MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017062	TAACG	2	10	992	1001	40 %	20 %	20 %	20 %	383842826
2	NC_017062	TTAAT	2	10	1883	1892	40 %	60 %	0 %	0 %	383842827
3	NC_017062	TTTTA	2	10	2444	2453	20 %	80 %	0 %	0 %	383842828
4	NC_017062	ATTTA	2	10	2797	2806	40 %	60 %	0 %	0 %	383842828
5	NC_017062	GCAAA	2	10	3254	3263	60 %	0 %	20 %	20 %	383842829
6	NC_017062	TAAAT	2	10	4753	4762	60 %	40 %	0 %	0 %	383842829
7	NC_017062	GTAGT	2	10	5064	5073	20 %	40 %	40 %	0 %	383842829
8	NC_017062	AATAC	2	10	6715	6724	60 %	20 %	0 %	20 %	383842830
9	NC_017062	AAACC	2	10	7874	7883	60 %	0 %	0 %	40 %	383842832
10	NC_017062	TGATT	2	10	8222	8231	20 %	60 %	20 %	0 %	383842832
11	NC_017062	CGAGA	2	10	9646	9655	40 %	0 %	40 %	20 %	383842833
12	NC_017062	TGACA	2	10	14923	14932	40 %	20 %	20 %	20 %	383842838
13	NC_017062	TCAAT	2	10	15496	15505	40 %	40 %	0 %	20 %	383842838
14	NC_017062	TGAAT	2	10	15550	15559	40 %	40 %	20 %	0 %	383842838
15	NC_017062	AGATA	2	10	17506	17515	60 %	20 %	20 %	0 %	383842838
16	NC_017062	TATTT	2	10	20675	20684	20 %	80 %	0 %	0 %	383842840
17	NC_017062	TCCTC	2	10	22734	22743	0 %	40 %	0 %	60 %	383842843
18	NC_017062	AAACC	2	10	23375	23384	60 %	0 %	0 %	40 %	383842843
19	NC_017062	ATAGC	2	10	24628	24637	40 %	20 %	20 %	20 %	383842844
20	NC_017062	ATGCT	2	10	25341	25350	20 %	40 %	20 %	20 %	383842845
21	NC_017062	TGATA	2	10	27699	27708	40 %	40 %	20 %	0 %	383842848
22	NC_017062	AATGA	2	10	27793	27802	60 %	20 %	20 %	0 %	383842848
23	NC_017062	TTTGT	2	10	28009	28018	0 %	80 %	20 %	0 %	383842848
24	NC_017062	TATTT	2	10	29838	29847	20 %	80 %	0 %	0 %	383842850
25	NC_017062	CTTTG	2	10	31524	31533	0 %	60 %	20 %	20 %	383842850
26	NC_017062	ACCAT	2	10	32850	32859	40 %	20 %	0 %	40 %	383842850
27	NC_017062	GCAAT	2	10	36482	36491	40 %	20 %	20 %	20 %	383842852
28	NC_017062	TATAT	2	10	37707	37716	40 %	60 %	0 %	0 %	383842852
29	NC_017062	AAACT	2	10	38171	38180	60 %	20 %	0 %	20 %	383842852
30	NC_017062	AAAAC	2	10	40812	40821	80 %	0 %	0 %	20 %	383842853
31	NC_017062	TTTCT	2	10	41488	41497	0 %	80 %	0 %	20 %	383842854
32	NC_017062	AAGTA	2	10	43021	43030	60 %	20 %	20 %	0 %	383842854
33	NC_017062	TCTTG	2	10	43439	43448	0 %	60 %	20 %	20 %	383842854
34	NC_017062	ATTAT	2	10	44631	44640	40 %	60 %	0 %	0 %	383842855
35	NC_017062	TAAAA	2	10	45598	45607	80 %	20 %	0 %	0 %	383842855
36	NC_017062	ATATA	2	10	47207	47216	60 %	40 %	0 %	0 %	383842856
37	NC_017062	GATTT	2	10	48602	48611	20 %	60 %	20 %	0 %	383842857
38	NC_017062	ATCAT	2	10	51385	51394	40 %	40 %	0 %	20 %	383842861
39	NC_017062	ACAAG	2	10	52305	52314	60 %	0 %	20 %	20 %	383842862
40	NC_017062	TTTCA	2	10	55067	55076	20 %	60 %	0 %	20 %	383842864
41	NC_017062	GTAAT	2	10	55428	55437	40 %	40 %	20 %	0 %	383842864
42	NC_017062	TACTT	2	10	55896	55905	20 %	60 %	0 %	20 %	383842865
43	NC_017062	ATTAA	2	10	56516	56525	60 %	40 %	0 %	0 %	383842866
44	NC_017062	GTTTT	2	10	56593	56602	0 %	80 %	20 %	0 %	383842866
45	NC_017062	TATTT	2	10	57287	57296	20 %	80 %	0 %	0 %	383842866
46	NC_017062	TTTAT	2	10	59552	59561	20 %	80 %	0 %	0 %	383842869
47	NC_017062	TTTGC	2	10	65185	65194	0 %	60 %	20 %	20 %	383842872
