MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017062	AAT	2	6	165680	165685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842951
3503	NC_017062	CAA	2	6	166122	166127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842952
3504	NC_017062	AATT	2	8	166208	166215	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
3505	NC_017062	GCG	2	6	166401	166406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383842952
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3511	NC_017062	CTT	2	6	166705	166710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842952
3512	NC_017062	A	6	6	166725	166730	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
3513	NC_017062	GGA	2	6	166754	166759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383842952
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3515	NC_017062	GAT	2	6	166790	166795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
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3518	NC_017062	AAT	2	6	166908	166913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
3519	NC_017062	ATA	2	6	166950	166955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842952
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3521	NC_017062	AAG	2	6	166981	166986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842952
3522	NC_017062	GTC	2	6	167011	167016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
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3525	NC_017062	ATT	2	6	167125	167130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
3526	NC_017062	GTA	2	6	167148	167153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
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3529	NC_017062	TTTA	2	8	167220	167227	25 %	75 %	0 %	0 %	383842952
3530	NC_017062	GCT	2	6	167268	167273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842952
3531	NC_017062	TGG	2	6	167281	167286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383842952
3532	NC_017062	AG	3	6	167331	167336	50 %	0 %	50 %	0 %	383842952
3533	NC_017062	TTGT	2	8	167437	167444	0 %	75 %	25 %	0 %	383842952
3534	NC_017062	ATG	2	6	167532	167537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
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3536	NC_017062	TAT	2	6	167576	167581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
3537	NC_017062	TAT	2	6	167613	167618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
3538	NC_017062	GAT	2	6	167654	167659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842952
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3540	NC_017062	TAC	2	6	167783	167788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842952
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3542	NC_017062	TTA	2	6	167814	167819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
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3544	NC_017062	CTAA	2	8	167862	167869	50 %	25 %	0 %	25 %	383842952
3545	NC_017062	A	6	6	167868	167873	100 %	0 %	0 %	0 %	383842952
3546	NC_017062	AT	3	6	167875	167880	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
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3553	NC_017062	TA	4	8	168227	168234	50 %	50 %	0 %	0 %	383842952
3554	NC_017062	CAG	2	6	168267	168272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842952
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3557	NC_017062	TAT	2	6	168338	168343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842952
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3588	NC_017062	ATTG	2	8	169685	169692	25 %	50 %	25 %	0 %	383842952
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3603	NC_017062	TGAA	2	8	171253	171260	50 %	25 %	25 %	0 %	383842953
3604	NC_017062	ATC	2	6	171263	171268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842953
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3992	NC_017062	TAA	2	6	188488	188493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842968
3993	NC_017062	AT	3	6	188525	188530	50 %	50 %	0 %	0 %	383842968
3994	NC_017062	ATT	2	6	188704	188709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842968
3995	NC_017062	ATA	2	6	188721	188726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842968
3996	NC_017062	TCA	2	6	188730	188735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842968
3997	NC_017062	AATAA	2	10	188755	188764	80 %	20 %	0 %	0 %	383842968
3998	NC_017062	AAT	2	6	188809	188814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842968
3999	NC_017062	AGC	2	6	188869	188874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842968
4000	NC_017062	CAA	2	6	188907	188912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842968

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