MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017062	ATT	2	6	43292	43297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842854
1002	NC_017062	TA	3	6	43312	43317	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
1003	NC_017062	GGC	2	6	43328	43333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383842854
1004	NC_017062	TAA	2	6	43348	43353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842854
1005	NC_017062	A	6	6	43363	43368	100 %	0 %	0 %	0 %	383842854
1006	NC_017062	A	6	6	43385	43390	100 %	0 %	0 %	0 %	383842854
1007	NC_017062	ATGC	2	8	43405	43412	25 %	25 %	25 %	25 %	383842854
1008	NC_017062	AAT	2	6	43427	43432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842854
1009	NC_017062	TCTTG	2	10	43439	43448	0 %	60 %	20 %	20 %	383842854
1010	NC_017062	GCA	2	6	43607	43612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842854
1011	NC_017062	CTAAAG	2	12	43623	43634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383842854
1012	NC_017062	GT	3	6	43644	43649	0 %	50 %	50 %	0 %	383842854
1013	NC_017062	TTG	2	6	43653	43658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842854
1014	NC_017062	TAA	2	6	43665	43670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842854
1015	NC_017062	TCT	2	6	43679	43684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842854
1016	NC_017062	TAT	2	6	43698	43703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842854
1017	NC_017062	AT	3	6	43702	43707	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
1018	NC_017062	AT	3	6	43730	43735	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
1019	NC_017062	TTG	2	6	43770	43775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842854
1020	NC_017062	TCTATC	2	12	43786	43797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383842854
1021	NC_017062	AT	3	6	43813	43818	50 %	50 %	0 %	0 %	383842854
1022	NC_017062	TCA	2	6	43850	43855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842854
1023	NC_017062	T	8	8	43889	43896	0 %	100 %	0 %	0 %	383842854
1024	NC_017062	GCTT	2	8	43907	43914	0 %	50 %	25 %	25 %	383842854
1025	NC_017062	ATC	2	6	43918	43923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842854
1026	NC_017062	TAGCAA	2	12	43953	43964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383842854
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1028	NC_017062	TAC	2	6	44013	44018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842854
1029	NC_017062	TAAA	2	8	44109	44116	75 %	25 %	0 %	0 %	383842854
1030	NC_017062	ATTT	2	8	44125	44132	25 %	75 %	0 %	0 %	383842854
1031	NC_017062	A	6	6	44194	44199	100 %	0 %	0 %	0 %	383842854
1032	NC_017062	ATGT	2	8	44214	44221	25 %	50 %	25 %	0 %	383842854
1033	NC_017062	AAT	2	6	44384	44389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842854
1034	NC_017062	ATTAT	2	10	44631	44640	40 %	60 %	0 %	0 %	383842855
1035	NC_017062	A	6	6	44694	44699	100 %	0 %	0 %	0 %	383842855
1036	NC_017062	GTA	2	6	44706	44711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842855
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1038	NC_017062	A	7	7	44796	44802	100 %	0 %	0 %	0 %	383842855
1039	NC_017062	TG	3	6	44805	44810	0 %	50 %	50 %	0 %	383842855
1040	NC_017062	TGTT	2	8	44813	44820	0 %	75 %	25 %	0 %	383842855
1041	NC_017062	TAC	2	6	44839	44844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842855
1042	NC_017062	GCA	2	6	44850	44855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383842855
1043	NC_017062	TCT	2	6	44856	44861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842855
1044	NC_017062	TCA	2	6	44967	44972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842855
1045	NC_017062	ATC	2	6	44979	44984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842855
1046	NC_017062	T	6	6	44986	44991	0 %	100 %	0 %	0 %	383842855
1047	NC_017062	AT	3	6	45004	45009	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
1048	NC_017062	AT	3	6	45024	45029	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
1049	NC_017062	ATC	2	6	45113	45118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842855
1050	NC_017062	T	8	8	45239	45246	0 %	100 %	0 %	0 %	383842855
1051	NC_017062	TAT	2	6	45286	45291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842855
1052	NC_017062	A	6	6	45476	45481	100 %	0 %	0 %	0 %	383842855
1053	NC_017062	AAG	2	6	45519	45524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383842855
1054	NC_017062	TAAAA	2	10	45598	45607	80 %	20 %	0 %	0 %	383842855
1055	NC_017062	TA	3	6	45740	45745	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
1056	NC_017062	TC	3	6	45798	45803	0 %	50 %	0 %	50 %	383842855
1057	NC_017062	CTG	2	6	45835	45840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842855
1058	NC_017062	ATA	2	6	45847	45852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842855
1059	NC_017062	TCT	2	6	45855	45860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842855
1060	NC_017062	ATG	2	6	45899	45904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842855
1061	NC_017062	TAG	2	6	45928	45933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842855
1062	NC_017062	CAA	2	6	45958	45963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842855
1063	NC_017062	TGA	2	6	46141	46146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842855
1064	NC_017062	A	6	6	46199	46204	100 %	0 %	0 %	0 %	383842855
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1066	NC_017062	AATT	2	8	46276	46283	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
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1074	NC_017062	AT	3	6	46524	46529	50 %	50 %	0 %	0 %	383842855
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1082	NC_017062	GTTCTA	2	12	46908	46919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383842855
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1096	NC_017062	AATC	2	8	48313	48320	50 %	25 %	0 %	25 %	383842857
1097	NC_017062	TAAC	2	8	48328	48335	50 %	25 %	0 %	25 %	383842857
1098	NC_017062	ATA	2	6	48359	48364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842857
1099	NC_017062	ATA	2	6	48438	48443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842857
1100	NC_017062	TAT	2	6	48517	48522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842857
1101	NC_017062	TAT	2	6	48536	48541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842857
1102	NC_017062	CAA	2	6	48568	48573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842857
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1109	NC_017062	GAAA	2	8	49199	49206	75 %	0 %	25 %	0 %	383842858
1110	NC_017062	TTA	2	6	49221	49226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842858
1111	NC_017062	GATT	2	8	49248	49255	25 %	50 %	25 %	0 %	383842858
1112	NC_017062	TAC	2	6	49256	49261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842858
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1121	NC_017062	ATC	2	6	51143	51148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842860
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1123	NC_017062	TAA	3	9	51215	51223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842860
1124	NC_017062	AGT	2	6	51255	51260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842861
1125	NC_017062	ATC	2	6	51349	51354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842861
1126	NC_017062	T	6	6	51371	51376	0 %	100 %	0 %	0 %	383842861
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