MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017060	CAC	2	6	56627	56632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527631
1002	NC_017060	CTC	2	6	56682	56687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527631
1003	NC_017060	A	6	6	56724	56729	100 %	0 %	0 %	0 %	384527632
1004	NC_017060	ATG	2	6	56793	56798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527632
1005	NC_017060	GAA	2	6	56817	56822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527632
1006	NC_017060	TGT	2	6	56872	56877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527632
1007	NC_017060	GAA	2	6	56904	56909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527632
1008	NC_017060	A	6	6	56943	56948	100 %	0 %	0 %	0 %	384527632
1009	NC_017060	CAT	2	6	56954	56959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527632
1010	NC_017060	GTCT	2	8	56970	56977	0 %	50 %	25 %	25 %	384527632
1011	NC_017060	GT	3	6	56986	56991	0 %	50 %	50 %	0 %	384527632
1012	NC_017060	CGC	2	6	57007	57012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527632
1013	NC_017060	T	6	6	57023	57028	0 %	100 %	0 %	0 %	384527632
1014	NC_017060	GAA	2	6	57154	57159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527633
1015	NC_017060	TCAGC	2	10	57366	57375	20 %	20 %	20 %	40 %	384527633
1016	NC_017060	GTT	2	6	57421	57426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527633
1017	NC_017060	CCG	2	6	57450	57455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527633
1018	NC_017060	ATG	2	6	57578	57583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527633
1019	NC_017060	GATG	2	8	57588	57595	25 %	25 %	50 %	0 %	384527633
1020	NC_017060	GGT	2	6	57603	57608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527633
1021	NC_017060	GAT	2	6	57685	57690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527633
1022	NC_017060	CAT	2	6	57718	57723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527633
1023	NC_017060	GCCA	2	8	57814	57821	25 %	0 %	25 %	50 %	384527634
1024	NC_017060	GCC	2	6	57822	57827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527634
1025	NC_017060	ATCAG	2	10	57895	57904	40 %	20 %	20 %	20 %	384527634
1026	NC_017060	CAG	2	6	57923	57928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527634
1027	NC_017060	GTT	2	6	57984	57989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527634
1028	NC_017060	TGT	2	6	58028	58033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527634
1029	NC_017060	CATT	2	8	58042	58049	25 %	50 %	0 %	25 %	384527634
1030	NC_017060	CAG	2	6	58053	58058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527634
1031	NC_017060	AAG	2	6	58097	58102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527634
1032	NC_017060	GCC	2	6	58155	58160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527634
1033	NC_017060	GAA	2	6	58203	58208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527634
1034	NC_017060	TCA	2	6	58229	58234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527634
1035	NC_017060	CAT	2	6	58235	58240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527634
1036	NC_017060	CGG	2	6	58276	58281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527634
1037	NC_017060	CGG	2	6	58396	58401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527634
1038	NC_017060	CAA	2	6	58454	58459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527634
1039	NC_017060	ATG	2	6	58567	58572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527634
1040	NC_017060	GCAG	2	8	58970	58977	25 %	0 %	50 %	25 %	384527635
1041	NC_017060	ACG	2	6	59007	59012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527635
1042	NC_017060	ACT	2	6	59115	59120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527635
1043	NC_017060	T	6	6	59148	59153	0 %	100 %	0 %	0 %	384527635
1044	NC_017060	TTC	2	6	59262	59267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527635
1045	NC_017060	GATC	2	8	59276	59283	25 %	25 %	25 %	25 %	384527635
1046	NC_017060	TGAA	2	8	59299	59306	50 %	25 %	25 %	0 %	384527635
1047	NC_017060	AAATAA	2	12	59667	59678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384527636
1048	NC_017060	TGA	2	6	59679	59684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527636
1049	NC_017060	GTT	2	6	59702	59707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527636
1050	NC_017060	CGG	2	6	59722	59727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527636
1051	NC_017060	ACA	2	6	59790	59795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527636
1052	NC_017060	TGC	2	6	59809	59814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1053	NC_017060	ACC	2	6	59815	59820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527636
1054	NC_017060	GTT	2	6	59989	59994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527636
1055	NC_017060	CGA	2	6	60001	60006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1056	NC_017060	CCGCG	2	10	60016	60025	0 %	0 %	40 %	60 %	384527636
1057	NC_017060	GC	3	6	60056	60061	0 %	0 %	50 %	50 %	384527636
1058	NC_017060	GCTG	2	8	60118	60125	0 %	25 %	50 %	25 %	384527636
1059	NC_017060	AAG	2	6	60132	60137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527636
1060	NC_017060	CGT	2	6	60149	60154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1061	NC_017060	GAT	2	6	60274	60279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527636
1062	NC_017060	GGT	2	6	60331	60336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527636
