MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017060	GAA	2	6	181406	181411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527744
3002	NC_017060	GAC	2	6	181424	181429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527744
3003	NC_017060	CAT	2	6	181504	181509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527744
3004	NC_017060	GTG	2	6	181544	181549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527744
3005	NC_017060	TGCC	2	8	181558	181565	0 %	25 %	25 %	50 %	384527744
3006	NC_017060	GCG	2	6	181572	181577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527744
3007	NC_017060	GGC	2	6	181606	181611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527744
3008	NC_017060	GT	3	6	181628	181633	0 %	50 %	50 %	0 %	384527744
3009	NC_017060	GCG	2	6	181644	181649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527744
3010	NC_017060	GCA	2	6	181669	181674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527744
3011	NC_017060	GAT	2	6	181681	181686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527744
3012	NC_017060	GCC	2	6	181795	181800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527744
3013	NC_017060	TCGA	2	8	181838	181845	25 %	25 %	25 %	25 %	384527744
3014	NC_017060	GAT	2	6	181901	181906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527745
3015	NC_017060	CCA	2	6	181919	181924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527745
3016	NC_017060	GCTG	2	8	182086	182093	0 %	25 %	50 %	25 %	384527745
3017	NC_017060	TCA	2	6	182151	182156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527745
3018	NC_017060	GCT	2	6	182195	182200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527745
3019	NC_017060	TCA	2	6	182213	182218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527745
3020	NC_017060	AGC	2	6	182434	182439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527745
3021	NC_017060	GT	3	6	182604	182609	0 %	50 %	50 %	0 %	384527745
3022	NC_017060	GCAG	2	8	182681	182688	25 %	0 %	50 %	25 %	384527745
3023	NC_017060	GGC	2	6	182697	182702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527745
3024	NC_017060	TGA	2	6	182754	182759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527745
3025	NC_017060	ATCTGC	2	12	182760	182771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384527746
3026	NC_017060	GTG	2	6	182780	182785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527746
3027	NC_017060	CGGCG	2	10	182812	182821	0 %	0 %	60 %	40 %	384527746
3028	NC_017060	GAA	2	6	182840	182845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527746
3029	NC_017060	ATC	2	6	182861	182866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527746
3030	NC_017060	ACTG	2	8	182935	182942	25 %	25 %	25 %	25 %	384527746
3031	NC_017060	CGA	2	6	182950	182955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527746
3032	NC_017060	GCA	2	6	183000	183005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527746
3033	NC_017060	GC	3	6	183139	183144	0 %	0 %	50 %	50 %	384527746
3034	NC_017060	GGC	2	6	183227	183232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527746
3035	NC_017060	GCG	2	6	183260	183265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527746
3036	NC_017060	CGG	2	6	183303	183308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527746
3037	NC_017060	CGC	2	6	183318	183323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527746
3038	NC_017060	GAA	2	6	183359	183364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527746
3039	NC_017060	CAA	2	6	183371	183376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527746
3040	NC_017060	CGC	2	6	183414	183419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527746
3041	NC_017060	GTG	2	6	183437	183442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527746
3042	NC_017060	CT	3	6	183449	183454	0 %	50 %	0 %	50 %	384527746
3043	NC_017060	CAC	2	6	183469	183474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527746
3044	NC_017060	CGG	2	6	183496	183501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527746
3045	NC_017060	CGC	2	6	183535	183540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527747
3046	NC_017060	GAA	2	6	183583	183588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527747
3047	NC_017060	TGA	2	6	183686	183691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527747
3048	NC_017060	CGC	2	6	183736	183741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527747
3049	NC_017060	GGA	2	6	183747	183752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527747
3050	NC_017060	CGCC	2	8	183812	183819	0 %	0 %	25 %	75 %	384527747
3051	NC_017060	GTGG	2	8	183828	183835	0 %	25 %	75 %	0 %	384527747
3052	NC_017060	T	6	6	183848	183853	0 %	100 %	0 %	0 %	384527747
3053	NC_017060	GCTG	2	8	183855	183862	0 %	25 %	50 %	25 %	384527747
3054	NC_017060	GCGCA	2	10	184019	184028	20 %	0 %	40 %	40 %	384527748
3055	NC_017060	ACG	2	6	184031	184036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3056	NC_017060	CAC	2	6	184066	184071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527748
3057	NC_017060	GCT	2	6	184102	184107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3058	NC_017060	GCC	2	6	184175	184180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3059	NC_017060	ATC	2	6	184199	184204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527748
3060	NC_017060	CCG	2	6	184212	184217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3061	NC_017060	TTC	2	6	184220	184225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3062	NC_017060	TGG	2	6	184257	184262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3063	NC_017060	GTCTGT	2	12	184263	184274	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384527748
3064	NC_017060	TGT	2	6	184290	184295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527748