48	NC_017062	ATGGA	2	10	70499	70508	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
49	NC_017062	ATGGA	2	10	70649	70658	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
50	NC_017062	ATGGA	2	10	70799	70808	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
51	NC_017062	ATGGA	2	10	70949	70958	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
52	NC_017062	ATGGA	2	10	71099	71108	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
53	NC_017062	ATGGA	2	10	71249	71258	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
54	NC_017062	ATGGA	2	10	71399	71408	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
55	NC_017062	ATGGA	2	10	71549	71558	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
56	NC_017062	ATGGA	2	10	71699	71708	40 %	20 %	40 %	0 %	383842873
57	NC_017062	AAAGA	2	10	71908	71917	80 %	0 %	20 %	0 %	383842873
58	NC_017062	AAATC	2	10	72685	72694	60 %	20 %	0 %	20 %	383842873
59	NC_017062	ACTAA	2	10	76230	76239	60 %	20 %	0 %	20 %	383842876
60	NC_017062	AATTA	2	10	79120	79129	60 %	40 %	0 %	0 %	383842879
61	NC_017062	TCTTT	2	10	82310	82319	0 %	80 %	0 %	20 %	383842883
62	NC_017062	TGATT	2	10	85574	85583	20 %	60 %	20 %	0 %	383842885
63	NC_017062	TAATT	2	10	95737	95746	40 %	60 %	0 %	0 %	383842893
64	NC_017062	ATTTA	2	10	96084	96093	40 %	60 %	0 %	0 %	383842893
65	NC_017062	TTTTA	2	10	96441	96450	20 %	80 %	0 %	0 %	383842893
66	NC_017062	TTTTA	2	10	96489	96498	20 %	80 %	0 %	0 %	383842893
67	NC_017062	CATTG	2	10	96905	96914	20 %	40 %	20 %	20 %	383842894
68	NC_017062	TGTAT	2	10	98817	98826	20 %	60 %	20 %	0 %	383842896
69	NC_017062	ATATA	2	10	99415	99424	60 %	40 %	0 %	0 %	383842896
70	NC_017062	AGAAA	2	10	99796	99805	80 %	0 %	20 %	0 %	383842897
71	NC_017062	AATTT	2	10	99806	99815	40 %	60 %	0 %	0 %	383842897
72	NC_017062	TATTG	2	10	100184	100193	20 %	60 %	20 %	0 %	383842897
73	NC_017062	CAAAA	2	10	100640	100649	80 %	0 %	0 %	20 %	383842898
74	NC_017062	AAATA	2	10	101827	101836	80 %	20 %	0 %	0 %	383842899
75	NC_017062	CAACC	2	10	102204	102213	40 %	0 %	0 %	60 %	383842899
76	NC_017062	TTAGC	2	10	106395	106404	20 %	40 %	20 %	20 %	383842903
77	NC_017062	TAATA	2	10	106705	106714	60 %	40 %	0 %	0 %	383842903
78	NC_017062	TAATA	2	10	106781	106790	60 %	40 %	0 %	0 %	383842904
79	NC_017062	CATAG	2	10	107397	107406	40 %	20 %	20 %	20 %	383842904
80	NC_017062	ATTAA	2	10	108418	108427	60 %	40 %	0 %	0 %	383842904
81	NC_017062	TTTAA	2	10	108641	108650	40 %	60 %	0 %	0 %	383842905
82	NC_017062	TAACA	2	10	109714	109723	60 %	20 %	0 %	20 %	383842905
83	NC_017062	TTTTA	2	10	110701	110710	20 %	80 %	0 %	0 %	383842906
84	NC_017062	TTAGT	2	10	111005	111014	20 %	60 %	20 %	0 %	383842907
85	NC_017062	GATAT	2	10	111500	111509	40 %	40 %	20 %	0 %	383842907
86	NC_017062	AGGTA	2	10	115414	115423	40 %	20 %	40 %	0 %	383842910
87	NC_017062	ATATT	2	10	116555	116564	40 %	60 %	0 %	0 %	383842910
88	NC_017062	ATGTT	2	10	118832	118841	20 %	60 %	20 %	0 %	383842914
89	NC_017062	ATAAA	2	10	119030	119039	80 %	20 %	0 %	0 %	383842914
90	NC_017062	GTTAT	2	10	119062	119071	20 %	60 %	20 %	0 %	383842914
