MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017060	CGC	2	6	208318	208323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527774
3502	NC_017060	TGC	2	6	208336	208341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527774
3503	NC_017060	CAC	2	6	208358	208363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527774
3504	NC_017060	GCC	2	6	208388	208393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527774
3505	NC_017060	GC	3	6	208404	208409	0 %	0 %	50 %	50 %	384527774
3506	NC_017060	ATG	2	6	208675	208680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527775
3507	NC_017060	ACG	2	6	208735	208740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3508	NC_017060	TTA	2	6	208766	208771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527775
3509	NC_017060	A	6	6	208798	208803	100 %	0 %	0 %	0 %	384527775
3510	NC_017060	GCG	2	6	208870	208875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527775
3511	NC_017060	CAC	2	6	208968	208973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527775
3512	NC_017060	GCG	2	6	209128	209133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527775
3513	NC_017060	ATT	2	6	209163	209168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527775
3514	NC_017060	CTG	2	6	209219	209224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3515	NC_017060	CTG	2	6	209227	209232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3516	NC_017060	GCT	2	6	209241	209246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3517	NC_017060	GC	3	6	209395	209400	0 %	0 %	50 %	50 %	384527775
3518	NC_017060	ATG	2	6	209426	209431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527775
3519	NC_017060	CGT	2	6	209454	209459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3520	NC_017060	GCC	2	6	209473	209478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527775
3521	NC_017060	TGTC	2	8	209487	209494	0 %	50 %	25 %	25 %	384527775
3522	NC_017060	GCT	2	6	209541	209546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3523	NC_017060	CAG	2	6	209557	209562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527775
3524	NC_017060	GCGCA	2	10	209563	209572	20 %	0 %	40 %	40 %	384527775
3525	NC_017060	ATT	2	6	209671	209676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527776
3526	NC_017060	CGC	2	6	209691	209696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527776
3527	NC_017060	CTG	2	6	209698	209703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527776
3528	NC_017060	TTA	2	6	209722	209727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527776
3529	NC_017060	CAT	2	6	209760	209765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527776
3530	NC_017060	CTG	2	6	209857	209862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527776
3531	NC_017060	GC	3	6	209932	209937	0 %	0 %	50 %	50 %	384527776
3532	NC_017060	TTC	2	6	209940	209945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527776
3533	NC_017060	TTG	2	6	210008	210013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527776
3534	NC_017060	GCGT	2	8	210143	210150	0 %	25 %	50 %	25 %	384527776
3535	NC_017060	GGC	2	6	210257	210262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527776
3536	NC_017060	GCG	2	6	210277	210282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527776
3537	NC_017060	GTG	2	6	210292	210297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527776
3538	NC_017060	GCT	2	6	210300	210305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527776
3539	NC_017060	TGG	2	6	210332	210337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527776
3540	NC_017060	GCC	2	6	210388	210393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527776
3541	NC_017060	ACACTG	2	12	210421	210432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384527776
3542	NC_017060	AATCA	2	10	210485	210494	60 %	20 %	0 %	20 %	384527776
3543	NC_017060	GCA	2	6	210567	210572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527777
3544	NC_017060	CGC	2	6	210592	210597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527777
3545	NC_017060	AATT	2	8	210625	210632	50 %	50 %	0 %	0 %	384527777
3546	NC_017060	ATG	2	6	210640	210645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527777
3547	NC_017060	GGT	3	9	210653	210661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527777
3548	NC_017060	AATC	2	8	210677	210684	50 %	25 %	0 %	25 %	384527777
3549	NC_017060	TTG	2	6	210718	210723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527777
3550	NC_017060	CA	3	6	210734	210739	50 %	0 %	0 %	50 %	384527777
3551	NC_017060	GGCT	2	8	210756	210763	0 %	25 %	50 %	25 %	384527777
3552	NC_017060	GTT	2	6	210870	210875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527777
3553	NC_017060	GC	3	6	210917	210922	0 %	0 %	50 %	50 %	384527777
3554	NC_017060	TGC	2	6	211042	211047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527777
3555	NC_017060	TC	3	6	211073	211078	0 %	50 %	0 %	50 %	384527777