3065	NC_017060	CGC	2	6	184303	184308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3066	NC_017060	GCAG	2	8	184313	184320	25 %	0 %	50 %	25 %	384527748
3067	NC_017060	CCG	2	6	184380	184385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3068	NC_017060	CCGG	2	8	184415	184422	0 %	0 %	50 %	50 %	384527748
3069	NC_017060	CGC	2	6	184430	184435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3070	NC_017060	ATC	2	6	184484	184489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527748
3071	NC_017060	GGT	2	6	184490	184495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3072	NC_017060	TTC	2	6	184502	184507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3073	NC_017060	CA	3	6	184513	184518	50 %	0 %	0 %	50 %	384527748
3074	NC_017060	CAC	2	6	184522	184527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527748
3075	NC_017060	GACG	2	8	184528	184535	25 %	0 %	50 %	25 %	384527748
3076	NC_017060	TGC	2	6	184581	184586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3077	NC_017060	GCA	2	6	184675	184680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3078	NC_017060	CGG	2	6	184693	184698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527748
3079	NC_017060	TTC	2	6	184712	184717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3080	NC_017060	CTT	2	6	184747	184752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3081	NC_017060	ACC	2	6	184763	184768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527748
3082	NC_017060	CGT	2	6	184800	184805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3083	NC_017060	CTG	2	6	184808	184813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3084	NC_017060	TTC	2	6	184847	184852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3085	NC_017060	GCT	2	6	184888	184893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527748
3086	NC_017060	GGT	2	6	184894	184899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3087	NC_017060	CAT	2	6	184906	184911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527748
3088	NC_017060	TGTGC	2	10	184918	184927	0 %	40 %	40 %	20 %	384527748
3089	NC_017060	GTG	3	9	184931	184939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3090	NC_017060	TGG	2	6	184971	184976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3091	NC_017060	TCT	2	6	184983	184988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527748
3092	NC_017060	CAAA	2	8	185041	185048	75 %	0 %	0 %	25 %	384527748
3093	NC_017060	TGA	2	6	185067	185072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527748
3094	NC_017060	ACA	2	6	185133	185138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527748
3095	NC_017060	CCG	2	6	185139	185144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527748
3096	NC_017060	GTG	2	6	185177	185182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527748
3097	NC_017060	GCG	2	6	185213	185218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527748
3098	NC_017060	T	7	7	185460	185466	0 %	100 %	0 %	0 %	384527749
3099	NC_017060	GAT	2	6	185536	185541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527749
3100	NC_017060	TGA	2	6	185552	185557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527749
3101	NC_017060	GGC	2	6	185563	185568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527749
3102	NC_017060	TGAC	2	8	185606	185613	25 %	25 %	25 %	25 %	384527749
3103	NC_017060	GCT	2	6	185643	185648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527749
3104	NC_017060	GCT	3	9	185673	185681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527749
3105	NC_017060	GTG	2	6	185704	185709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527749
3106	NC_017060	TGC	2	6	185739	185744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527749
3107	NC_017060	CGG	2	6	185895	185900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527749
3108	NC_017060	TTA	2	6	185929	185934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527749
3109	NC_017060	CCG	2	6	185958	185963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527749
3110	NC_017060	GAT	2	6	185977	185982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527749
3111	NC_017060	CG	3	6	185985	185990	0 %	0 %	50 %	50 %	384527749
3112	NC_017060	GCT	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527749
3113	NC_017060	GCG	2	6	186100	186105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527749
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3115	NC_017060	TGA	2	6	186200	186205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527749
3116	NC_017060	CCG	2	6	186224	186229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527749
3117	NC_017060	CG	3	6	186228	186233	0 %	0 %	50 %	50 %	384527749
3118	NC_017060	GGC	2	6	186303	186308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527749
3119	NC_017060	GCC	2	6	186316	186321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527749
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3121	NC_017060	TGC	3	9	186404	186412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527749
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3243	NC_017060	AGA	2	6	192318	192323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527756
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3365	NC_017060	CAT	2	6	199182	199187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
3366	NC_017060	CAT	2	6	199200	199205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527763
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3487	NC_017060	TGG	2	6	207682	207687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527774
3488	NC_017060	TGCA	2	8	207709	207716	25 %	25 %	25 %	25 %	384527774
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