1063	NC_017060	TCGATG	2	12	60363	60374	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384527636
1064	NC_017060	TGG	2	6	60462	60467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527636
1065	NC_017060	CGT	2	6	60493	60498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1066	NC_017060	CTG	2	6	60554	60559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1067	NC_017060	CTG	2	6	60635	60640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527636
1068	NC_017060	TGG	2	6	60690	60695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527636
1069	NC_017060	CGG	2	6	60745	60750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527636
1070	NC_017060	TCA	2	6	60792	60797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527636
1071	NC_017060	GGC	2	6	60859	60864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527636
1072	NC_017060	CTG	2	6	61008	61013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1073	NC_017060	CGC	2	6	61111	61116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527637
1074	NC_017060	GAA	2	6	61119	61124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527637
1075	NC_017060	GAC	2	6	61190	61195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1076	NC_017060	TCCG	2	8	61204	61211	0 %	25 %	25 %	50 %	384527637
1077	NC_017060	CCG	2	6	61289	61294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527637
1078	NC_017060	TGG	2	6	61336	61341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1079	NC_017060	CGCGG	2	10	61505	61514	0 %	0 %	60 %	40 %	384527637
1080	NC_017060	GTC	2	6	61639	61644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1081	NC_017060	AGATGA	2	12	61649	61660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384527637
1082	NC_017060	ATC	2	6	61671	61676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527637
1083	NC_017060	GC	4	8	61757	61764	0 %	0 %	50 %	50 %	384527637
1084	NC_017060	TAA	3	9	61769	61777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527637
1085	NC_017060	CGAT	2	8	61822	61829	25 %	25 %	25 %	25 %	384527637
1086	NC_017060	GGT	2	6	61943	61948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1087	NC_017060	CA	3	6	61950	61955	50 %	0 %	0 %	50 %	384527637
1088	NC_017060	CGT	2	6	61967	61972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1089	NC_017060	TGG	2	6	61984	61989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1090	NC_017060	GC	3	6	62012	62017	0 %	0 %	50 %	50 %	384527637
1091	NC_017060	GAT	2	6	62145	62150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527637
1092	NC_017060	TGG	3	9	62158	62166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1093	NC_017060	GAG	2	6	62187	62192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527637
1094	NC_017060	TG	3	6	62269	62274	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
1095	NC_017060	TGC	2	6	62407	62412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1096	NC_017060	CGT	2	6	62550	62555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1097	NC_017060	CTG	2	6	62580	62585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1098	NC_017060	TG	3	6	62587	62592	0 %	50 %	50 %	0 %	384527637
1099	NC_017060	CGG	2	6	62593	62598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527637
1100	NC_017060	G	6	6	62621	62626	0 %	0 %	100 %	0 %	384527637
1101	NC_017060	TTC	2	6	62823	62828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527637
1102	NC_017060	GCG	2	6	62862	62867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527637
1103	NC_017060	GCC	3	9	62933	62941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527637
1104	NC_017060	TA	3	6	62979	62984	50 %	50 %	0 %	0 %	384527637
1105	NC_017060	TTC	2	6	63080	63085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527637
1106	NC_017060	CAC	3	9	63350	63358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527637
1107	NC_017060	GCA	2	6	63399	63404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1108	NC_017060	TTC	2	6	63437	63442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527637
1109	NC_017060	GACC	2	8	63512	63519	25 %	0 %	25 %	50 %	384527637
1110	NC_017060	CA	3	6	63536	63541	50 %	0 %	0 %	50 %	384527637
1111	NC_017060	TGC	2	6	63548	63553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1112	NC_017060	GCC	2	6	63600	63605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527637
1113	NC_017060	TGG	2	6	63727	63732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527637
1114	NC_017060	TTG	2	6	63769	63774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527637
1115	NC_017060	CGTCTG	2	12	63837	63848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527637
1116	NC_017060	GTT	2	6	63977	63982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527637
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1118	NC_017060	TCT	2	6	64193	64198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527638
1119	NC_017060	ACG	2	6	64296	64301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527638
1120	NC_017060	CTT	2	6	64302	64307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527638
1121	NC_017060	CA	3	6	64357	64362	50 %	0 %	0 %	50 %	384527638
1122	NC_017060	GCGG	2	8	64363	64370	0 %	0 %	75 %	25 %	384527638
1123	NC_017060	GC	3	6	64381	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	384527638
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1125	NC_017060	CCG	2	6	64446	64451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527638
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