MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017062	TA	3	6	239166	239171	50 %	50 %	0 %	0 %	383843006
5002	NC_017062	ATC	2	6	239172	239177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843006
5003	NC_017062	AT	3	6	239197	239202	50 %	50 %	0 %	0 %	383843006
5004	NC_017062	T	8	8	239241	239248	0 %	100 %	0 %	0 %	383843006
5005	NC_017062	AAT	2	6	239270	239275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843006
5006	NC_017062	TACA	2	8	239307	239314	50 %	25 %	0 %	25 %	383843006
5007	NC_017062	A	6	6	239363	239368	100 %	0 %	0 %	0 %	383843006
5008	NC_017062	AT	3	6	239411	239416	50 %	50 %	0 %	0 %	383843006
5009	NC_017062	CTT	2	6	239456	239461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843007
5010	NC_017062	TTA	2	6	239681	239686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5011	NC_017062	TTA	2	6	239696	239701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5012	NC_017062	TTA	2	6	239718	239723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5013	NC_017062	AATT	2	8	239757	239764	50 %	50 %	0 %	0 %	383843007
5014	NC_017062	ATC	2	6	239810	239815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843007
5015	NC_017062	TTA	2	6	239837	239842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5016	NC_017062	TAAT	2	8	239867	239874	50 %	50 %	0 %	0 %	383843007
5017	NC_017062	TTC	2	6	239881	239886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843007
5018	NC_017062	TA	3	6	239904	239909	50 %	50 %	0 %	0 %	383843007
5019	NC_017062	TAC	2	6	239937	239942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843007
5020	NC_017062	T	8	8	239967	239974	0 %	100 %	0 %	0 %	383843007
5021	NC_017062	A	6	6	240028	240033	100 %	0 %	0 %	0 %	383843007
5022	NC_017062	TCA	2	6	240035	240040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843007
5023	NC_017062	T	6	6	240072	240077	0 %	100 %	0 %	0 %	383843007
5024	NC_017062	ATA	2	6	240088	240093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843007
5025	NC_017062	TTG	2	6	240157	240162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843007
5026	NC_017062	TAA	2	6	240163	240168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843007
5027	NC_017062	TAC	2	6	240183	240188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843007
5028	NC_017062	TTA	2	6	240195	240200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5029	NC_017062	ATA	2	6	240274	240279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843007
5030	NC_017062	GCA	2	6	240323	240328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843007
5031	NC_017062	TAA	2	6	240357	240362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843007
5032	NC_017062	TAGT	2	8	240363	240370	25 %	50 %	25 %	0 %	383843007
5033	NC_017062	ATT	2	6	240379	240384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843007
5034	NC_017062	ATT	2	6	240401	240406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5035	NC_017062	T	7	7	240414	240420	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
5036	NC_017062	TAA	2	6	240449	240454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843008
5037	NC_017062	T	6	6	240510	240515	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
5038	NC_017062	TTG	2	6	240519	240524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843008
5039	NC_017062	TAT	2	6	240538	240543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5040	NC_017062	TGT	2	6	240544	240549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843008
5041	NC_017062	AAT	2	6	240593	240598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843008
5042	NC_017062	T	7	7	240610	240616	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
5043	NC_017062	A	6	6	240619	240624	100 %	0 %	0 %	0 %	383843008
5044	NC_017062	ATT	2	6	240629	240634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5045	NC_017062	TTA	2	6	240702	240707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5046	NC_017062	AAATAA	2	12	240757	240768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383843008
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5049	NC_017062	TGA	2	6	240981	240986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843008
5050	NC_017062	TAT	2	6	241009	241014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5051	NC_017062	ATC	2	6	241049	241054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843008
5052	NC_017062	TA	3	6	241066	241071	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
5053	NC_017062	TTA	2	6	241077	241082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5054	NC_017062	ATT	2	6	241106	241111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
5055	NC_017062	TAA	2	6	241159	241164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843008
5056	NC_017062	AT	3	6	241204	241209	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
5057	NC_017062	ACTTT	2	10	241261	241270	20 %	60 %	0 %	20 %	383843008
5058	NC_017062	AT	3	6	241331	241336	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
5059	NC_017062	T	6	6	241359	241364	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
5060	NC_017062	T	6	6	241383	241388	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
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5062	NC_017062	TCCA	2	8	241516	241523	25 %	25 %	0 %	50 %	383843009
5063	NC_017062	TTC	2	6	241525	241530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843009
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5065	NC_017062	T	7	7	241615	241621	0 %	100 %	0 %	0 %	383843009
5066	NC_017062	TGT	2	6	241626	241631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843009
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5070	NC_017062	CTT	2	6	241764	241769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843009
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5074	NC_017062	AT	3	6	241915	241920	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
5075	NC_017062	T	6	6	241920	241925	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
5076	NC_017062	TTAA	2	8	241956	241963	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
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5087	NC_017062	T	6	6	242236	242241	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
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5091	NC_017062	TTA	2	6	242440	242445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
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5095	NC_017062	ATTT	2	8	242630	242637	25 %	75 %	0 %	0 %	383843010
5096	NC_017062	TA	3	6	242647	242652	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
5097	NC_017062	GTC	2	6	242679	242684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843010
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5104	NC_017062	CT	3	6	242829	242834	0 %	50 %	0 %	50 %	383843010
5105	NC_017062	T	7	7	242858	242864	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
5106	NC_017062	TTA	2	6	242904	242909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
5107	NC_017062	TAC	2	6	242927	242932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
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5109	NC_017062	CCA	2	6	242946	242951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843010
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5111	NC_017062	ACC	2	6	243026	243031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843010
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5113	NC_017062	ATT	2	6	243215	243220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
5114	NC_017062	T	6	6	243219	243224	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
5115	NC_017062	T	6	6	243243	243248	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
5116	NC_017062	TAAA	2	8	243252	243259	75 %	25 %	0 %	0 %	383843010
5117	NC_017062	CTG	2	6	243265	243270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843010
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5121	NC_017062	TAAC	2	8	243346	243353	50 %	25 %	0 %	25 %	383843010
5122	NC_017062	TAT	2	6	243427	243432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
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5497	NC_017062	TA	3	6	266713	266718	50 %	50 %	0 %	0 %	383843024
5498	NC_017062	GGTT	2	8	266755	266762	0 %	50 %	50 %	0 %	383843024
5499	NC_017062	TA	3	6	266788	266793	50 %	50 %	0 %	0 %	383843024
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