3556	NC_017060	CCG	2	6	211082	211087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527777
3557	NC_017060	ACTGGC	2	12	211121	211132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384527777
3558	NC_017060	CG	3	6	211157	211162	0 %	0 %	50 %	50 %	384527777
3559	NC_017060	CCGC	2	8	211271	211278	0 %	0 %	25 %	75 %	384527777
3560	NC_017060	CG	3	6	211322	211327	0 %	0 %	50 %	50 %	384527777
3561	NC_017060	GCT	2	6	211364	211369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527777
3562	NC_017060	GGC	2	6	211370	211375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527777
3563	NC_017060	TC	3	6	211677	211682	0 %	50 %	0 %	50 %	384527778
3564	NC_017060	CTG	2	6	211691	211696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527778
3565	NC_017060	CA	3	6	211722	211727	50 %	0 %	0 %	50 %	384527778
3566	NC_017060	CGG	2	6	211742	211747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527778
3567	NC_017060	CGAT	2	8	211757	211764	25 %	25 %	25 %	25 %	384527778
3568	NC_017060	ATG	3	9	211834	211842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527778
3569	NC_017060	TCA	2	6	211919	211924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527778
3570	NC_017060	ATGC	2	8	212032	212039	25 %	25 %	25 %	25 %	384527778
3571	NC_017060	CGT	2	6	212110	212115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527778
3572	NC_017060	CAC	2	6	212122	212127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527778
3573	NC_017060	GAT	2	6	212146	212151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527778
3574	NC_017060	ATC	2	6	212182	212187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527778
3575	NC_017060	GCA	2	6	212271	212276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
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3577	NC_017060	CG	3	6	212326	212331	0 %	0 %	50 %	50 %	384527779
3578	NC_017060	CAG	2	6	212384	212389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3579	NC_017060	CAT	2	6	212392	212397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527779
3580	NC_017060	GGC	2	6	212426	212431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527779
3581	NC_017060	TCG	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3582	NC_017060	GTTT	2	8	212604	212611	0 %	75 %	25 %	0 %	384527779
3583	NC_017060	GGC	2	6	212642	212647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527779
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3585	NC_017060	CGC	2	6	212665	212670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527779
3586	NC_017060	GCT	2	6	212728	212733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3587	NC_017060	ACC	2	6	212748	212753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527779
3588	NC_017060	GC	4	8	212757	212764	0 %	0 %	50 %	50 %	384527779
3589	NC_017060	CAG	2	6	212825	212830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3590	NC_017060	GCA	2	6	212842	212847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3591	NC_017060	CGG	2	6	212908	212913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527779
3592	NC_017060	GACGC	2	10	212925	212934	20 %	0 %	40 %	40 %	384527779
3593	NC_017060	GCA	2	6	213046	213051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
3594	NC_017060	TGAA	2	8	213057	213064	50 %	25 %	25 %	0 %	384527779
3595	NC_017060	AC	3	6	213089	213094	50 %	0 %	0 %	50 %	384527779
3596	NC_017060	CCGG	2	8	213147	213154	0 %	0 %	50 %	50 %	384527779
3597	NC_017060	ATG	2	6	213207	213212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527779
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3604	NC_017060	CCA	2	6	213570	213575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527779
3605	NC_017060	GAC	2	6	213581	213586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527779
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3607	NC_017060	TAAT	2	8	213666	213673	50 %	50 %	0 %	0 %	384527780
3608	NC_017060	CTT	2	6	213683	213688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527780
3609	NC_017060	AAG	2	6	213709	213714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527780
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3611	NC_017060	GCT	2	6	213749	213754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527780
3612	NC_017060	AAT	2	6	213787	213792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527780
3613	NC_017060	T	6	6	213809	213814	0 %	100 %	0 %	0 %	384527780
3614	NC_017060	TAA	2	6	213838	213843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527780
3615	NC_017060	CCA	2	6	213916	213921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527780
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3617	NC_017060	TA	3	6	214118	214123	50 %	50 %	0 %	0 %	384527780
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3622	NC_017060	CAC	2	6	214355	214360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527780
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