MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 9998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017060	CAC	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527608
502	NC_017060	CAG	2	6	27260	27265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527608
503	NC_017060	GCAC	2	8	27362	27369	25 %	0 %	25 %	50 %	384527608
504	NC_017060	AGA	2	6	27379	27384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527608
505	NC_017060	T	7	7	27410	27416	0 %	100 %	0 %	0 %	384527608
506	NC_017060	GT	3	6	27421	27426	0 %	50 %	50 %	0 %	384527608
507	NC_017060	TGA	2	6	27777	27782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527609
508	NC_017060	ATT	2	6	27785	27790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527609
509	NC_017060	ACT	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527609
510	NC_017060	ACC	2	6	27854	27859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
511	NC_017060	CTA	2	6	27871	27876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527609
512	NC_017060	A	6	6	27880	27885	100 %	0 %	0 %	0 %	384527609
513	NC_017060	GCT	2	6	27910	27915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
514	NC_017060	CCA	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
515	NC_017060	T	6	6	27946	27951	0 %	100 %	0 %	0 %	384527609
516	NC_017060	GTC	2	6	27978	27983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
517	NC_017060	TGC	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
518	NC_017060	GGC	2	6	28012	28017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527609
519	NC_017060	AGA	2	6	28018	28023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527609
520	NC_017060	GTG	2	6	28041	28046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527609
521	NC_017060	CTG	2	6	28115	28120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
522	NC_017060	ACC	2	6	28223	28228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527609
523	NC_017060	CG	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	384527609
524	NC_017060	TCG	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527609
525	NC_017060	AGT	2	6	28432	28437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527609
526	NC_017060	AGA	2	6	28489	28494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527609
527	NC_017060	AGC	2	6	28503	28508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527609
528	NC_017060	ACT	2	6	28729	28734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527610
529	NC_017060	TCA	2	6	28849	28854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527610
530	NC_017060	CCA	2	6	28914	28919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527610
531	NC_017060	GGA	2	6	28975	28980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527610
532	NC_017060	GCGT	2	8	29007	29014	0 %	25 %	50 %	25 %	384527610
533	NC_017060	GAT	2	6	29188	29193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527611
534	NC_017060	CA	3	6	29297	29302	50 %	0 %	0 %	50 %	384527611
535	NC_017060	TTG	2	6	29361	29366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527611
536	NC_017060	GAT	2	6	29477	29482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527611
537	NC_017060	GTT	2	6	29611	29616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527611
538	NC_017060	TTTTTA	2	12	29734	29745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384527612
539	NC_017060	TAC	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527612
540	NC_017060	CTG	2	6	29757	29762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527612
541	NC_017060	GGCT	2	8	29775	29782	0 %	25 %	50 %	25 %	384527612
542	NC_017060	GATT	2	8	29783	29790	25 %	50 %	25 %	0 %	384527612
543	NC_017060	ATT	2	6	29821	29826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527612
544	NC_017060	TGA	2	6	29836	29841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527612
545	NC_017060	C	7	7	29857	29863	0 %	0 %	0 %	100 %	384527612
546	NC_017060	GAT	2	6	29880	29885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527612
547	NC_017060	TTG	2	6	29928	29933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527612
548	NC_017060	AGGC	2	8	29962	29969	25 %	0 %	50 %	25 %	384527612
549	NC_017060	TTAT	2	8	30054	30061	25 %	75 %	0 %	0 %	384527613
550	NC_017060	GTT	2	6	30089	30094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527613
551	NC_017060	TCA	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527613
552	NC_017060	CTG	2	6	30246	30251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527613
553	NC_017060	CAC	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
554	NC_017060	TTGA	2	8	30264	30271	25 %	50 %	25 %	0 %	384527613
555	NC_017060	GC	3	6	30275	30280	0 %	0 %	50 %	50 %	384527613
556	NC_017060	GCCC	2	8	30401	30408	0 %	0 %	25 %	75 %	384527613
557	NC_017060	CCG	2	6	30415	30420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527613
558	NC_017060	AAT	2	6	30426	30431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527613
559	NC_017060	CGCTT	2	10	30492	30501	0 %	40 %	20 %	40 %	384527613
560	NC_017060	ACC	2	6	30589	30594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
561	NC_017060	CAG	2	6	30633	30638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527613
