MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017060	GTT	2	6	88565	88570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527663
1502	NC_017060	GAT	2	6	88581	88586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527663
1503	NC_017060	AGCGG	2	10	88625	88634	20 %	0 %	60 %	20 %	384527663
1504	NC_017060	CCAG	2	8	88654	88661	25 %	0 %	25 %	50 %	384527663
1505	NC_017060	TTCG	2	8	88738	88745	0 %	50 %	25 %	25 %	384527663
1506	NC_017060	TTC	2	6	88786	88791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527663
1507	NC_017060	CCAG	2	8	88821	88828	25 %	0 %	25 %	50 %	384527663
1508	NC_017060	GCA	2	6	88908	88913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527663
1509	NC_017060	CGC	2	6	88929	88934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527663
1510	NC_017060	CCGC	2	8	88941	88948	0 %	0 %	25 %	75 %	384527663
1511	NC_017060	GCTT	2	8	88992	88999	0 %	50 %	25 %	25 %	384527663
1512	NC_017060	CCG	2	6	89102	89107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527663
1513	NC_017060	TGT	2	6	89274	89279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527663
1514	NC_017060	GC	3	6	89307	89312	0 %	0 %	50 %	50 %	384527663
1515	NC_017060	CAC	2	6	89329	89334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527663
1516	NC_017060	GCCC	2	8	89349	89356	0 %	0 %	25 %	75 %	384527663
1517	NC_017060	CCA	2	6	89373	89378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527663
1518	NC_017060	ACGC	2	8	89383	89390	25 %	0 %	25 %	50 %	384527663
1519	NC_017060	CAC	2	6	89413	89418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527663
1520	NC_017060	GC	4	8	89423	89430	0 %	0 %	50 %	50 %	384527663
1521	NC_017060	GCT	2	6	89451	89456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527663
1522	NC_017060	CAGT	2	8	89489	89496	25 %	25 %	25 %	25 %	384527663
1523	NC_017060	TTC	2	6	89518	89523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527663
1524	NC_017060	CTG	2	6	89545	89550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527663
1525	NC_017060	AGC	2	6	89558	89563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527663
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1528	NC_017060	TCT	2	6	89673	89678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527663
1529	NC_017060	GC	3	6	89714	89719	0 %	0 %	50 %	50 %	384527663
1530	NC_017060	CTG	2	6	89727	89732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527663
1531	NC_017060	AATG	2	8	89761	89768	50 %	25 %	25 %	0 %	384527663
1532	NC_017060	CAC	2	6	89815	89820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527663
1533	NC_017060	CGC	2	6	89844	89849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527663
1534	NC_017060	TA	3	6	89892	89897	50 %	50 %	0 %	0 %	384527663
1535	NC_017060	AAGA	2	8	89898	89905	75 %	0 %	25 %	0 %	384527663
1536	NC_017060	TGT	2	6	89911	89916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527663
1537	NC_017060	G	6	6	89917	89922	0 %	0 %	100 %	0 %	384527663
1538	NC_017060	CCG	2	6	89941	89946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527663
1539	NC_017060	CCA	2	6	89985	89990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527663
1540	NC_017060	GTA	2	6	90017	90022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527663
1541	NC_017060	ATC	2	6	90064	90069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527663
1542	NC_017060	CAA	2	6	90096	90101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527663
1543	NC_017060	ATG	2	6	90122	90127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527663
1544	NC_017060	TTA	2	6	90188	90193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527663
1545	NC_017060	CCT	2	6	90225	90230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527663
1546	NC_017060	T	6	6	90260	90265	0 %	100 %	0 %	0 %	384527663
1547	NC_017060	TTC	2	6	90283	90288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527663
1548	NC_017060	CTG	2	6	90312	90317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527663
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1552	NC_017060	TTAA	2	8	90599	90606	50 %	50 %	0 %	0 %	384527663
1553	NC_017060	CTT	2	6	90634	90639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527664
1554	NC_017060	TCA	2	6	90660	90665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527664
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1556	NC_017060	GA	3	6	90748	90753	50 %	0 %	50 %	0 %	384527664
1557	NC_017060	CAA	2	6	90764	90769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527664
1558	NC_017060	CTC	2	6	90818	90823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527664
1559	NC_017060	TTG	2	6	90882	90887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527664
1560	NC_017060	TCA	2	6	90900	90905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527664
1561	NC_017060	AGC	2	6	91008	91013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527664
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1563	NC_017060	T	7	7	91784	91790	0 %	100 %	0 %	0 %	384527665
1564	NC_017060	TTC	2	6	91853	91858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527665
1565	NC_017060	TTTG	2	8	92003	92010	0 %	75 %	25 %	0 %	384527665
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1569	NC_017060	CTG	2	6	92556	92561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527666
1570	NC_017060	CGA	2	6	92619	92624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527666
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1572	NC_017060	GC	3	6	92687	92692	0 %	0 %	50 %	50 %	384527666
1573	NC_017060	CAGCG	2	10	92746	92755	20 %	0 %	40 %	40 %	384527666
1574	NC_017060	GCC	2	6	92759	92764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527666
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1576	NC_017060	GGTCA	2	10	92794	92803	20 %	20 %	40 %	20 %	384527666
1577	NC_017060	TTCA	2	8	92848	92855	25 %	50 %	0 %	25 %	384527666
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1582	NC_017060	GCTT	2	8	92971	92978	0 %	50 %	25 %	25 %	384527667
1583	NC_017060	TGA	2	6	92992	92997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527667
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1588	NC_017060	CAT	2	6	93398	93403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527667
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1591	NC_017060	ACG	2	6	93638	93643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527668
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1595	NC_017060	GCAAG	2	10	94490	94499	40 %	0 %	40 %	20 %	384527669
1596	NC_017060	TC	3	6	94527	94532	0 %	50 %	0 %	50 %	384527669
1597	NC_017060	CTC	2	6	94567	94572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527669
1598	NC_017060	GCT	2	6	94875	94880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527670
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1602	NC_017060	TTC	2	6	95473	95478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527671
1603	NC_017060	CAC	2	6	95489	95494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527671
1604	NC_017060	TTC	2	6	95631	95636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527671
1605	NC_017060	AC	3	6	95749	95754	50 %	0 %	0 %	50 %	384527671
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1607	NC_017060	ATT	2	6	95775	95780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527671
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1613	NC_017060	TATC	2	8	95997	96004	25 %	50 %	0 %	25 %	384527672
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1615	NC_017060	TTC	2	6	96114	96119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527672
1616	NC_017060	CTT	2	6	96133	96138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527672
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1624	NC_017060	T	6	6	96442	96447	0 %	100 %	0 %	0 %	384527672
1625	NC_017060	ATTG	2	8	96483	96490	25 %	50 %	25 %	0 %	384527672
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1994	NC_017060	ATGC	2	8	119697	119704	25 %	25 %	25 %	25 %	384527696
1995	NC_017060	CAG	2	6	119875	119880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527696
1996	NC_017060	ATG	2	6	119924	119929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527696
1997	NC_017060	ACCG	2	8	119950	119957	25 %	0 %	25 %	50 %	384527696
1998	NC_017060	ATT	2	6	119995	120000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527696
1999	NC_017060	T	6	6	120005	120010	0 %	100 %	0 %	0 %	384527696
2000	NC_017060	CAC	2	6	120073	120078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527696

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