50 %	0 %	0 %	383750914
5553	NC_017065	AT	3	6	282812	282817	50 %	50 %	0 %	0 %	383750914
5554	NC_017065	TC	3	6	282837	282842	0 %	50 %	0 %	50 %	383750914
5555	NC_017065	ATT	2	6	282893	282898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5556	NC_017065	TAG	2	6	282919	282924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750914
5557	NC_017065	TAT	2	6	282925	282930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5558	NC_017065	TG	3	6	282954	282959	0 %	50 %	50 %	0 %	383750914
5559	NC_017065	ATTGG	2	10	282971	282980	20 %	40 %	40 %	0 %	383750914
5560	NC_017065	TTG	2	6	282999	283004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750914
5561	NC_017065	TTG	2	6	283019	283024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750914
5562	NC_017065	TA	3	6	283028	283033	50 %	50 %	0 %	0 %	383750914
5563	NC_017065	TTAT	2	8	283040	283047	25 %	75 %	0 %	0 %	383750914
5564	NC_017065	TGA	2	6	283075	283080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750914
5565	NC_017065	ATT	2	6	283094	283099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750914
5566	NC_017065	TCTT	2	8	283152	283159	0 %	75 %	0 %	25 %	383750914
5567	NC_017065	TTATT	2	10	283162	283171	20 %	80 %	0 %	0 %	383750914
5568	NC_017065	TAGC	2	8	283200	283207	25 %	25 %	25 %	25 %	383750914
5569	NC_017065	ATG	2	6	283217	283222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750914
5570	NC_017065	ATA	2	6	283296	283301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750914
5571	NC_017065	ATA	2	6	283305	283310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750914
5572	NC_017065	CTCG	2	8	283316	283323	0 %	25 %	25 %	50 %	383750914
5573	NC_017065	TTTA	2	8	283428	283435	25 %	75 %	0 %	0 %	383750915
5574	NC_017065	ATT	2	6	283436	283441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750915
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5578	NC_017065	ATG	2	6	283549	283554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750915
5579	NC_017065	GATA	2	8	283638	283645	50 %	25 %	25 %	0 %	383750915
5580	NC_017065	AT	4	8	283646	283653	50 %	50 %	0 %	0 %	383750915
5581	NC_017065	ATT	2	6	283788	283793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750916
5582	NC_017065	TAA	2	6	283823	283828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750916
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5588	NC_017065	GTA	2	6	284090	284095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750917
5589	NC_017065	T	8	8	284157	284164	0 %	100 %	0 %	0 %	383750917
5590	NC_017065	TTC	2	6	284266	284271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750918
5591	NC_017065	TTC	2	6	284278	284283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750918
5592	NC_017065	TCT	2	6	284300	284305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750918
5593	NC_017065	CTT	2	6	284313	284318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750918
5594	NC_017065	T	6	6	284323	284328	0 %	100 %	0 %	0 %	383750918
5595	NC_017065	TAA	2	6	284377	284382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750918
5596	NC_017065	T	9	9	284388	284396	0 %	100 %	0 %	0 %	383750918
5597	NC_017065	TTC	2	6	284419	284424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750918
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5605	NC_017065	AGA	2	6	284937	284942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750919
5606	NC_017065	TGAT	2	8	285122	285129	25 %	50 %	25 %	0 %	383750919
5607	NC_017065	GTA	2	6	285154	285159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750919
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5609	NC_017065	A	6	6	285243	285248	100 %	0 %	0 %	0 %	383750920
5610	NC_017065	TCA	2	6	285257	285262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750920
5611	NC_017065	ACTTA	2	10	285311	285320	40 %	40 %	0 %	20 %	383750920
5612	NC_017065	ATG	2	6	285391	285396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750920
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5615	NC_017065	GTT	2	6	285438	285443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750920
5616	NC_017065	ATCC	3	12	285507	285518	25 %	25 %	0 %	50 %	383750920
5617	NC_017065	GAG	2	6	285535	285540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383750920
5618	NC_017065	CTC	2	6	285544	285549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383750920
5619	NC_017065	TAT	2	6	285560	285565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750920
5620	NC_017065	AGT	2	6	285582	285587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750920
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5994	NC_017065	TGA	2	6	305967	305972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750938
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5996	NC_017065	AGC	2	6	306054	306059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383750938
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6000	NC_017065	TGA	2	6	306316	306321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750938

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