91	NC_017062	AATTT	2	10	120995	121004	40 %	60 %	0 %	0 %	383842915
92	NC_017062	CTTTA	2	10	122319	122328	20 %	60 %	0 %	20 %	383842916
93	NC_017062	TCATA	2	10	123152	123161	40 %	40 %	0 %	20 %	383842916
94	NC_017062	CAATT	2	10	123312	123321	40 %	40 %	0 %	20 %	383842916
95	NC_017062	TATTT	2	10	124317	124326	20 %	80 %	0 %	0 %	383842916
96	NC_017062	GTATG	2	10	135142	135151	20 %	40 %	40 %	0 %	383842923
97	NC_017062	AAACC	2	10	137364	137373	60 %	0 %	0 %	40 %	383842924
98	NC_017062	ATGAT	2	10	137490	137499	40 %	40 %	20 %	0 %	383842924
99	NC_017062	TATAG	2	10	139419	139428	40 %	40 %	20 %	0 %	383842926
100	NC_017062	GTTTG	2	10	139852	139861	0 %	60 %	40 %	0 %	383842928
101	NC_017062	TTTTA	2	10	140074	140083	20 %	80 %	0 %	0 %	383842928
102	NC_017062	TAAAA	2	10	141258	141267	80 %	20 %	0 %	0 %	383842930
103	NC_017062	ATTTA	2	10	141325	141334	40 %	60 %	0 %	0 %	383842931
104	NC_017062	TATCA	2	10	144487	144496	40 %	40 %	0 %	20 %	383842932
105	NC_017062	ATATT	2	10	144802	144811	40 %	60 %	0 %	0 %	383842933
106	NC_017062	ATTTT	2	10	146234	146243	20 %	80 %	0 %	0 %	383842934
107	NC_017062	TAATA	2	10	149511	149520	60 %	40 %	0 %	0 %	383842937
108	NC_017062	TAAAA	2	10	150360	150369	80 %	20 %	0 %	0 %	383842938
109	NC_017062	TGGTG	2	10	150494	150503	0 %	40 %	60 %	0 %	383842938
110	NC_017062	TTAAT	2	10	151396	151405	40 %	60 %	0 %	0 %	383842940
111	NC_017062	TATAA	2	10	151416	151425	60 %	40 %	0 %	0 %	383842940
112	NC_017062	AAGAA	2	10	153008	153017	80 %	0 %	20 %	0 %	383842940
113	NC_017062	TGGAT	2	10	155212	155221	20 %	40 %	40 %	0 %	383842944
114	NC_017062	CAAGT	2	10	157126	157135	40 %	20 %	20 %	20 %	383842944
115	NC_017062	ACAGA	2	10	157769	157778	60 %	0 %	20 %	20 %	383842946
116	NC_017062	TATAC	2	10	169131	169140	40 %	40 %	0 %	20 %	383842952
117	NC_017062	GTAGA	2	10	169540	169549	40 %	20 %	40 %	0 %	383842952
118	NC_017062	GATAT	2	10	172090	172099	40 %	40 %	20 %	0 %	383842953
119	NC_017062	AGATA	2	10	175030	175039	60 %	20 %	20 %	0 %	383842956
120	NC_017062	AATTT	2	10	176579	176588	40 %	60 %	0 %	0 %	383842957
121	NC_017062	ATTAT	2	10	176707	176716	40 %	60 %	0 %	0 %	383842957
122	NC_017062	GTTTT	2	10	177171	177180	0 %	80 %	20 %	0 %	383842957
123	NC_017062	TAAAA	2	10	177888	177897	80 %	20 %	0 %	0 %	383842957
124	NC_017062	GTTTT	2	10	179191	179200	0 %	80 %	20 %	0 %	383842958
125	NC_017062	ATACC	2	10	184243	184252	40 %	20 %	0 %	40 %	383842963
126	NC_017062	ATATA	2	10	187437	187446	60 %	40 %	0 %	0 %	383842967
127	NC_017062	AATTT	2	10	187447	187456	40 %	60 %	0 %	0 %	383842967
128	NC_017062	AAAAC	2	10	187867	187876	80 %	0 %	0 %	20 %	383842968
129	NC_017062	AAAGT	2	10	188189	188198	60 %	20 %	20 %	0 %	383842968
130	NC_017062	AATAA	2	10	188755	188764	80 %	20 %	0 %	0 %	383842968
131	NC_017062	TCATA	2	10	191248	191257	40 %	40 %	0 %	20 %	383842971
132	NC_017062	AGAAA	2	10	191484	191493	80 %	0 %	20 %	0 %	383842971
133	NC_017062	AGCTA	2	10	191606	191615	40 %	20 %	20 %	20 %	383842971
134	NC_017062	AATAG	2	10	192035	192044	60 %	20 %	20 %	0 %	383842971
135	NC_017062	TACTC	2	10	192153	192162	20 %	40 %	0 %	40 %	383842971
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