562	NC_017060	GC	3	6	30652	30657	0 %	0 %	50 %	50 %	384527613
563	NC_017060	AAT	2	6	30660	30665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527613
564	NC_017060	CGT	2	6	30695	30700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527613
565	NC_017060	TCG	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527613
566	NC_017060	CA	3	6	30742	30747	50 %	0 %	0 %	50 %	384527613
567	NC_017060	GAC	2	6	30812	30817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527613
568	NC_017060	CCA	2	6	30821	30826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
569	NC_017060	GCACC	2	10	30842	30851	20 %	0 %	20 %	60 %	384527613
570	NC_017060	GCC	2	6	30852	30857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527613
571	NC_017060	CAC	2	6	30867	30872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527613
572	NC_017060	GCC	2	6	30885	30890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527613
573	NC_017060	AAC	2	6	30937	30942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527613
574	NC_017060	AC	3	6	30941	30946	50 %	0 %	0 %	50 %	384527613
575	NC_017060	GTT	2	6	31037	31042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527613
576	NC_017060	GCG	2	6	31043	31048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527613
577	NC_017060	GAA	2	6	31084	31089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527613
578	NC_017060	AGT	2	6	31091	31096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527613
579	NC_017060	CGT	2	6	31374	31379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527614
580	NC_017060	CGC	2	6	31417	31422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527614
581	NC_017060	ACA	2	6	31506	31511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527614
582	NC_017060	TGA	2	6	31588	31593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527614
583	NC_017060	ACG	2	6	31638	31643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527614
584	NC_017060	TAT	2	6	31645	31650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527614
585	NC_017060	CGG	2	6	31734	31739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527614
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587	NC_017060	CGT	2	6	31883	31888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527614
588	NC_017060	A	6	6	31901	31906	100 %	0 %	0 %	0 %	384527614
589	NC_017060	GCC	2	6	31913	31918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527614
590	NC_017060	TCGG	2	8	31943	31950	0 %	25 %	50 %	25 %	384527614
591	NC_017060	GTC	2	6	31957	31962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527614
592	NC_017060	GC	3	6	31995	32000	0 %	0 %	50 %	50 %	384527614
593	NC_017060	TCAG	2	8	32058	32065	25 %	25 %	25 %	25 %	384527614
594	NC_017060	TGCG	2	8	32151	32158	0 %	25 %	50 %	25 %	384527614
595	NC_017060	A	6	6	32250	32255	100 %	0 %	0 %	0 %	384527614
596	NC_017060	TGA	2	6	32371	32376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527614
597	NC_017060	AGCAC	2	10	32407	32416	40 %	0 %	20 %	40 %	384527614
598	NC_017060	A	6	6	32417	32422	100 %	0 %	0 %	0 %	384527614
599	NC_017060	TC	3	6	32447	32452	0 %	50 %	0 %	50 %	384527615
600	NC_017060	GGC	2	6	32632	32637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527615
601	NC_017060	CCG	2	6	32639	32644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527615
602	NC_017060	ACG	2	6	32673	32678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527615
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607	NC_017060	TGG	2	6	33005	33010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527615
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609	NC_017060	GC	3	6	33159	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	384527615
610	NC_017060	GGC	3	9	33203	33211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527615
611	NC_017060	CGA	2	6	33259	33264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527615
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613	NC_017060	CCGG	2	8	33424	33431	0 %	0 %	50 %	50 %	384527615
614	NC_017060	GAAA	2	8	33517	33524	75 %	0 %	25 %	0 %	384527615
615	NC_017060	ATG	2	6	33557	33562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527615
616	NC_017060	CGG	2	6	33649	33654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527615
617	NC_017060	GC	3	6	34796	34801	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
618	NC_017060	GGC	2	6	34818	34823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527616
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620	NC_017060	ATGTC	2	10	34850	34859	20 %	40 %	20 %	20 %	384527616
621	NC_017060	CG	4	8	34887	34894	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
622	NC_017060	GC	3	6	34931	34936	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
623	NC_017060	GC	3	6	34967	34972	0 %	0 %	50 %	50 %	384527616
624	NC_017060	CT	3	6	35019	35024	0 %	50 %	0 %	50 %	384527616
625	NC_017060	AC	3	6	35098	35103	50 %	0 %	0 %	50 %	384527616
626	NC_017060	GCG	2	6	35107	35112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527616
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628	NC_017060	G	6	6	35250	35255	0 %	0 %	100 %	0 %	384527616
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