MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 22274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017062	ATA	2	6	213578	213583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842990
4503	NC_017062	CTC	2	6	213596	213601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383842990
4504	NC_017062	ACC	2	6	213621	213626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842990
4505	NC_017062	T	7	7	213663	213669	0 %	100 %	0 %	0 %	383842990
4506	NC_017062	TAA	2	6	213725	213730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383842990
4507	NC_017062	ACA	2	6	213736	213741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383842990
4508	NC_017062	TA	3	6	213788	213793	50 %	50 %	0 %	0 %	383842990
4509	NC_017062	ATC	2	6	213798	213803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842990
4510	NC_017062	TTG	2	6	213851	213856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842990
4511	NC_017062	A	6	6	213864	213869	100 %	0 %	0 %	0 %	383842990
4512	NC_017062	CTT	2	6	213911	213916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842990
4513	NC_017062	AGT	2	6	213966	213971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842990
4514	NC_017062	ACGC	2	8	214038	214045	25 %	0 %	25 %	50 %	383842990
4515	NC_017062	TTCT	2	8	214052	214059	0 %	75 %	0 %	25 %	383842990
4516	NC_017062	TATT	2	8	214070	214077	25 %	75 %	0 %	0 %	383842990
4517	NC_017062	CAT	2	6	214124	214129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842990
4518	NC_017062	ACC	2	6	214143	214148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383842990
4519	NC_017062	ATT	2	6	214167	214172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842990
4520	NC_017062	GT	3	6	214264	214269	0 %	50 %	50 %	0 %	383842990
4521	NC_017062	CTT	2	6	214277	214282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842990
4522	NC_017062	TAT	2	6	214289	214294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842990
4523	NC_017062	GTATCT	2	12	214306	214317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383842990
4524	NC_017062	CTT	2	6	214340	214345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842990
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4529	NC_017062	TAT	2	6	214649	214654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842991
4530	NC_017062	CTG	2	6	214673	214678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842991
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4532	NC_017062	TTA	2	6	214717	214722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842991
4533	NC_017062	CTT	2	6	214730	214735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383842991
4534	NC_017062	CAT	2	6	214742	214747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842991
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4538	NC_017062	TTA	2	6	214822	214827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842991
4539	NC_017062	T	7	7	214830	214836	0 %	100 %	0 %	0 %	383842991
4540	NC_017062	T	6	6	214856	214861	0 %	100 %	0 %	0 %	383842991
4541	NC_017062	TAT	2	6	214904	214909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842991
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4549	NC_017062	AGT	2	6	215260	215265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383842991
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4552	NC_017062	ATT	2	6	215481	215486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842991
4553	NC_017062	TA	3	6	215493	215498	50 %	50 %	0 %	0 %	383842991
4554	NC_017062	TGT	2	6	215499	215504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383842991
4555	NC_017062	ATC	2	6	215505	215510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383842991
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4557	NC_017062	CAAT	2	8	215635	215642	50 %	25 %	0 %	25 %	383842991
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4603	NC_017062	CTG	2	6	217987	217992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383842992
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4606	NC_017062	T	7	7	218054	218060	0 %	100 %	0 %	0 %	383842992
4607	NC_017062	ATAA	2	8	218076	218083	75 %	25 %	0 %	0 %	383842992
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4620	NC_017062	ATT	2	6	218582	218587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383842992
4621	NC_017062	T	6	6	218586	218591	0 %	100 %	0 %	0 %	383842992
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4994	NC_017062	AAT	2	6	237618	237623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843005
4995	NC_017062	AAT	2	6	237633	237638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843005
4996	NC_017062	TTA	2	6	238992	238997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843006
4997	NC_017062	CTCGT	2	10	238998	239007	0 %	40 %	20 %	40 %	383843006
4998	NC_017062	ATT	3	9	239098	239106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843006
4999	NC_017062	ATT	2	6	239137	239142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843006
5000	NC_017062	TCA	2	6	239143	239148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843006

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